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Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
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acGATTCGACGTTTGCTATCGCTACCTGCAACAACCACTTCTGTCGTTACACCTTTGACGGGCGAAGAAAACAGATGACGGGTGTCAACATTATACGTTAACTGACCACAATGCTGTTGAGGTTGACCATTAACCATAGCCATACTGCATGTTGGGGGACTGATCCTGCCATTAATCGCTAATGTGGCAGTCTCTGAAGAGAATGCGGGAGAAGCCAATCCATAGGCAAGAAAAATAATTCCTGACAGCCAATACTTATTCATTGAACGTTATCCCTGTAGTAAAGGTTATGCCTGGAt < 1:1016179/299‑1 (MQ=255) tgttcgcaccttcccTATCGCTACCTGCAACAACCACTTCTGTCGTTACACCTTTGACGGGCGAAGAAAACAGATGACGGGTGTCAACATTATACGTTAACTGACCACAATGCTGTTGAGGTTGACCATTAACCATAGCCATACTGCATGTTGGGGGACTGATCCTGCCATTAATCGCTAATGTGGCAGTCTCTGAAGAGAATGCGGGAGAAGCCAATCCATAGGCAAGAAAAATAATTCCTGACAGCCAATACTTATTCATTGAACGTTATCCCTGTAGTAAAGGTTATGCCTGGATa > 1:81446/15‑299 (MQ=255) cGATTCGACGTTTGCTATCGCTACCTGCAACAACCACTTCTGTCGTTACACCTTTGACGGGCGAAGAAAACAGATGACGGGTGTCAACATTATACGTTAACTGACCACAATGCTGTTGAGGTTGACCATTAACCATAGCCATACTGCATGTTGGGGGACTGATCCTGCCATTAATCGCTAATGTGGCAGTCTCTGAAGAGAATGCGGGAGAAGCCAATCCATAGGCAAGAAAAATAATTCCTGACAGCCAATACTTCTTCCTTGAACGTTATCCATGTAGTCGAGGTTATGCATGGATa > 2:352398/1‑299 (MQ=255) gttcgcaccttcccTATCGCTACCTGCAACAACCACTTCTGTCGTTACACCTTTGACGGGCGAAGAAAACAGATGACGGGTGTCAACATTATACGTTAACTGACCACAATGCTGTTGAGGTTGACCATTAACCATAGCCATACTGCATGTTGGGGGACTGATCCTGCCATTAATCGCTAATGTGGCAGTCTCTGAAGAGAATGCGGGAGAAGCCAATCCATNGGCAAGAAAAATAATTCCTGACAGCCAATACTTATTCATTGAACGTTATCCCTGTAGTAAAGGTTATGCCTGGATAGa > 1:231943/14‑300 (MQ=255) tCGACGTTTGCTATCGCTACCTGCAACAACCACTTCTGTCGCTACACCTTTGACGGGCGAAGAAAACAGATGACGGGTGTCAACATTATACGTTAACTGACCACAATGCTGTTGAGTTTGACCATTAACCATAGCCATACTGCATGTTGGGGGACTGATCCTGCCATTAATCGCTAATGTGGCAGTCTCTTAAGAGAATGCGGGAGAAGCCAATCCATAGGCAAGAAAAATAATTCCTGACAGCCAATACTTATTCATTGAACGTTATCCCTGTAGTAAAGGTTATGCCTGGATAGAATg < 2:274364/300‑1 (MQ=255) cccTATCGCTACCTGCAACAACCACTTCTGTCGTTACACCTTTGACGGGCGAAGAAAACAGATGACGGGTGTCAACATTATACGTTAACTGACCACAATGCTGTTGAGGTTGACCATTAACCATAGCCATAATGCATGTTGGGGGACTGATCCTGCCATTAATCGCTAATGTGGCAGTCTCTGAAGAGAATGCGGGAGAAGCAAATCCATAGGCAAGAAAAATAATTCCTGACAGCCAATATTTATTCATTGAACGTTATCCATGTAGTCAAGGTTATGACTGGATAGAATGAGTGCATa > 2:92896/3‑300 (MQ=255) | GTTGTTAAGAGTCTGTATCTCTTGGAAACAAATTTCTCACATCAAAAAAGTTGCCGCAATGTAAACACATTGTTTTATTGATTTAAAACAAATTAACCATTGCAATATAAATACAAAAAATATTTAAGAGTATTAACTATTTATCGCATCTATCAATTAATGTAGATTTATGTAAATGGTATTGTTGATATCAATAAAAAAGCCGAAATCATTTATATAAATGATTTCGGCTTTCTAAATGCAATTAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGCTATCGCTACCTGCAACAACCACTTCTGTCGTTACACCTTTGACGGGCGAAGAAAACAGATGACGGGTGTCAACATTATACGTTAACTGACCACAATGCTGTTGAGGTTGACCATTAACCATAGCCATACTGCATGTTGGGGGACTGATCCTGCCATTAATCGCTAATGTGGCAGTCTCTGAAGAGAATGCGGGAGAAGCCAATCCATAGGCAAGAAAAATAATTCCTGACAGCCAATACTTATTCATTGAACGTTATCCCTGTAGTAAAGGTTATGCCTGGATAGAATGAGTGCATA > NC_000913/2192252‑2192846 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |