| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 4,427,822 | 0 | C | A | 35.9% | 170.2 / 12.0 | 106 | intergenic (‑400/+257) | yjfZ/ytfB | DUF2686 domain‑containing protein YjfZ/cell division protein YtfB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (26/42); new base A (38/0); total (64/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.09e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GTGAAAGATATTAATATCAAAAATCGCTCATTATGGAT‑ATAACGATGCACCCGGG‑GAGAAAATG‑ACTTCCACGCCTTACACCGTACATTCTTGTTGTGCGGTATGTAATTATTCTACGCTGTCGGTATCGGTGTATTCGTTAATCAGCAGGTTAGCCAGCCACAAAAAGCCATTGAGAAAATTATTGATTTTACATGGGATTATTATATTGCTAATCCTTGGTTTTTAAAAATTGTGCATAGTGAAAATCAAAGTAAAGGTGTGCATTATGCAAAATCACAGCGTCTCTTAGAAATTAACC‑ATGCGCACTTGCAGTTAATGGAATCCTTATTGGATGAAGGGAAGAAACACAATATTTTTAAGCCAGATATCGACCCATTGCAGGTGAATATTAATATTGCTGCGCTTGGCGGATATTATTTGATCAACCAGCATACGCTTGGCCTGGTTTATCACATCAGTATGGTTTCACCCCAGGCACTGGAAGCCAGACGTAAGGTCATCAAAGAGACAATCCTTAGCTGGCTTTTGGTTGACCCTTCATCTACCGCGCACGAATAAAACTGCCATCCGGCTGGCGGGTGAAC > NC_000913/4427535‑4428121 | gTGAAAGATATTAATATCAAAAATCGCTCATTATGGAT‑ATAACGATGTACCCGGG‑GAGAAAATG‑CCTTCCACGCCTTACACCGTACATTCTTGTTGTGCGGTATGTAATTATTCTACGCTGTCGGTATCGGTGTATTCGTTAATCAGCAGGTTAGCCAGCCACAAAAAGCCATTGAGAAAATTATTGATTTTACATGGGATTACTATATTGCTCATCCTTGGTTTTTAAAAATTGTGCATAGTGAAAATTAAAATAAAGGTGTGCATTATGCAAAATCACAGCGGCTATTCGAAATTaa > 2:84111/1‑299 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |