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aaCGCTTCAGCATCACTAACTCCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactattttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgcc > 1:7120‑M2/1‑23 (MQ=255) gcggcaaatccaACTCCACCGTTATGCTTCACAAATATAAACCAGGAAAATAATTAACCTTGA‑‑AAGTCTAAGTTATGCTTTCCTGGCCCAAATTTAGATAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGAACCGTTATACATCGCGTCTTTTACCAGTGCAGCGCCTGCCATCGTGCCCTGGTTAGAAAACTGAGTACTCTCAACGCTGATGTGCTGACTATACGCAGTAAGGGCCTGCTGACGGATGCTGTCTGAGATGACCGGGAag < 2:202070‑M2/288‑1 (MQ=255) gggcaaatccaACTCCACCGTTATGCTTCACAAATATAAACCATGAAAATAATTAACCTTGA‑‑AAGTCTAAGTTATGCTTTCCTGGCCCAAATTGAGATAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTNACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGAACCGTTATACATCGCGTCTTTTACCAGTGCAGCGCCTGCCATCGTGCCCTGGTTAGAAAACTGAGTACTCTCAACGCTGATGTGCTGACTATACGCAGGAAGGGCCTGCTGACGGATGCTGTCTGAGATGACCGGGAag < 2:228931‑M2/288‑1 (MQ=255) gCATCACTAACTCCACCGTTATGCTTCACAAATATAAACCAGGAAAATAATTAACCTTGA‑‑AAGTCTAAGTTATGCTTTCATGGCACAAATTGAGATAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGAACCGTTATACATCGCGTCTTTTACCAGTGCAGCGCCTGCAATCGTGCACTGGTTAGAAAACTGAGTACTCTCAACGCTGATGTGCTGACTATACGCAGGAAGGGCATGCTGACGGATGCTGTCTGAGATGACCGGGa > 2:183262/1‑295 (MQ=255) tCACTAACTCCACCGTTATGCTTCACAAATATAAACCAGGAAAATAATTAACCTTGA‑‑AAGTCTAAGTTATGCTTTCCTGGCCCAAATTGAGATAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGAACCGTTATACATCGCGTCTTTTACCAGTGCAGCGCCTGCCATCGTGCCCTGGTTAGAAAACTGAGTACTCTCAACGCTGATGTGCTGACTATACGCAGGAAGGGCCTGCTGACGGATGCTGTCTGAGATGACCGGGAAGAGGata > 1:182832/1‑300 (MQ=255) aCTAACTCCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccggagaacaggt > 1:583694‑M2/1‑9 (MQ=255) | GTTTGAAATGAGGGTGTAATTGATTGGGCAACTGTGCGCCACGCTACTTTCTTCTTCGCTTAACGCGATAGGATTAACTGCTTCATAAG‑‑GCAGTTCGATGGTTG‑A‑AACACT‑‑CTGCAACACCAGGGCATCTTTATTACGCAGCCCTTCGGGTGTCTCTTTGCTCCCCTTCGCTACGGGTTTATA‑TCCCGCAACCGTTTTTCCCTGGGAGGCTAACGCTTGTAGCAATGCGCGGGAAACCACCGTTTTCCCTACAGAAGTGTCTGTACCGGTAATAAAGAAACGCTTCAGCATCACTAACTCCACCGTTATGCTTCACAAATATAAACCAGGAAAATAATTAACCTTGA‑‑AAGTCTAAGTTATGCTTTCCTGGCCCAAATTGAGATAGCGCAAATTTTGGTAGAACAGTTAAAAAATGTTAACCCTGCAACAGACGAATCAACAAAGAACCGTTATACATCGCGTCTTTTACCAGTGCAGCGCCTGCCATCGTGCCCTGGTTAGAAAACTGAGTACTCTCAACGCTGATGTGCTGACTATACGCAGGAAGGGCCTGCTGACGGATGCTGTCTGAGATGACCGGGAAGAGGATAT > NC_000913/1666929‑1667519 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |