| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 2699679 = | 124 (0.870) | coding (17/261 nt) | yfhL | putative 4Fe‑4S cluster‑containing protein YfhL | |||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
AAAGTGCTGGCGATTACCGGCTTTACTCCGAATGCCCTGC‑AACAGCGTGCTTCTCATTGCCTGTATACCATTGCCGAAGAACAAGCGACAAACAGTGCTTCAATCTCTGCTTGTCACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGAACTGGCACCAGAACGTATTCGTCATAGTGAAGCGCTGGTGAAAAAACTGGTCTGAGTAAAGAATGCGCGTATAATGCCCGCCCGGTTTGTGTTGTTTTGAGAGTTTCCTTATGGCGTTGTTAATCACTAAAAAATGCATCAATTGTGATATGTGTGAACCCGAATGCCCGAATGAGGCGATTTCAATGGGAGATCATATCTACGAGATTAACAGCGATAAGTGTACCGAATGCGTAGGGCACTACGAGACACCAACCTGCCAGAAGGTGTGCCCGATCCCCAATACTATTGTGAAAGATCCGGCGCATGTCGAGACAGAAGAACAGTTGTGGGATAAATTTGTGCTGATGCACCACGCGGATAAAATTTAATATTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCAT > NC_000913/2699380‑2699978 | tGGCGATTACCGGCTTTACTCCGAATGCCCTGC‑AACAGCGTGCTTCTCATTGCCTGTATACCATTGCCGAAGAACAAGCGACAAACAGTGCTTCAATCTCTGCTTGTCACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGAACTGGCACCAGAACGTATTCGTCATAGTGAAGCGCTGGTGAAAAAACTGGTCTGAGTAAAGAATGCGCGTATAATGCCCGCCCGGTTTGTGTTGTTTTGAGAGTTTCCTTATGGCGTTGTTAATCACTAAgga > 1:1147421‑M2/1‑296 (MQ=255) 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ttccCTAAAAAATGCATCAATTGTGATATGTGTGAACCCGAATGCCCGAATGAGGCGATTTCAATGGTAGATCATATCTACGAGATTAACAGCGATAAGTGTACCGAATGCGTAGGGCACTACGAGACACCAACCTGCCAGAAGGTGTGCCCGATCCCCAATACTATTGTGAAAGATCCGGCGCATGTCGAGACAGAAGAACAGTTGTGGGATAAATTTGTGCTGATGCACCACGCGGATAAAATTTAATATTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGTAAGCCTTAACg < 1:997326‑M2/296‑1 (MQ=255) aTCACTAAAAAATGCATCAATTGTGATATGTGTGAACCCGAATGCCCGAATTAGGCGATTTCAATGGTAGATCATATCTACGAGATTAACAGCGATAAGTGTACCGAATGCGTAGGGCACTACGAGACACCAACCTGCCAGAAGGTGTGCCCGATCCCCAATACTATTGTGAAAGATCCGGCGCATGTCGAGACAGAAGAACAGTTGTGGGATAAATTTGTGCTGATGCACCACGCGGATAAAATTTAATATTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACg < 2:709007/300‑1 (MQ=255) aTCACTAAAAAATGCATCAATTGTGATATGTGTGAACCCGAATGCCCGAATGAGGCGATTTCAATGGGAGATCATATCTACGAGATTAACAGCGATAAGTGTACCGAATGCGTAGGGCACTACGAGACACCAACCTGCCAGAAGGTGTGCCCGATCCCCAATACTATTGTGAAAGATCCGGCGCATGTCGAGACAGAAGAACAGTTGTGGGATAAATTTGTGCTGATGCACCACGCGGATAAAATTTAATATTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACg < 1:900023/300‑1 (MQ=255) | AAAGTGCTGGCGATTACCGGCTTTACTCCGAATGCCCTGC‑AACAGCGTGCTTCTCATTGCCTGTATACCATTGCCGAAGAACAAGCGACAAACAGTGCTTCAATCTCTGCTTGTCACGCTCAGGGAATGTTAACGGATTTGCTGTTCATTGCGCTGATTCAGCAGGATCTGGAACTGGCACCAGAACGTATTCGTCATAGTGAAGCGCTGGTGAAAAAACTGGTCTGAGTAAAGAATGCGCGTATAATGCCCGCCCGGTTTGTGTTGTTTTGAGAGTTTCCTTATGGCGTTGTTAATCACTAAAAAATGCATCAATTGTGATATGTGTGAACCCGAATGCCCGAATGAGGCGATTTCAATGGGAGATCATATCTACGAGATTAACAGCGATAAGTGTACCGAATGCGTAGGGCACTACGAGACACCAACCTGCCAGAAGGTGTGCCCGATCCCCAATACTATTGTGAAAGATCCGGCGCATGTCGAGACAGAAGAACAGTTGTGGGATAAATTTGTGCTGATGCACCACGCGGATAAAATTTAATATTCTACTCTGGAAGTAGAGTATTAATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCAT > NC_000913/2699380‑2699978 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |