| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3138533 = | 178 (1.240) | intergenic (‑11/‑194) | gss/yghU | fused glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase/disulfide reductase/organic hydroperoxide reductase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
GTCATTAACCACTTCTCGCAGGAAGCGCAGCGAGAAAATCTCCCACGCCATACCCACGTCAGTAAAGACCACACCGTAATTCAGAAAGAGAAAACGGCGAGCAAATTCAACGCATTGCCACTTGTGGCCCATATATTCGTCGTCGATATAGCTACGGAATACGGCGTCATCTTCGTATTCCTGCGGATCGAGAGAACTGTAATCTGAAGAGTAGATTGCTACCCCACCTGGGGCGTAGCCCAATAATGTCCCGAACGGGGCATCCTGGCTGGTCGTTCCTTTGCTCATCACTTTACCTTTAACAATACAACCTAAGCAGTTGGCGTAATTGTTGTGCTCTGATTACCTGCTCAGCGACATTAACCGGACAGAGGTCAGACTAATCATACACCTCATCGCAGCGGCTGGCGCAAAGGGTTAAAAAATTCACATTCTGTACAGCAAGTGACCTGCTACACTGCTTCAACACTACCACTCAGAAGGCAACTCACTATGACAGACAATACTTATCAGCCCGCGAAAGTCTGGACGTGGGATAAATCCGCTGGCGGCGCGTTCGCCAATATCAATCGCCCGGTTTCTGGTCCGACGCAT > NC_000913/3138235‑3138828 | gtCATTAACCACTTCTCGCAGGAAGCGCAGCGAGAAAATCTCCCACGCCATACCCACGTCAGTAAAGACCACACCGTAATTCAGAAAGAGAAAACGGCGAGCAAATTCAACGCATTGCCACTTGTGGCCCATATATTCGTCGTCGATATAGCTACGGAATACGGCGTCATCTTCGTATTCCTGCGGATCGAGAGAACTGTAATCTGAAGAGTAGATTGCTACCCCACCTGGGGCGTAGCCCAATAATGTCCCGAACGGGGCATCCTGGCTGGTCGTTCCTTTGCTCATCACTTTACCttt > 1:481242/1‑300 (MQ=255) 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gcttattcgcaccttccttAACAATACAACCTAAGCAGGTGGCGTAATTGTTGTGCTCTGATTACCTGCTCAGCGACATTAACCGGACAGAGGTCAGACTAATCATACACCTCATCGCAGCGGCTGGCGCAAAGGGTTAAAAAATTCACATTCTGTACAGCAAGTGACCTGCTACACTGCTTCAACACTACCACTCAGAAGGCAACTCACTATGACAGACAATACTTATCAGCCCGCGAAAGTCTGGACGTGGGATAAATCCGCTGGCGGCGCGTTCGCCAATATCAATCGCCCGGTTTc < 2:536873/283‑1 (MQ=255) ttcgcaccttccttAACAATACAACCTAAGCAGTTGGCGTAATTGTTGTGCTCTGATTACCTGCTCAGCGACATTAACCGGACAGAGGTCAGACTAATCATACACCTCATCGCAGCGGCTGGCGCAAAGGGTTAAAAAATTCACATTCTGTACAGCAAGTGACCTGCTACACTGCTTCAACACTACCACTCAGAAGGCAACTCACTATGACAGACAATACTTATCAGCCCGCGAAAGTCTGGACGTGGGATAAATCCGATGGCGGCGCGTTCGCCAATATCAATCGCCCGGTTTCTGGTc > 1:595002/13‑300 (MQ=255) atcaCTTTACCTTTAACAATACAACCTAAGCAGTTGGCGTAATTGTTGTGCTCTGATTACCTGCTCAGCGACATTAACCGGACAGAGGTCAGACTAATCATACACCTCATCGCAGCGGCTGGCGCAAAGGGTTAAAAAATTCACATTCTGTACAGCAAGTGACCTGCTACACTGCTTCAACACTACCACTCAGAAGGCAACTCACTATGACAGACAATACTTATCAGCCCGCGAAAGTCTGGACGTGGGATAAATCCGCTGGCGGCGCGTTCGCCAATATCAATCGCCCGGTTTCTGGTc < 2:684625/300‑1 (MQ=255) gcaccttccttAACAATACAACCTAAGCAGTTGGCGTAATTGTTGTGCTCTGATTACCTGCTCAGCGACATTAACCGGACAGAGGTCAGACTAATCATACACCTCATCGCAGCGGCTGGCGCAAAGGGTTAAAAAATTCACATTCTGTACAGCAAGTGACCTGCTACACTGCTTCAACACTACCACTCAGAAGGCAACTCACTATGACAGACAATACTTATCAGCCCGCGAAAGTCTGGACGTGGGATAAATCCGCTGGCGGCGCGTTCGCCAATATCAATCGCCCGGTTTCTGGTCCGa < 2:1147071/291‑1 (MQ=255) aCCTTTAACAATACAACCTCAGCAGTTGGCGTAATTGTTGTGCTCTGATTACCTGCTCAGCGACATTAACCGGACAGAGGTCAGACTAATCATACACCTCATCGCAGCGGCTGGCGCAAAGGGTTAAAAAATTCACATTCTGTACAGCAAGTGACCTGCTACACTGCTTCAACACTACCACTCAGAAGGCAACTCACTATGACAGACAATACTTATCAGCCCGCGACAGTCTGGACGTGGGATAAATCCGCTGGCGGCGCGTTCGCCACTACTAATCGCCCGGTTTCTTGTCCGAc > 2:145245/1‑296 (MQ=255) aCCTTTAACAATACAACCTAAGCAGTTGGCGTAATTGTTGTGCTCTGATTACCTGCTCAGCGACATTAACCGGACAGAGGTCAGACTAATCATACACCTCATCGCAGCGGCTGGCGCAAAGGGTTAAAAAATTCACATTCTGTACAGCAAGTGACCTGCTACACTGCTTCAACACTACCACTCAGAAGGCAACTCACTATGACAGACAATACTTATCAGCCCGCGAAAGTCTGGACGTGGGATAAATCCGCTGGCGGCGCGTTCGCCAATATCAATCGCCCGGTTTCTGGTCCGACGCAt > 1:78057/1‑300 (MQ=255) | GTCATTAACCACTTCTCGCAGGAAGCGCAGCGAGAAAATCTCCCACGCCATACCCACGTCAGTAAAGACCACACCGTAATTCAGAAAGAGAAAACGGCGAGCAAATTCAACGCATTGCCACTTGTGGCCCATATATTCGTCGTCGATATAGCTACGGAATACGGCGTCATCTTCGTATTCCTGCGGATCGAGAGAACTGTAATCTGAAGAGTAGATTGCTACCCCACCTGGGGCGTAGCCCAATAATGTCCCGAACGGGGCATCCTGGCTGGTCGTTCCTTTGCTCATCACTTTACCTTTAACAATACAACCTAAGCAGTTGGCGTAATTGTTGTGCTCTGATTACCTGCTCAGCGACATTAACCGGACAGAGGTCAGACTAATCATACACCTCATCGCAGCGGCTGGCGCAAAGGGTTAAAAAATTCACATTCTGTACAGCAAGTGACCTGCTACACTGCTTCAACACTACCACTCAGAAGGCAACTCACTATGACAGACAATACTTATCAGCCCGCGAAAGTCTGGACGTGGGATAAATCCGCTGGCGGCGCGTTCGCCAATATCAATCGCCCGGTTTCTGGTCCGACGCAT > NC_000913/3138235‑3138828 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |