| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 4,449,586 | 0 | G | A | 77.3% | 191.5 / 51.6 | 88 | P23S (CCG→TCG) | ppa | inorganic pyrophosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (13/7); new base A (44/24); total (57/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATGTGATCGTATTCTTTGCTCAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAATAACAACGTAGATGTCTTCCGGCAGATCTTTACCCGCAGGGACGTTGAGTAAGCTCATGTCTGTTTCCTTTAAAAATATGTGGCAAACAAGTGCCGAGTATTATAGCCAACTCGCGCCGAATGTCTTCGCTTGTTTTCGTCTTCATTTTCCTTTTTCACCAGTTTTAAGACGGTATACAGAGCAGGAAAATCCATAACCGTAGCCGCATTTTTCATAGTGAGATGAAAGCGATTACAAACTTGTGATTAACGTTTTATTTACTTTTTTGAAGTGTGATGTAACGC > NC_000913/4449291‑4449879 | aTGTGATCGTATTCTTTGCTCAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGAGAtc < 1:513691/300‑1 (MQ=255) aTCGTATTCTTTGCTCAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGAGATCTCAAt > 1:590488/1‑300 (MQ=255) tATTCTTTGCTCAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAGCCGGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGAAACACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTGGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTTCGCCGCCCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGAGATCTCAATaac < 2:18232/299‑1 (MQ=255) tATTCTTTGCGCAGCTTGCTGTGAGGAACCGCAACCAGTTTCCCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGGGATCTCAATaac < 2:89725/299‑1 (MQ=255) aTTCTTTGCTCAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGAGATCTCAATaacaa < 1:486486/300‑1 (MQ=255) tCAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCTGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGAGATCTCAATAACAACGTAGATg < 1:590118/299‑1 (MQ=255) tCAGCTTGCTGTGCGGAACCGCAACCAGTTTCGCATCTTCACCGGCTTCGTCGGTCATTTTCAGAACGCCAACCGGACGGCAACGGATCACAGAACCCGGCTGCAGCGGGTACGGAGTTGGGACCAGTACGTCAACCGGGTCACCGTCCAGAGACAGGGTGTGGTTGATGTAACCGTAGTTGCATGGATAGAACATCGCGGTGGACATGAAGCGGTCAACGAACAGTGCGCCGCTCTCTTTGTCGATTTCGTATTTGATCGGATCTGCGTTAGCCGAGATCTCAATAACAACGTAGATg < 2:125626/299‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |