| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 2130698 | 22 (0.240) | coding (181/1218 nt) | wcaD | colanic acid polymerase | |||||
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ATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTGGCGCGGGACTCACGGCGTTTAACTATCTGTTTGGTCAGTCGCTGGATGCCAGTAAATACGTCACTTCAACTATGCTGTTTGTCTATATTGTGATCATTATTGGCATGGTGTGGAGTATTCGTTTTAAAACAATTTCGCCACACAACCATCGCAAGATATTACGTTTCTGTTATCTGGGGGTCGGGCTGGTGGTGGCGCTGGCGGCGGTGGAGATGGCACAAATTATCCTCACCGGTGGCAGCAGTATTAagg < 1:752253/300‑4 TTAATTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTGGCGCGGGACTCACGGCGTTTAACTATCTGTTTGGTCAGTCGCTGGATGCCAGTAAATACGTCACTTCAACTATGCTGTTTGTCTATATTGTGATCATTATTGGCATGGTGTGGAGTATTCGTTTTAAAACAATTTCGCCACACAACCATCGCAAGATATTACGTTTCTTTTATCTGGGGGTCGGGCTGGTGGTGGCGCTGGCGGCGGTGGAGATGGCACAAATTACCCTCACCGGTGGCAGCAGTATTATGGAG < 1:28681/300‑1 TTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAATTGGCGCGGGACTCACTGCGTTTAACTATCTGTTTGGTCAGTCGCTGGATGCCAGTAAATACGTCACTTCAACTATGCTGTTTGTCTATATTGTGATCATTATTGGCATGGTGTGGAGTATTCGTTTTAAAACAATTTCGCCACACAACCATCGCAAGATATTACGTTTCTTTTATCTGGTGGTCGGGCTGGTGGTGGCGCTGGCGGCGGTGGAGATGGCACAAATTATCCTCACCGGTGGCAGCAGTATTATGGAG < 1:28816/300‑1 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GTCTAATTGGCGCGGGACTCACGGCGTTTAACTATCTGTTTGGTCAGTCGCTGGATGCCAGTAAATACGTCACTTCAACTATGCTGTTTGTCTATATTGTGATCATTATTGGCATGGTGTGGAGTATTCGTTTTAAAACAATTTCGCCACACAACCATCGCAAGATATTACGTTTCTTTTATCTGGTGGTCGGGCTGGTGGTGGCGCTGGCGGCGGTGGAGATGGCACAAATTATCCTCACCGGTGGCAGCAGTATTATGGAGTCGATTTCGAAATATCTGATTTACAGCAACAGCTAT > 2:677752/1‑299 TCTAATTGGCGCGGGACTCACGGCGTTTAACTATCTGTTTGGTAAGTCGCTGGATGCCAGTAAATACGTCACTTCAACTATGCTGTTTGTCTATATTGTGATCATTATTGGCATGGTGTGGAGTATTCGTTTTAAAACAATTTCGCCACACAACCATCGCAAGATATTACGTTTCTTTTATCTGGTGGTCGGGCTGGTGGTGGCGCTGGCGGCGGTGGAGATGGCACAAATTATCCTCACCGGTGGCAGCAGTATTATGGAGTCGATTTCGAAATATCTGATTTACAGCAACAGCTATGT < 1:287470/300‑1 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NC_000913/2069975‑2070271‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTGGCGCGGGACTCACGGCGTTTAACTATCTGTTTGGTCAGTCGCTGGATGCCAGTAAATACGTCACTTCAACTATGCTGTTTGTCTATATTGTGATCATTATTGGCATGGTGTGGAGTATTCGTTTTAAAACAATTTCGCCACACAACCATCGCAAGATATTACGTTTCTTTTATCTGGTGGTCGGGCTGGTGGTGGCGCTGGCGGCGGTGGAGATGGCACAAATTATCCTCACCGGTGGCAGCAGTATTATGGAGTCGATTTCGAAATATCTGATTTACAGCAACAGCTATGT < NC_000913/2130698‑2130403 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |