| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,464,205 | IS150 (–) +3 bp | coding (667‑669/951 nt) | paaX → | DNA‑binding transcriptional repressor PaaX |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1464207 | 0 (0.000) | 101 (1.010) | 55/590 | 0.5 | 100% | coding (669/951 nt) | paaX | DNA‑binding transcriptional repressor PaaX |
| ? | NC_000913 | = 3722075 | NA (NA) | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
TAATCGATCGCGTAATAAAATCTATTATTATTTTTGTGAAGAATAAATTTGGGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATCA > NC_000913/3720337‑3720930 | taatCGATCGCGTAATAAAATCTATTATTATTTTTGTGAAGAATAAATTTGGGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTC‑AACGAGTATGTAc < 1:303378/300‑1 (MQ=255) 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accgtctatctgataaattggcataacgcctcctgttcaatattcaagccgccaaaacgttgaaaatacaggcttcccggcgcaggcagttcaccgaccgaggtttcacctttttcactaacgaacgctaaagcagcaggcgctacgcgctgataaatgttgatacacagctgacgcgccgtatgccctgcccagtgtgccggaagcaactcctccggcaacaatgggtctttaaggacgacacggcgataaaaatggatcagtaaaagctgaatatgaaatgcccgctcTGTACTGCAc < 1:526923‑M2/10‑1 (MQ=255) gcgTAATAAAGTCTATTATTATTTTTGTGAAGAATAAATTTAGGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGGCTCTTAATCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATACCTCTCCTGTTTAATCTGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAACTCACTATTAACGAAAATAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCATAATGTGTTGATTTCCCACGAGTATGTACTGCACCCa > 2:422545/1‑300 (MQ=255) tatctgataaattggcataacgcctcctgttcaatattcaagccgccaaaacgttgaaaatacaggcttcccggcgcaggcagttcaccgaccgaggtttcacctttttcactaacgaacgctaaagcagcaggcgctacgcgctgataaatgttgatacacagctgacgcgccgtatgccctgcccagtgtgccggaagcaactcctccggcaacaatgggtctttaaggacgacacggcgataaaaatggatcagtaaaagctgaatatgaaatgcccgctcTGTACTGCACCCAtt < 1:790726‑M2/15‑1 (MQ=255) 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aGTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCACTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCATTAAt > 1:216786/1‑300 (MQ=255) aGTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCATAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCCCAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTTCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGACAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTACATTAAt > 1:645995/1‑300 (MQ=255) aGTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCATAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTAGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAAGATATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGTTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACAt > 2:170426/1‑290 (MQ=255) gTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGTTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATc < 1:400925/300‑1 (MQ=255) tcTGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATc < 2:734927‑M2/297‑1 (MQ=255) tcTGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATc < 1:781221‑M2/297‑1 (MQ=255) | TAATCGATCGCGTAATAAAATCTATTATTATTTTTGTGAAGAATAAATTTGGGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATCA > NC_000913/3720337‑3720930 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |