| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
GCTGAGTGTTACCTTCAGGAATGGTGATCACCTGATTCTGACCAACCAGGCGACTCCCGTCGGTTGGCAGAGGATAAGTTACCGCAGAGGCGGTACTGCAAAAGCCGACAACAGCGAAGGCCGCTGCGAATAATGTTTTCAATTTCATATTCATGTTAAGCGAGATTTTGTGCCTGGCAGGCCATTGGGTTGAGAATATTAGAGTATTGGAAGCGCATTATAAGTTCATTCCAGCTCACAGTGAAATCAGATGTGTACGAAATCACATTTTTTGCCTTTGGCTTGAGTGTAGACCTTAAGCGAGGAGCAGGATCTTCTTTCAGACTTATGGCATAATGCGCGGTTTGTCATATCTCTTTTCAGGATACGCCTGTGTTAGTTTCCAGTAACGTCACCATGCAGTTCGGCAGTAAGCCGTTGTTTGAAAACATTTCCGTCAAATTTGGCGGCGGCAACCGTTACGGCCTGATTGGCGCGAACGGTAGTGGTAAATCCACCTTTATGAAGATCCTCGGCGGCGACCTTGAGCCGACGCTGGGTAACGTTTCCCTCGATCCCAACGAGCGCATTGGTAAACTGCGTCAGGATCAGTT > NC_000913/855591‑856183 | gCTGAGTGTTACCTTCAGGAATGGTGATCACCTGATTCTGACCAACCAGGCGACTCCCGTCGGTTGGCAGAGGATAAGTTACCGCAGAGGCGGTACTGCAAAAGCCGACAACAGCGAAGGCCGCTGCGAATAATGTTTTCAATTTCATATTCATGTTAAGCGAGATTTTGTGCCTGGCAGGCCATTGGGTTGAGAATATTAGAGTATTGGAAGCGCATTATAAGTTCATTCCAGCTCACAGTGAAATCAGATGTGTACGAAATCACATTTTTTGCCTTTGGCTTGAGTGTAGACCTTAAg < 2:546801/300‑1 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gaacaatctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctgtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgaggtagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcaatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAGCg < 2:166253‑M2/4‑1 (MQ=255) aacaaccggttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattacctacgccagagaaataactggctggctgctacaccaggttgccgggcaacgagggagaccgccatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtgttacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcactgatttaattgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAGCg < 2:163175‑M2/4‑1 (MQ=255) gtgtTACCTTCAGGAATGGTGATCACCTGATTCTGACCAACCAGGCGACTCCCGTCGGTTGGCAGAGGATAAGTTACCGCAGAGGCGGTACTGCAAAAGCCGACAACAGCGAAGGCCGCTGCGAATAATGTTTTCAATTTCATATTCATGTTAAGCGAGATTTTGTGCCTGGCAGGCCATTGGGTTGAGAATATTAGAGTATTGGAAGCGCATTATAAGTTCATTCCAGCTCACAGTGAAATCAGATGTGTACGAAATCACATTTTTTGCCTTTGGCTTGAGTGTAGACCTTAAGCGAt < 1:6516‑M2/299‑2 (MQ=255) aCCTGATTCTGACCAACCAGGCGACTCCCGTCGGTTGGCAGAGGATAAGTTACCGCAGAGGCGGTACTGCAAAAGCCGACAACAGCGAAGGCCGCTGCGAATAATGTTTTCAATTTCATATTCATGTTAAGCGAGATTTTGTGCCTGGTAGGCTATTGGGTTGAGAATATTAGAGTATTGGAAGCGCATTATAAGTTCATTCCAGCTCACAGTGAAATCAGATGTGTACGAAATCACATTTTTTGCCTTTGGCTTGAGTGTAGACCTTAAGCGAGGAGCAGGATCTTCTTTCAGACTTAt > 1:327818/1‑300 (MQ=255) aTTCTGACCAACCAGGCGACTCCCGTCGGTTGGCAGAGGATAAGTTACCGCAGAGGCGGTACTGCAAAAGCCGACAACAGCGAAGGCCGCTGCGAATAGTGTTTTCAATTTCATATTCATGTTAAGCGAGATTTTGTGCCTGGCAGGCCATTGGGTTGAGAATATTAGAGTATTGGAAGCGCATTATAAGTTCATTCCAGCTCACAGTGAAATCAGATGTGTACGAAATCACATTTTTTGCCTTTGGCTTGAGTGTAGACCTTAAGCGAtggatttgcccatatacttccagacatttgt < 2:197191‑M2/300‑32 (MQ=255) aTTCTGACCAACCAGGCGACTCCCGTCGGTTGGCAGAGGATAAGTTACCGCAGAGGCGGTACTGCAAAAGCCGACAACAGCGAAGGCCGCTGCGAATAATGTTTTCAATTTCATATTCATGTTAAGCGAGATTTTGTGCCTGGCAGGCCATTGGGTTGAGAATATTAGAGTATTGGAAGCGCATTATAAGTTCATTCCAGCTCACAGTGGACTCAGATGTGTACGAAATCACATTTTTTGCCTTTGGCTTGAGTGTAGACCTTAAGCGAtggacttgcccctatatttccagacatttgt < 2:184705‑M2/300‑32 (MQ=255) 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ttGGCTGGAGTGTAGATCTTAAGCGAGGAGCAGGATCTTCTTACATACTTATGGCATAATGCGCGGTTTGTCATATCTCTTTTCAGGATACGCCTGTGTTAGTTTCCAGTAACGTCACCATGCAGTTCGGCAGTAAGCCGTTGTTTGAAAACATTTCCGTCAAATTTGGCGGCGGCAACCGTTACGGCCTGATTGGCGCGAACGGTAGTGGTAAATCCACCTTTATGAAGATCCTCGGCGGCGACCTTGAGCCGACGCTGGTTAACGTTTCCCTCGATCCCAACGAGCGCATTGGTAAAc < 1:623367/300‑1 (MQ=255) ggCTTGAGTGTAGACCTTAAGCGAtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtcccaac < 1:127450‑M2/300‑277 (MQ=255) gtgtAGACCTTAAGCGAGGAGCAGGATCTTCTTTCAGACTTATGGCATAATGCGCGGTTTGTCATATCTCTTTTCAGGATACGCCTGTGTTAGTTTCCAGTAACGTCACCATGCAGTTCGGCAGTAAGCCGTTGTTTGAAAACATTTCCGTCAAATTTGGCGGCGGCAACCGTTACGGCCTGATTGGCGCGAACGGTAGTGGTAAATCCACCTTTATGAAGATCATCGGCGGCGACCTTGAGCCGACGCTGGGTAACGTTTCCCTCGATCCCAACGAGCGCATTGGTAAACTGCGtaa > 2:122104/1‑296 (MQ=255) gtctaAGCGAGGAGCAGGATCTTCTTTCAGACTTATGGCATAATGCGCGGTTTGTCATATCTCTTTTCAGGATACGCCTGTGTTAGTTTCCAGTAACGTCACCATGCAGTTCGGCAGTAAGCCGTTGTTTGAAAACATTTCCGTCAAATTTGGCGGCGGCAACCGTTACGGCCTGATTGGCGCGAACGGTAGTGGTAAATCCACCTTTATGa > 1:635672‑M2/6‑212 (MQ=255) gtctaAGCGAGGAGCAGGATCTTCTTTCAGACTTATGGCATAATGCGCGGTTTGTCATATCTCTTTTCAGGATACGCCTGTGTTAGTTTCCAGTAACGTCACCATGCAGTTCGGCAGTAAGCCGTTGTTTGAAAACATTTCCGTCAAATTTGGCGGCGGCAACCGTTACGGCCTGATTGGCGCGAACGGTAGTGGTAAATCCACCTTTATGAAGATCCTCGGCGGCGACCTTGAGCCGACGCTGGGTAACGTTTCCCTAGATCCCAACGAGCGCATTGGTAAACTGCGTCAGGATCAGtt > 2:801548‑M2/6‑300 (MQ=255) gtctaAGCGAGGAGCAGGATCTTCTTTCAGACTTATGGCATAATGCGCGGTTTGTCATATCTCTTTTCAGGATACGCCTGTGTTAGTTTCCAGTAACGTCACCATGCAGTTCGGCAGTAAGCCGTTGTTTGAAAACATTTCCGTCAAATTTGGCGGCGGCAACCGTTACGGCCTGATTGGCGCGAACGGTAGTGGTAAATCCACCTTTATGAAGATCCTCGGCGGCGACCTTGAGCCGACGCTGGGTAACGTTTCCATAGATCCCAACGAGCGCATTGGTAAACTGCGTCAGGATCAGtt > 2:359955‑M2/6‑300 (MQ=255) | GCTGAGTGTTACCTTCAGGAATGGTGATCACCTGATTCTGACCAACCAGGCGACTCCCGTCGGTTGGCAGAGGATAAGTTACCGCAGAGGCGGTACTGCAAAAGCCGACAACAGCGAAGGCCGCTGCGAATAATGTTTTCAATTTCATATTCATGTTAAGCGAGATTTTGTGCCTGGCAGGCCATTGGGTTGAGAATATTAGAGTATTGGAAGCGCATTATAAGTTCATTCCAGCTCACAGTGAAATCAGATGTGTACGAAATCACATTTTTTGCCTTTGGCTTGAGTGTAGACCTTAAGCGAGGAGCAGGATCTTCTTTCAGACTTATGGCATAATGCGCGGTTTGTCATATCTCTTTTCAGGATACGCCTGTGTTAGTTTCCAGTAACGTCACCATGCAGTTCGGCAGTAAGCCGTTGTTTGAAAACATTTCCGTCAAATTTGGCGGCGGCAACCGTTACGGCCTGATTGGCGCGAACGGTAGTGGTAAATCCACCTTTATGAAGATCCTCGGCGGCGACCTTGAGCCGACGCTGGGTAACGTTTCCCTCGATCCCAACGAGCGCATTGGTAAACTGCGTCAGGATCAGTT > NC_000913/855591‑856183 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |