| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 4,635,268 | C→T | E15K (GAA→AAA) | rob ← | DNA‑binding transcriptional dual regulator Rob |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 4,635,268 | 0 | C | T | 98.9% | 645.3 / NA | 190 | E15K (GAA→AAA) | rob | DNA‑binding transcriptional dual regulator Rob |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); major base T (110/76); minor base G (0/2); total (112/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
AAAGGCGCTCCATTCAGGAGAACGGCGGTAAAGTGCAGGAGTCTGGGCAAACTGCTTCTTGAATGCGCGGGTAAATGTCTGTTGAGAGTCGAAGCGGTATTGCAGCGCGATG‑TCCAGAATCGGACGCGCAGTCAGGCGTAGTGCGACCGCCGATTTCGACAAACGACGAGCACGAATATACGCGCCAATAGCATGGCCAGTGACATCTTTAAACATTCTCTGTAAGTGCCACTTGGAATAACCTGCTTTCGCCGCTACATTGTCGAGCGACAGGGGCTGATCCAGATGACCTTCCAGCCAGATTAAAAGGTCGCGAATAATGCCGGCCTGATCCATAAAATATCCTCATCC‑TTTCAA‑CAACGAGCACCTGACAT‑CAGGTAATTGGATAATAGCATTTTTTGCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAATAAAAGTATTGAGATTTTGTTCTTAATCAATATGTTATTTACCGTGACGAACTAATTGCTCGTGTAATAGATAAAAATGGTAACAATATGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATA > NC_000913/4634975‑4635559 | aTTCAGGAGAACGGCGGTAAAGTGCAGGAGTCTGGGCAAACTGCTTCTTGAATGCGCGGGTAAATGTCTGTTGAGANTCGAAGCGGTATTGCAGCGCGATG‑TCCAGAATCGGACGCGCAGTCAGGCGTAGTGCGACCGCCGATTTCGACAAACGACGAGCACGAATATACGCGCCAATAGCATGGCCAGTGACATCTTTAAACATTCTCTGTAAGTGCCACTTGGAATAACCTGCTTTCGCCGCTACATTGTCGAGCGACAGGGGCTGATCCAGATGACCTTTCAGCCAGATTAAAAg < 1:835010/298‑1 (MQ=255) aTTCAGGAGAACGGCGGTAAAGTGCAGGAGTCTGGGCAAACTGCTTCTTGAATGCGCGGGTAAATGTCTGTTGAGAGTCGAAGCGGTATTGCAGCGCGATG‑TCCAGAATCGGACGCGCAGTCAGGCGTAGTGCGACCGCCGATTTCGACAAACGACGAGCACGAATATACGCGCCAATAGCATGGCCAGTGACATCTTTAAACATTCTCTGTAAGTGCCACTTGGAATAACCTGCTTTCGCCGCTACATTGTCGAGCGACAGGGGCTGATCCAGATGACCTTTCAGCCAGATTAAAAGGt > 2:961780/1‑300 (MQ=255) aTTCAGGAGAACGGCGGTAAAGTGCAGGAGTCTGGGCAAACTGCTTCTTGAATGCGCGGGTAAATGTCTGTTGAGAGTCGAAGCGGTATTGCAGCGCGATG‑TCCAGAATCGGACGCGCAGTCAGGCGTAGTGCGACCGCCGATTTCGACAAACGACGAGCACGAATATACGCGCCAATAGCATGGCCAGTGACATCTTTAAACATTCTCTGTAAGTGCCACTTGGAATAACCTGCTTTCGCCGCTACATTGTCGAGCGACAGGGGCTGATCCAGATGACCTTTCAGCCAGATTAAAAGGt > 1:203382/1‑300 (MQ=255) aTTCAGGAGAACGGCGGTAAAGTGCAGGAGTCTGGGCAAACTGCTTCTTGAATGCGCGGGTAAATGTCTGTTGAGAGTCGAAGCGGTATTGCAGCGCGATG‑TCCAGAATCGGACGCGCAGTCAGGCGTAGTGCGACCGCCGATTTCGACAAACGACGAGCACGAATATACGCGCCAATAGCATGGCCAGTGACATCTTTAAACATTCTCTGTAAGTGCCACTTGGAATAACCTGCTTTCGCCGCTACATTGTCGAGCGACAGGGGCTGATCCAGATGACCTTCCAGCCAGATCAAAAGGt > 2:1075060/1‑300 (MQ=255) 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gTAAAGTGCAGGAGTCTGGGCAAACTGCTTCTTGAATGCGCGGGTAAATGTCTGTTGAGAGTCGAAGCGGTATTGCAGCGCGATG‑TCCAGAATCGGACGCGCAGTCAGGCGTAGTGCGACCGCCGATTTCGACAAACGACGAGCACGAATATACGCGCCAATAGCATGGCCAGTGACATCTTTAAACATTCTCTGTAAGTGCCACTTGGAATAACCTGCTTTCGCCGCTACATTGTCGAGCGACAGGGGCTGATCCAGATGACCTTTCAGCCAGATTAAAAGGTCGCGAATAATGCCGGc > 1:763074/1‑300 (MQ=255) tAAAGTGCAGGAGTCTGGGCAAACTGCTTCTTGAATGCGCGGGTAAATGTCTGTTGAGAGTCGAAGCGGTATTGCAGCGCGATG‑TCCAGAATCGGACGCGCAGTCAGGCGTAGTGCGACCGCCGATTTCGACAAACGACGAGCACGAATATACGCGCCAATAGCATGGCCAGTGACATCTTTAAACATTCTCTGTAAGTGCCACTTGGAATAACCTGCTTTCGCCGCTACATTGTCGAGCGACAGGGGCTGATCCAGATGACCTTTCAGCCAGATTAAAAGGTCGCGAATAATGCCGGcc < 1:924877/300‑1 (MQ=255) gTGCAGGAGTCTGGGCAAACTGCTTCTTGAATGCGCGGGTAAATGTCTGTTGAGAGTCGAAGCGGTATTGCAGCGCGATG‑TCCAGAATCGGACGCGCAGTCAGGCGTAGTGCGACCGCCGATTTCGACAAACGACGAGCACGAATATACGCGCCAATAGCATGGCCAGTGACATCTTTAAACATTCTCTGTAAGTGCCACTTGGAATAACCTGCTTTCGCCGCTACATTGTCGAGCGACAGGGGCTGATCCAGATGACCTTTCAGCCAGATTAAAAGGTCGCGAATAATGCCGGCCTGAt > 2:274647/1‑300 (MQ=255) 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tCCAGATGACCTTTCAGCCAGATTAAAAGGTCGCGAATAATGCCGGCCTGATCCATAAAATATCCTCATCC‑TTTCAA‑CAACGAGCACCTTACAT‑CAGGTAATTGGATAATAGCATTTTTTGCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAATAAAAGTATTGAGATTTTGTTCTTAATCAATATGTTATTTACCGTGACGAACTAATTGCTCGTGTAATAGATAAAAATGGTAACAATATGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGcc < 1:503120/300‑1 (MQ=255) tCCAGATGACCTTTCAGCCAGATTAAAAGGTCGCGAATAATGCCGGCCTGATCCATAAAATATCCTCATCC‑TTTCAA‑CAACGAGCACCTGACAT‑CAGGTAATTGGATAATAGCATTTTTTGCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAATAAAAGTATTGAGATTTTGTTCTTAATCAATATGTTATTTACCGTGACGAACTAATTGCTCGTGTAATAGATAAAAATGGTAACAATATGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGcc < 2:667527/300‑1 (MQ=255) tGACCTTTCAGCCAGATGAAAAGGTCGCGAATAATGCCGGCCTGATCCATAAAATATCCTCATCC‑TTTCAA‑CAACGAGCACCTGACAT‑CAGGTAATTGGATAATAGCATTTTTTGCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAATAAAAGTATTGAGATTTTGTTCTTAATCAATATGTTATTTACCGTGACGAACTAATTGCTCGTGTAATAGATAAAAATGGTAACAATATGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATa < 2:109192/299‑1 (MQ=255) | AAAGGCGCTCCATTCAGGAGAACGGCGGTAAAGTGCAGGAGTCTGGGCAAACTGCTTCTTGAATGCGCGGGTAAATGTCTGTTGAGAGTCGAAGCGGTATTGCAGCGCGATG‑TCCAGAATCGGACGCGCAGTCAGGCGTAGTGCGACCGCCGATTTCGACAAACGACGAGCACGAATATACGCGCCAATAGCATGGCCAGTGACATCTTTAAACATTCTCTGTAAGTGCCACTTGGAATAACCTGCTTTCGCCGCTACATTGTCGAGCGACAGGGGCTGATCCAGATGACCTTCCAGCCAGATTAAAAGGTCGCGAATAATGCCGGCCTGATCCATAAAATATCCTCATCC‑TTTCAA‑CAACGAGCACCTGACAT‑CAGGTAATTGGATAATAGCATTTTTTGCTGTTTTAGCATTCAGTGTTTTTTTCTTAGTAGAGTATGTTTTAGGGCTTGACGGAAATAAAAGTATTGAGATTTTGTTCTTAATCAATATGTTATTTACCGTGACGAACTAATTGCTCGTGTAATAGATAAAAATGGTAACAATATGAAATACAAGCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATA > NC_000913/4634975‑4635559 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |