| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3284802 | 162 (1.130) | 119 (0.830) | 65/590 | 0.6 | 45.0% | coding (118/804 nt) | agaC | galactosamine‑specific PTS enzyme IIC component |
| ? | NC_000913 | = 3285900 | 129 (0.900) | coding (423/792 nt) | agaD | galactosamine‑specific PTS enzyme IID component | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TCGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATGACCAGGATCTCACGGACTTACGTTTTATTAAACAACGTGGCGTGAATGTTTTCATTCAGGACGTCCCTGGCGATCAAAAAGAACAAATCCCTGACTAAATCTAAAATCGCCTTAATATTGGTTTGAGGTAATAAAAATGCATGAAATAACCCTACTTCAGGGATTATCCCTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3284506‑3284802‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTAAACGGCGAAAAATAGAATCGGCCCCAGCAGGTTTCCCTGGCTGGCAAATGATGAGCAAATTCCCGCCATAATCGGCAACAAAGTAAACCAGAAAATCGCATCGCCAATCCCGGCGATTGGGCCAAACAGTGCCACTTTGAGGCCTTTAATGGTGTCGCGGTTTTCTCCTTTTTCTTCCATCGAAATTAATAACCCCATCAGGAATCCGACCAGATTCGGGTGGGTATTAATAAATTCGAGGTTATCTTTCATCGCCGCGCTTAAGCCCGGTTTGTCGTCCTTATAAATCTT < NC_000913/3285900‑3285607 TCGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATGACCAGGATCTCACGGACTTACGTTTTATTAAACAACGTGGCGTGAATGTTTTCATTCAGGACGTCCCTGGCGATCAAAAAGAACAAATCCCTGACTAAATCTAAAATCGCCTTAATATTGGTTTGAGGTAATAAAAATGCATGAAATAACCCTACTTCAGGGATTATCCCTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAAGTA < 1:388593/300‑1 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ACCCTAAGTAAACGGCGAAAAATAGAATCGGCCCCAGCAGGTTTCCCTGGCTGGCAAATGATGAGCAAATTCCCGCCATAATCGGCAACAAAGTAAACCAGAAAATCGCATCGCCAATCCCGGCGATTGGGCCAAACAGTGCCACTTTGAGGCCTTTAATGGTGTCGCGGTTTTCTCCTTTTTCTTCCATCGAAATTAATAACCCCATCAGGAATCCGACCAGATTCGGGTGGGTATTAATAAATTCGAGGTTATCTTTCATCGCCGCGCTTAAGCCCGGTTTGTCGTCCTTATAAATCT > 1:332524/1‑300 CCCTAAGTAAACGGCGAAAAATAGAATCGGCCCCAGCAGGTTTCCCTGGCTGGCAAATGATGAGCAAATTCCCGCCATAATCGGCAACAAAGTAAACCAGAAAATCGCATCGCCAATCAAGGCGATTGGGCAAAACAGTGCCACTTTGAGGCCTTTAATGGTGTCGCGGTTTTCTCATTTTTCTTCCATCGAAATTAATAACCCCATCAGGAATCCGACCAGATTCGGGTGGGTATTAATAAATTCGAGGTTATCTTTCATCGCAGCGCTTAAGCCCGGTTTGTCGTCTTTATAAATCTT > 2:225951/1‑300 TCGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATGACCAGGATCTCACGGACTTACGTTTTATTAAACAACGTGGCGTGAATGTTTTCATTCAGGACGTCCCTGGCGATCAAAAAGAACAAATCCCTGACTAAATCTAAAATCGCCTTAATATTGGTTTGAGGTAATAAAAATGCATGAAATAACCCTACTTCAGGGATTATCCCTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3284506‑3284802‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTAAACGGCGAAAAATAGAATCGGCCCCAGCAGGTTTCCCTGGCTGGCAAATGATGAGCAAATTCCCGCCATAATCGGCAACAAAGTAAACCAGAAAATCGCATCGCCAATCCCGGCGATTGGGCCAAACAGTGCCACTTTGAGGCCTTTAATGGTGTCGCGGTTTTCTCCTTTTTCTTCCATCGAAATTAATAACCCCATCAGGAATCCGACCAGATTCGGGTGGGTATTAATAAATTCGAGGTTATCTTTCATCGCCGCGCTTAAGCCCGGTTTGTCGTCCTTATAAATCTT < NC_000913/3285900‑3285607 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |