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catcGGTACCGAGCATCACGAATCCCGTCGTATCGATAACCAGTTGCGCGGTCGTTCTGGTCGTCAGGGGGATGCTGGTTCTTCCCGTTTCTACCTGTCGATGGAAGATGCGCTGATGCGTATTTTTGCTTCCGACCGAGTATCCGGCATGATGCGTAAACTGGGTATGAAGCCAGGCGAAGCCATTGAACACCCGTGGGTGACTAAAGCGATTGCCAACGCCCAGCGTAAAGTTGAAAGCCGTAACTTCGACATTCGTAAGCAACTGCTGGAATATGATGACGTGGCTAACGATCa > 1:606775/1‑297 (MQ=255) atcGGTACCAAGCATCACGAATCCCGTCGTATCGATAACCAGTTGCGCGGTCGTTCTGGTCGTCAGGGGGATGCTGGTTCTTCCCGTTTCTACCTGTCGATGGAAGATGCGCTGATGCGTATTTTTGCTTCCGACCGAGTATCCGGCATGATGCGTAAACTGGGTATGAAGCCAGGCGAAGCCATTGAACACCCGTGGGTGACTAAAGCGATTGCCAACGCCCAGCGTAAAGTTGAAAGCCGTAACTTCGACATTCGTAAGCAACTGCTGGAATATGATGACGTGGCTAACGATCAGCGt < 1:375866/300‑1 (MQ=255) gTACCGAGCATCACGAATCCCGTCGTATCGATAACCAGTTGCGCGGTCGTTCTGGTCGTCAGGGGGATGCTGGTTCTTCCCGTTTCTACCTGTCGATGGAAGATGCGCTGATGCGTATTTTTGCTTCCGACCGAGTATCCGGCATGATGCGTAAACTGGGTATGAAGCCAGGCGAAGCCATTGAACACCCGTGGGTGACTAAAGCGATTGCCAACGCCCAGNGTAAAGTTGAAAGCCGTAACTTCGACATTCGTAAGCAACTGCTGGAATATGATGACGTGGCTAACGATCAGCGTcgc > 1:833979/1‑299 (MQ=255) gTACCGAGCATCACGAATCCCGTCGTATCGATAACCAGTTGCGCGGTCGTTCTGGTCGTCAGGGGGATGCTGGTTCTTCCCGTTTCTACCTGTCGATGGAAGATGCGCTGATGCGTATTTTTGCTTCCGACCGAGTATCCGGCATGATGCGTAAACTGGGTATGAAGCCAGGCGAAGCCATTGAACACCCGTGGGTGACTAAAGCGATTGCCAACGCCCAGCGTAAAGTTGAAAGCCGTAACTTCGACATTCGTAAGCAACTGCTGGAATATGATGACGTGGCTAACGATCAGCGTcgc > 1:28503/1‑299 (MQ=255) tACCGAGCATCACGAATCCCGTCGTATCGATAACCAGTTGCTCGGTCGTTCTGGTCGTCATGTGGATGCTGGTTCTTCCCGTTTCTACCTGTCGATGGAAGATGCGCTGATGCGTATTTTTGCTTCCGACCGANTATCCGGCATGATGCGTAAACTGGGTATGAAGCCAGGCGAAGCCATTGAACACCCGTGGGTGACTAAAGCGATTGCCAACGCCCAGCGTAAAGTTGAAAGCCGTAACTTCGACATTCGTAAGCAACTGCTGGAATATGATGACGTGGCTAACGATCAGCGTCgcgc < 2:360365/300‑1 (MQ=255) tACCGAGCATCACGAAGCCCGTCGTATCGATAACCATTTGCGCGGTCGTTCTGGTCTTCAGGTGGATGCTGGTTCTTCCCGTTTCTACCTGTCGATGGAAGATGCGCTGATGCGTATTTTTGCTTCCTACCGAGTATCCTGCATGAGGCGTAAACTGGGTACGAAGCCAGGCGAAGCCATTGAACACCCGTGGGTGACTAAAGCGATTGCCAACGCCTAGCGTAAAGTTGAAAGCCGTAACTTCGACATTCGTAAGCAACTGCTGGAATATGATGACGTGGCTAACGATCAGCGTCgcgc < 2:668637/300‑1 (MQ=255) | GAGCTGGTGTCAAACGAACTGACCAAAGCCGGTATTAAGCACAACGTCCTGAACGCCAAATTCCACGCCAACGAAGCGGCGATTGTTGCTCAGGCAGGTTATCCGGCTGCGGTGACTATCGCGACCAATATGGCGGGTCGTGGTACAGATATTGTGCTCGGTGGTAGCTGGCAGGCAGAAGTTGCCGCGCTGGAAAATCCGACCGCAGAGCAAATTGAAAAAATTAAAGCCGACTGGCAGGTACGTCACGATGCGGTACTGGAAGCAGGTGGCCTGCATATCATCGGTACCGAGCGTCACGAATCCCGTCGTATCGATAACCAGTTGCGCGGTCGTTCTGGTCGTCAGGGGGATGCTGGTTCTTCCCGTTTCTACCTGTCGATGGAAGATGCGCTGATGCGTATTTTTGCTTCCGACCGAGTATCCGGCATGATGCGTAAACTGGGTATGAAGCCAGGCGAAGCCATTGAACACCCGTGGGTGACTAAAGCGATTGCCAACGCCCAGCGTAAAGTTGAAAGCCGTAACTTCGACATTCGTAAGCAACTGCTGGAATATGATGACGTGGCTAACGATCAGCGTCGCGC > NC_000913/109665‑110251 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |