| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,263,159 | IS5 (+) +4 bp | coding (499‑502/1209 nt) | tdcD ← | propionate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2288919 = | NA (NA) | 215 (1.510) | 104/588 | 0.0 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3263159 = | 0 (0.000) | coding (502/1209 nt) | tdcD | propionate kinase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 185 (1.290) | 104/590 | 0.0 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3263162 | 0 (0.000) | coding (499/1209 nt) | tdcD | propionate kinase | |||||
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289826‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGGTGTACGCCGTTATGGTTTCCACGGCACGTCGCACCGCTATGTTTCCCAGCGCGCACATTCGCTGCTGAATCTGGCGGAAGATGACTCCGGCCTGGTTGTGGCGCATCTTGGCAATGGCGCGTCAATCTGCGCGGTTCGCAACGGTCAGAGTGTTGATACCTCAATGGGAATGACGCCGCTGGAAGGCTTGATGATGGGTACCCGCAGTGGCGATGTCGACTTTGGTGCGATGTCCTGGGTCGCCAGCCAAACCAACCAGAGCCTGGGTGACCTGGAACGCGTAGTGAATAAA < NC_000913/3263162‑3262866 CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTNGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCAAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTGTACGC > 2:906689/1‑300 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TTCCTTAGGTGTACGCCGTTATGGTTTCCACGGCACGTCGCACCGCTATGTTTCCCAGCGCGCACATTCGCTGCTGAATCTGGCGGAAGATGACTCCGGCCTGGTTGTGGCGCATCTTGGCAATGGCGCGTCAATCTGCGCGGTTCGCAACGGTCAGAGTGTTGATACCTCAATGGGAATGACGCCGCTGGAAGGCTTGATGATGGGTACCCGCAGTGGCGATGTCGACTTTGGTGCGATGTCCTGGGTCGCCAGCCAAACCAACCAGAGCCTGGG < 1:1117468/276‑1 TTCCTTAGGTGTACGCCGTTATGGTTTCCACGGCACGTCGCACCGCTATGTTTCCCAGCGCGCACATTCGCTGCTGAATCTGGCGGAAGATGACTCCGGCCTGGTTGTGGCGCATCTTGGCAATGGCGCGTCAATCTGCGCGGTTCGCAACGGTCAGAGTGTTGATACCTCAATGGGAATGACGCCGCTGGAAGGCTTGATGATGGGTACCCGCAGTGGCGATGTCGACTTTGGTGCGATGTCCTGGGTCGCCAGCAAAACCAACCAGAGCCTGGGTGACCTGGAACGCGTAGTGAATAA > 2:610746/1‑300 TTCCTTAGGTGTACGCCGTTATGGTTTCCACGGCACGTCGCACCGCTATGTTTCCCAGCGCGCACATTCGCTGCTGAATCTGGCGGAAGATGACTCCGGCCTGGTTGTGGCGCATCTTGGCAATGGCGCGTCAATCTGCGCGGTTCGCAACGGTCAGAGTGTTGATACCTAAATGGGAATGACGCCTCTGGAAGGCTTGATGATGGGTACCCGCAGTGGCGNTGTCGACTTTGGTGTGATGTCCTGGGTCGCCAGACAAACCAACCAGAGCCTGGGTGACCTGGAACGCGTAGTGAATAA > 1:835839/1‑300 TTCCTTAGGTGTACGCCGTTATGGTTTCCACGGCACGTCGCACCGCTATGTTTCCCAGCGCGCACATTCGCTGCTGAATCTGGCGGAAGATGACTCCGGCCTGGTTGTGGCGCATCTTGGCAATGGCGCGTCAATCTGCGCGGTTCGCAACGGTCAGAGTGTTGATACCTAAATGGGAATGACGCCGCTGGAAGGCTTGATGATGGGTACCCGCAGTGGCGATGTCGACTTTGGTGCGATGTCCTGGGTCGCCAGCCAAACCAACCAGAGCCTGGGTGACCTGGAACGCGTAGTGAATAA > 1:346965/1‑300 TTCCTTAGGTGTACGCCGTTATGGTTTCCACGGCACGTCGCACCGCTATGTTTCCCAGCGCGCACATTCGCTGCTGAATCTGGCGGAAGATGACTCCGGCCTGGTTGTGGCG < 2:1104886/112‑1 CCTTAGGTGTACGCCGTTATGGTTTCCACGGCACGTCGCACCGCTATGTTTCCCAGCGCGCACATTCGCTGCTGAATCTGGCGGAAGATGACTCCGGCCTGGTTGTGGCGCATCTTGGCAATGGCGCGTCAATCTGCGCGGTTCGCAACGGTCAGAGTGTTGATACCTAAATGGGAATGACGCCGCTGGAAGGCTTGATGATGGGTACCGGCAGTGGCGATGTCGACTTTGGTGCGATGTCCTGGGTCGCCAGCCAAACCAACCAGAGCCTGGGTGACCTGGAACGCGTAGTGAATAAA > 2:733294/1‑299 CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289826‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGGTGTACGCCGTTATGGTTTCCACGGCACGTCGCACCGCTATGTTTCCCAGCGCGCACATTCGCTGCTGAATCTGGCGGAAGATGACTCCGGCCTGGTTGTGGCGCATCTTGGCAATGGCGCGTCAATCTGCGCGGTTCGCAACGGTCAGAGTGTTGATACCTCAATGGGAATGACGCCGCTGGAAGGCTTGATGATGGGTACCCGCAGTGGCGATGTCGACTTTGGTGCGATGTCCTGGGTCGCCAGCCAAACCAACCAGAGCCTGGGTGACCTGGAACGCGTAGTGAATAAA < NC_000913/3263162‑3262866 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |