| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 59 (0.410) | 41/590 | 2.1 | 32.2% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2699682 | 124 (0.870) | coding (20/261 nt) | yfhL | putative 4Fe‑4S cluster‑containing protein YfhL | |||||
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
TGGCGATTACCGGCTTTACTCCGAATGCCCTGC‑AACAGCGTGCTTCTCATTGCCTGTATACCATTGCCGAAGAACAAGCGACAAACAGTGCTTCAATCTCTGCTTGTCACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGAACTGGCACCAGAACGTATTCGTCATAGTGAAGCGCTGGTGAAAAAACTGGTCTGAGTAAAGAATGCGCGTATAATGCCCGCCCGGTTTGTGTTGTTTTGAGAGTTTCCTTATGGCGTTGTTAATCACTAAAAAATGCATCAATTGTGATATGTGTGAACCCGAATGCCCGAATGAGGCGATTTCAATGGGAGATCATATCTACGAGATTAACAGCGATAAGTGTACCGAATGCGTAGGGCACTACGAGACACCAACCTGCCAGAAGGTGTGCCCGATCCCCAATACTATTGTGAAAGATCCGGCGCATGTCGAGACAGAAGAACAGTTGTGGGATAAATTTGTGCTGATGCACCACGCGGATAAAATTTAATATTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCAT > NC_000913/2699387‑2699978 | tGGCGATTACCGGCTTTACTCCGAATGCCCTGC‑AACAGCGTGCTTCTCATTGCCTGTATACCATTGCCGAAGAACAAGCGACAAACAGTGCTTCAATCTCTGCTTGTCACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGAACTGGCACCAGAACGTATTCGTCATAGTGAAGCGCTGGTGAAAAAACTGGTCTGAGTAAAGAATGCGCGTATAATGCCCGCCCGGTTTGTGTTGTTTTGAGAGTTTCCTTATGGCGTTGTTAATCACTAAgga > 1:1147421‑M2/1‑296 (MQ=255) gCTTTACTCCGAATGCCCTGC‑AACAGCGTGCTTCTCATTGCCTGTATACCATTGCCGAAGAACAAGCGACAAACAGTGCTTCAATCTCTGCTTGTCACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGAACTGGCACCAGAACGTATTCGTCATAGTGAAGCGCTGGTGAAAAAACTGGTCTGAGTAAAGAATGCGCGTATAATGCACGCCCGGTTTGTGTTGTTTTGAGAGTTTCCTTATGGCGTTATTAATCACTAAggaaggtgcgaacaa < 2:289015‑M2/299‑16 (MQ=255) tCCGAATGCCCTGC‑AATAGCGTGCTTCTCATTGCCTGTATACCATTGCCTAAGAACAAGCGACAAACAGTGCTTCAATCTCTGCTTGTCACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGAACTGGCACCAGAACGTATTCGTCATAGTGAAGCGCTGGTGAAAAAACTGGTCTGAGTAAAGAATGCGCGTATAATGCCCGCCCGGTTTGTGTTGTTTTGAGAGTTTCCTTATGGCGTTGTTAATCACTAAAAAATGCATCAATTGTGATAtg < 1:93348/299‑1 (MQ=255) ccGAATGCCCTGC‑AACAGCGTGCTTCTCATTGCCTGTATACCATTGCCGAAGAACAAGCGACAAACAGTGCTTCAATCTCTGCTTGTCACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGAACTGGCACCAGAACGTATTCGTCATAGTGAAGCGCTGGTGAAAAAACTGGTCTGAGTAAAGAATGCGCGTATAATGCCCGCCCGGTTTGTGTTGTTTTGAGAGTTTCCTTATGGCGTTGTTAATCACTAAggacggtgcgaacaaatccctgat < 2:344208‑M2/300‑25 (MQ=255) gaaggCCCTGCCAACAGCGTGCTTCTCATTGCCTGTATACCATTGCCGAAGAACAAGCGACAAACAGTGCTTCAATCTCTGCTTGTCACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGAACTGGCACCAGAACGTATTCGTCATAGTGAAGCGCTGGTGAAAAAACTGGTCTGAGTAAAGAATGCGCGTATAATGCCCGCCCGGTTTGTGTTGTTTTGAGAGTTTCCTTATGGCGTTGTTAATCACTAAAAAATGCATCAATTGTGata < 1:410301/291‑1 (MQ=255) tgccTGC‑AACAGCGTGCTTCTCATTGCCTGTATACCATTGCCGAAGAACAAGCGACAAACAGTGCTTCAATCTCTGCTTGTCACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGAACTGGCACCAGAACGTATTCGTCATAGTGAAGCGCTGGTGAAAAAACTGGTCTGAGTAAAGAATGCGCGTATAATGCCCGCCCGGTTTGTGTTGTTTTGAGAGTTTCCTTATGGCGTTGTTAATCACTAAAAAATGCATCAATTGTGATATGTGTGAAcc < 1:1000927/298‑1 (MQ=255) gCCCTGC‑AACAGCGTGCTTCTCATTGCCTGTATACCATTGCCGAAGAACAAGCGACAAACAGTGCTTCAATCTCTGCTTGTCACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGAACTGGCACCAGAACGTATTCGTCATAGTTAAGCGCTGGTGAAAAAACTGGTCTGAGTAAAGAATGCGCGTATAATGCCCGCCCGGTTTGTGTTGTTTTGAGAGTTTCCTTATGGCGTTGTTAATCACTAAAAAATGCATCAATTGTGATATGTGTGAAcc < 2:1054700/300‑1 (MQ=255) 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gttAATCACTAAggaaggtgcgaacaagtccatgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagattttcttgtccagcatggagcagattctgccatggcaaaacatggtggaagtcatcgagccgttttaccccaaggctggtaatggccggcgaccttatccgctggaaaccatgctaagcattcactgcatgcagcattggtacaacct < 2:503880‑M2/295‑284 (MQ=255) aTCACTAAAAAATGCATCAATTGTGATATGTGTGAACCCGAATGCCCGAATTAGGCGATTTCAATGGTAGATCATATCTACGAGATTAACAGCGATAAGTGTACCGAATGCGTAGGGCACTACGAGACACCAACCTGCCAGAAGGTGTGCCCGATCCCCAATACTATTGTGAAAGATCCGGCGCATGTCGAGACAGAAGAACAGTTGTGGGATAAATTTGTGCTGATGCACCACGCGGATAAAATTTAATATTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACg < 2:709007/300‑1 (MQ=255) aTCACTAAAAAATGCATCAATTGTGATATGTGTGAACCCGAATGCCCGAATGAGGCGATTTCAATGGGAGATCATATCTACGAGATTAACAGCGATAAGTGTACCGAATGCGTAGGGCACTACGAGACACCAACCTGCCAGAAGGTGTGCCCGATCCCCAATACTATTGTGAAAGATCCGGCGCATGTCGAGACAGAAGAACAGTTGTGGGATAAATTTGTGCTGATGCACCACGCGGATAAAATTTAATATTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACg < 1:900023/300‑1 (MQ=255) | TGGCGATTACCGGCTTTACTCCGAATGCCCTGC‑AACAGCGTGCTTCTCATTGCCTGTATACCATTGCCGAAGAACAAGCGACAAACAGTGCTTCAATCTCTGCTTGTCACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGAACTGGCACCAGAACGTATTCGTCATAGTGAAGCGCTGGTGAAAAAACTGGTCTGAGTAAAGAATGCGCGTATAATGCCCGCCCGGTTTGTGTTGTTTTGAGAGTTTCCTTATGGCGTTGTTAATCACTAAAAAATGCATCAATTGTGATATGTGTGAACCCGAATGCCCGAATGAGGCGATTTCAATGGGAGATCATATCTACGAGATTAACAGCGATAAGTGTACCGAATGCGTAGGGCACTACGAGACACCAACCTGCCAGAAGGTGTGCCCGATCCCCAATACTATTGTGAAAGATCCGGCGCATGTCGAGACAGAAGAACAGTTGTGGGATAAATTTGTGCTGATGCACCACGCGGATAAAATTTAATATTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCAT > NC_000913/2699387‑2699978 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |