| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,594,860 | IS4 (–) +11 bp | coding (990‑1000/2016 nt) | tmcA ← | tRNA(Met) cytidine acetyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2594860 = | 16 (0.170) | 71 (0.710) | 51/588 | 0.6 | 81.0% | coding (1000/2016 nt) | tmcA | tRNA(Met) cytidine acetyltransferase |
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| * | ? | NC_000913 | = 2594870 | 17 (0.180) | 66 (0.670) | 49/584 | 0.7 | 79.1% | coding (990/2016 nt) | tmcA | tRNA(Met) cytidine acetyltransferase |
| ? | NC_000913 | 4502090 = | NA (NA) | noncoding (1426/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
TTGCGGGCGAGAAGTTTCGCTTTATTGCGCCGGATGCCTTGTTAGCCAGCGATGAGCAAGCCGACTGGCTGGTGGTCGATGAAGCCGCAGCCATACCTGCGCCATTGTTGCATCAACTGGTATCGCGTTTTCCTCGAACGTTGTTAACCACTACGGTGCAGGGCTACGAAGGCACCGGACGTGGTTTTTTGCTGAAATTTTGCGCTCGCTTTCCGCATTTACACCGTTTTGAACTGCAACAGCCGATCCGCTGGGCGCAGGGATGCCCGCTGGAAAAAATGGTCAGCGAGGCACt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2595153‑2594860‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTCTCGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGTAACGCTACGCAAGCGCCGTCTTCCCCTCGAAATGATGGTCTGGTGTATTGTTGGCATGGCGCTTGAGCGTAAAGAACCTCTTCACCA < NC_000913/4503515‑4503220 TTGCGGGCTAGAAGTTTCGCTTTATTGCGCCGGATGCCTTGTTAGCCAGCGATGAGCAAGCCGACTGGCTGGTGGTCGATGAAGCCGCAGCCATACCTGCGCCATTGTTGCATCAACTGGTATCGCGTTTTCCTCGAACGTTGTTAACCACTACGGTGCAGGGCTACGAAGGCACCGGACGTGGTTTTTTGCTGAAATTTTGCGCTCGCTTTCCGCATTTACACCGTTTTGAACTGCAACAGCCGATCCGCTGGGCGCAGGGATGCCCGCTGGAAAAAATGGTCAGCGAGGCACTAATGC < 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GCTCGCTTTCCGCATTTACACCGTTTTGAACTGCAACAGCCGATCCGCTGGGCGCAGGGATGCCCGCTGGAAAAAATGNTCAGCGAGGCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTCTCGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGT < 1:159401/300‑1 GCTCGCTTTCCGCATTTACACCGTTTTGAACTGCAACAGCCGATCCGCTGGGCGCAGGGATGCCCGCTGGAAAAAATGGTCAGCGAGGCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTCTCGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGT < 2:642972/300‑1 TCGCTTTCCGCATTTACACCGTTTTGAACTGCAACAGCCGATCCGCTGGGCGCAGGGATGCCCGCTGGAAAAAATGGTCAGCTAGGCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTCTCGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGTAA < 1:69687/300‑1 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GCAACAGCCGATCTGCTGGGCGCAGGGATGCCCGCTGGAAAAAATGTTCAGCTAGGCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTTGAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTCCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTCTTGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGTAACGCTACGCAAGCGCCGTCTTCCCC < 2:113854/294‑1 CCGCTGGGCGCAGGGATGCCCGCTGGAAAAAATGGTCAGCGAGGCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAATGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTCTCG > 1:87043/1‑232 CCGCTGGGCGCAGGGATGCCCGCTGGAAAAAATGGTCAGCGAGGCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTCTCG < 2:87043/232‑1 GCTGGGCGCAGGGATGCCCGCTGGAAAAAATGGTCAGCGAGGCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTCTCGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGTAACGCTACGCAAGCGCCGTCTTCCCCTCGAAATGATGGTCTGGTGT > 1:124559/1‑300 GCTGGGCGCAGGGATGCCCGCTGGAAAAAATGGTCAGCGAGGCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTCTCGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGTAACGCTACGCAAGCGCCGTCTTCCCCTCGAAATGATGGTCTGGTG < 1:136528/299‑1 GCTGGGCGCAGGGATGCCCGCTGGAAAAAATGGTCAGCGAGGCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTATGGGGGATTACCTAGACCCCGAACTCATCTATCGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGTAAAGCTACGCAAGCGCAGTCTTCCACTCGAAATGATGGTCTGGTGT > 2:181601/1‑300 GGGCGCAGGGATGCCCGCTGGAAAAAATGGTCAGCGAGGCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTCTCGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGTAACGCTACGCAAGCGCCGTCTTCCCCTCGAAATGATGGTCTGGTGTATT > 1:787867/1‑300 GGCGCAGGGATGCCCGCTGGAAAAAATGGTCAGCTAGGCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTTTAAGAATCCGTAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCACCTCTCTTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGTAACGCTACGCAAGCGCCGTCTTCCCCTCGAAATGATGGTCTGGTGTATTG < 2:14772/300‑1 TGCCCGCTGGAAAAAATGGTCAGCGAGGCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTCTCGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGTAACGCTACGCAAGCGCCGTCTTCCCCTCGAAATGATGGTCTGGTGTATTGTTGGCATGGC < 2:778971/300‑1 AATGGTCAGCGAGGCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCATTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTCTCGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGTAACGCTACGCAAGCGCCGTCTTCCCCTCGAAATGATGGTCTGGTGTATTGTTGGCATGGCGCTTGAGCGTAAAG < 2:482206/300‑1 ATGGTCAGCGATGCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCATTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTNTCTGGTGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTNTCGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGTAACGCTACGCAAGCGCCGTCTTCCCCTCGAAATGATGGTCTGGTGTATTGTTGGCATGGCGCTTGAGCGTAAAGA < 2:608853/300‑1 GCGAGGCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTCTCGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGTAACGCTACGCAAGCGCAGTCTTCCCCCCGAAATGATGGTCTGGTGTATTGTTGGCATGGCGCTTGAGCGTAAAGAACCTCTT > 2:669623/1‑300 GCGAGGCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCAATTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTATGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTCTCGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGTAACGCTACGCAAGCGCCGTCTTCCCCTCGAAATGATGGTATGGTGTATTGTTGGCATGGCGCTTGAGCGTAAAGAACCTCTT > 2:375316/1‑300 GCACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTATCGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGTAACGCTACGCAAGCGCCGTCTTCCCCTCGAAATGATGGTCTGGTGTATTGTTGGCATGGCGCTTGAGCGTAAAGAACCTCTTAACCA > 2:748397/1‑300 CACTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTCTCGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGTAACGCTACGCAAGCGCCGTCTTCCCCTCGAAATGATGGTCTGGTGTATTGTTGGCATGGCGCTTGAGCGTAAAGAACCTCTTCACCA > 1:638663/1‑299 TTGCGGGCGAGAAGTTTCGCTTTATTGCGCCGGATGCCTTGTTAGCCAGCGATGAGCAAGCCGACTGGCTGGTGGTCGATGAAGCCGCAGCCATACCTGCGCCATTGTTGCATCAACTGGTATCGCGTTTTCCTCGAACGTTGTTAACCACTACGGTGCAGGGCTACGAAGGCACCGGACGTGGTTTTTTGCTGAAATTTTGCGCTCGCTTTCCGCATTTACACCGTTTTGAACTGCAACAGCCGATCCGCTGGGCGCAGGGATGCCCGCTGGAAAAAATGGTCAGCGAGGCACt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2595153‑2594860‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTCTGGGGGATTACCTCGACCCCGAACTCATCTCTCGTTGCCTTGCCGAATCAGGTACTGTAACGCTACGCAAGCGCCGTCTTCCCCTCGAAATGATGGTCTGGTGTATTGTTGGCATGGCGCTTGAGCGTAAAGAACCTCTTCACCA < NC_000913/4503515‑4503220 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |