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gCTTCTTCCCCTAGCTGGAACTCTTTCGGGTAAAGCCGCTGGATATCCCACAGCAACGGGTTGGGCAGCAACACGTTTTGCTGAAAGCGTTTAATCGCAAACTGGCAATGGTCAGTTAGCGAGATATAAATACTGTCCTGTAATTTTCCCAAGCGCTCCTGCGCTAAAGAGATAATACGATCACAGGTTGCCATCACCTCAAGAGGAATATGACTTAAGAGTTCGCTTAATCGCCCGTTCAGTTCATGACTGCTCAAGGCATACTCTTTTTCTATTCCACTTGAGTTAATTCTTTCGcc < 1:783532/299‑1 (MQ=255) cgcaccttcccTAGCTGGAACTCTTTCGGGTAAAGCCGCTGGATATCCCACAGCAACGGGTTGGGCAGCAACACGTTTTGCTGAAAGCGTTTAATCGCAAACTGGCAATGGTCAGTTAGCGAGATATAAATACTGTCCTGTAATTTTCCCAAGCGCTCCTGCGCTANAGAGATAATACGATCACAGGTTGCCATCACCTCAAGAGGAATATGACTTAAGAGTTCGCTTAATCGCCCGTTCAGTTCATGACTGCTCAAGGc > 2:389529/9‑260 (MQ=255) cgcaccttcccTAGCTGGAACTCTTTCGGGTAAAGCCGCTGGATATCCCACAGCAACGGGTTGGGCAGCAACACGTTTTGCTGAAAGCGTTTAATCGCAAACTGGCAATGGTCAGTTAGCGAGATATAAATACTGTCCTGTAATTTTCCCAAGCGCTCCTGCGCTAAAGAGATAATACGATCACAGGTTGCCATCACCTCAAGAGGAATATGACTTAAGAGTTCGCTTAATCGCCCGTTCAGTTCATGACTGCTCAAGGc > 2:952172/9‑260 (MQ=255) cgcaccttcccTAGCTGGAACTCTTTCGGGTAAAGCCGCTGGATATCCCACAGCAACGGGTTGGGCAGCAACACGTTTTGCTGAAAGCGTTTAATCGCAAACTGGCAATGGTCAGTTAGCGAGATATAAATACTGTCCTGTAATTTTCCCAAGCGCTCCTGCGCTAAAGAGATAATACGATCACAGGTTGCCATCACCTCAAGAGGAATATGACTTAAGAGTTCGCTTAATCGCCCGTTCAGTTCATGACTGCTCAAGGc < 1:952172/252‑1 (MQ=255) cgcaccttcccTAGCTGGAACTCTTTCGGGTAAAGCCGCTGGATATCCCACAGCAACGGGTTGGGCAGCAACACGTTTTGCTGAAAGCGTTTAATCGCAAACTGGCAATGGTCAGTTAGCGAGATATAAATACTGTCCTGTAATTTTCCCAAGCGCTCCTGCGCTAAAGAGATAATACGATCACAGGTTGCCATCACCTCAAGAGGAATATGACTTAAGAGTTCGCTTAATCGCCCGTTCAGTTCATGACTGCTCAAGGc < 1:389529/252‑1 (MQ=255) ttcCCCTAGCTGGAACTCTTTCGGGTAAAGCCGCTGGATATCCCACAGCAACGGGTTGGGCAGCAACACGTTTTGCTGAAAGCGTTTAATCGCAAACTGGCAATGGTCAGTTAGCGAGATATAAATACTGTCCTGTAATTTTCCCAAGCGCTCCTGCGCTAAAGAGATAATACGATCACAGGTTGCCATCACCTCAAGAGGAATATGACTTAAGAGTTCGCTTAATCGCCCGTTCAGTTCATGACTGCTCAAGGCATACTCTTTTTCTATTCCAATTGAGTTAATTCTTTCGCCAgcgc > 2:600208/1‑299 (MQ=255) | TACTGCTTGTTGTAATGATTCATCACTATCGTTAATTGAAGCATGTTCAAGAATACGCCAGGATAAAAACTTCAGATGTGTAACCAGTCGCTGATAACTCAAGCTTTCTTCCTGGTAATTAAGGCTGAACTGAAATTTTATTAATTGCAGCATTTCGCGCATTAACTGCGTGACACCTGCAACATCCTCCATATTTCCGCTCATTTGGGCACTGACCAGATGCATGGCAATAAAGCCCACTTCATCTTTCGGTAACTGCACGCCCAACCGTTTATCAATAATGGTTAACGCTTCTTCCCCTAGCTGGAACTCTTTCGGGTAAAGCCGCTGGATATCCCACAGCAACGGGTTGGGCAGCAACACGTTTTGCTGAAAGCGTTTAATCGCAAACTGGCAATGGTCAGTTAGCGAGATATAAATACTGTCCTGTAATTTTCCCAAGCGCTCCTGCGCTAAAGAGATAATACGATCACAGGTTGCCATCACCTCAAGAGGAATATGACTTAAGAGTTCGCTTAATCGCCCGTTCAGTTCATGACTGCTCAAGGCATACTCTTTTTCTATTCCACTTGAGTTAATTCTTTCGCCAGCGC > NC_000913/3905869‑3906461 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |