| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,025,601 | (T)5→4 | coding (1251/1401 nt) | xanQ → | xanthine:H(+) symporter XanQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,025,601 | 0 | T | . | 99.2% | 598.2 / ‑2.0 | 127 | coding (1251/1401 nt) | xanQ | xanthine:H(+) symporter XanQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base . (63/63); total (63/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
CGTTTGCGCAAAATAATGGGGTTATTCAGATGACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGAAATTTTTAAAATATTGCCAGCCTCTATTTATGTATTAGTTGAAAACCCTATTTGTGCTGGCGGGTTAACTGCGATTTTATTAAATATTATCCTCCCTGGTGGCTACCGACAGGAAAACGTTCTGCCTGGTATTACCTCAGCGGAAGAGATGGATTAACAGTAAAGGAGTCAATGATGTCAGGAGAACACACGTTAAAAGCGGTACGAGGCAGTTTTATTGATGTCACCCGTACGATCGATAACCCGGAAGAGATTGCCTCTGCGCTGCGGTTTATTGAGGATGGTTTATTACTCATTAAAC > NC_000913/3025312‑3025895 | cGTTTGCGCAAAATAATGGGGTTATTCAGATGACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCGTCTACTACGATCCCGAAATTTT‑AAAATATTGcc > 1:30106/1‑300 (MQ=255) 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CGTTTGCGCAAAATAATGGGGTTATTCAGATGACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGAAATTTTTAAAATATTGCCAGCCTCTATTTATGTATTAGTTGAAAACCCTATTTGTGCTGGCGGGTTAACTGCGATTTTATTAAATATTATCCTCCCTGGTGGCTACCGACAGGAAAACGTTCTGCCTGGTATTACCTCAGCGGAAGAGATGGATTAACAGTAAAGGAGTCAATGATGTCAGGAGAACACACGTTAAAAGCGGTACGAGGCAGTTTTATTGATGTCACCCGTACGATCGATAACCCGGAAGAGATTGCCTCTGCGCTGCGGTTTATTGAGGATGGTTTATTACTCATTAAAC > NC_000913/3025312‑3025895 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |