| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,405,758 | G→A | intergenic (‑7/‑221) | mcaS ← / → smrA | small regulatory RNA McaS/DNA endonuclease SmrA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,405,758 | 0 | G | A | 99.4% | 583.9 / NA | 173 | intergenic (‑7/‑221) | mcaS/smrA | small regulatory RNA McaS/DNA endonuclease SmrA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (98/74); minor base C (1/0); total (99/74) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
AGCAAACTGCCTGAAGAAATGGGCTGCGATCCCTTGCACGGACAGGGGCTGGTGATGTTGCCGGTTAGCGAAATTTTACCGAAAGCGGCCTATTATTTGATTCAGCGGCGTGATAGTCGCCAGACACCACTGACCGCGTCATTAATCACGCAATTCCGGCGAGAATGCGGCTATCTGCAAAGTTAAAACTGCATAAAAAAATAGAGTCTGTCGACATCCGCCAGACTCTACAGTACACACAGCAGTGCATCCGCGTCTTAAATCCGGCATTGTCTCCTCTGCGCCGGTGACTGTGTTATAACGGTTTTAACCTTTAGTTGCCAATTTTCTTCAGTGACAGATTTCACGAAAATATAAGTTACATTATTAATATCGTGAATGAATAATCATGCATAAGTATTTTGCTTAAAATATCGGCAATATTTGGAACTTATTACTGGAAATTTGGGTAATACGTTGTTGGACCGACCCGGTCTGGTTATCATATCGCGCTCTTAATTGCGGGAGGATGTAACATGAACCTTGACGACAAATCGCTGTTTCTTGACGCCATGGAAGATGTCCAGCCGCTGAAACGTGCTACCGATGT > NC_000913/1405464‑1406052 | gCAAACTGCCTGAAGAAATGGGCTGCGATCCCTTGCACGGACAGGGGCTGGTGATGTTGCCGGTTAGCGAAATTTTACCGAAAGCGGCCTATTATTTGATTCAGCGGCGTGATAGTCGCCAGACACCACTGACCGCGTCATTAATCACGCAATTCCGGCGAGAATGCGGCTATCTGCAAAGTTAAAACTGCATAAAAAAATAGAGTCTGTCGACATCCGCCAGACTCTACAGTACACACAGCAGTGCATCCGCGTCTTAAATCCGGCATTGTCTACTCTGCGCCGGTGACTGTATTATaa > 2:463210/1‑300 (MQ=255) 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tctcCTCTGCGCCGGTGACTGTATTANAACGGTTTTAATCTTTAGTTGCCAATTCTCTTCATTGACCGATTTCACGAAAATAGAAGTTACATTATTAATATCGTGAATGAATAGTCATGCATAAGCATTTTGCTTAAAATATCGGCAATATTTGGAACCTATTACTGTAAATTTGGTTAATACGTTGTTAgac < 2:368591/193‑1 (MQ=255) tctGCGCCGGTGACTGTATTATAACGGTTTTAACCTTTAGTTGCCAATTTTCTTCAGTGACAGATTTCACGAAAATATAAGTTACATTATTAATATCGTGAATGAATAATCATGCATAAGTATTTTGCTTAAAATATCGGCAATATTTGGAACTTATTACTGGAAATTTGGGTAATACGTTGTTGGACCGACCCGGTCTGGTTATCATATCGCGCTCTTAATTGCGGGAGGATGTAACATGAACCTTGACGACAAATCGCTGTTTCTTGACGCCATGGAAGATGTCCAGCCGCTGaaa < 1:463210/298‑1 (MQ=255) gttGACTGTATGATAACGGTTTTAACCTGGAGTGGCCAATTTTCTTTAGTGACATATTTCACGAAAATATAATTTACATTATTAATATCGTGAATGAATAATCATGCATAAGTATTTTGCTTAAAATATCTGCAATATTTGGAACTTATTACTGGAAATTTTGTTAATACGTTGTTGGACCTACCCGGTCTGGTTATCATATCGCGCTCTTAATTGCGGGAGGATGTAACAGGAACCTTGACGACAAATCGCTGTTTCTTGACGCCATGGAAGATGTCCAGCCGCTGAAACGTGCTACCg < 1:481575/298‑1 (MQ=255) 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AGCAAACTGCCTGAAGAAATGGGCTGCGATCCCTTGCACGGACAGGGGCTGGTGATGTTGCCGGTTAGCGAAATTTTACCGAAAGCGGCCTATTATTTGATTCAGCGGCGTGATAGTCGCCAGACACCACTGACCGCGTCATTAATCACGCAATTCCGGCGAGAATGCGGCTATCTGCAAAGTTAAAACTGCATAAAAAAATAGAGTCTGTCGACATCCGCCAGACTCTACAGTACACACAGCAGTGCATCCGCGTCTTAAATCCGGCATTGTCTCCTCTGCGCCGGTGACTGTGTTATAACGGTTTTAACCTTTAGTTGCCAATTTTCTTCAGTGACAGATTTCACGAAAATATAAGTTACATTATTAATATCGTGAATGAATAATCATGCATAAGTATTTTGCTTAAAATATCGGCAATATTTGGAACTTATTACTGGAAATTTGGGTAATACGTTGTTGGACCGACCCGGTCTGGTTATCATATCGCGCTCTTAATTGCGGGAGGATGTAACATGAACCTTGACGACAAATCGCTGTTTCTTGACGCCATGGAAGATGTCCAGCCGCTGAAACGTGCTACCGATGT > NC_000913/1405464‑1406052 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |