| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 3,931,505 | IS2 (+) +5 bp | coding (190‑194/1869 nt) | kup → | K(+):H(+) symporter Kup |
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| ? | NC_000913 | 4498181 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
GCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGCACACATTTCATATTTCAACGAAAGACTAGTCTATGAGCACTGATAATAAGCAATCATTGCCCGCGATTACCCTCGCGGCGATTGGAGTTGTCTACGGCGATATTGGTACCAGCCCGTTATATACACTTCGTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGGGGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTAT > NC_000913/3931211‑3931806 | gCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGCACACATTTCATATTTCAACGAAAGACTAGTCTATGAGCACTGATAATAAGCAATCATTGCCCGCGATTACCCTCGCGGCGATTGGAGTTGTCTACGGCGATATTGGTACCAGCCCGTTATATACACTTCGTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCt < 1:512939‑M1/300‑2 (MQ=255) 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GCCGCATTTAGGAGTACGATTTTGCCGTTAATCGTGCATACTGTGCGCTTTTTTGTGGGCCAAGGGACTAAGCACACATTTCATATTTCAACGAAAGACTAGTCTATGAGCACTGATAATAAGCAATCATTGCCCGCGATTACCCTCGCGGCGATTGGAGTTGTCTACGGCGATATTGGTACCAGCCCGTTATATACACTTCGTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGGGGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTAT > NC_000913/3931211‑3931806 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |