| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,743,451 | IS4 (+) +12 bp | [mdtK] | [mdtK] | |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1743451 = | 0 (0.000) | 95 (0.950) | 64/590 | 0.2 | 100% | intergenic (‑209/‑6) | ribC/mdtK | riboflavin synthase/multidrug efflux pump MdtK |
| ? | NC_000913 | 4502090 = | NA (NA) | noncoding (1426/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1743462 | 0 (0.000) | 91 (0.910) | 59/590 | 0.3 | 100% | coding (6/1374 nt) | mdtK | multidrug efflux pump MdtK |
| ? | NC_000913 | = 4503515 | NA (NA) | noncoding (1/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
ACCTGCCAGCCAGAAACCTTGTCGCACCTGATGCGCAATGCGCTCACGTCGACCGGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1743744‑1743451‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTGATTCGGCCAGTAACCTTTCAGATGTTCCGCCATTTTAATCATCTGATATCTCACCAGATTATAAGC > NC_000913/4502090‑4502387 ACCTGCCAGCCAGAAACCTTGTCGCACCTGATGCGCAATGCGCTCACGTCGACCGGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGC < 1:144095/300‑1 TGCCAGCCAGAAACCTTGTCGCACCTGATGCGCAATGCGCTCACGTCGACCTGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGGACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCACCGCAGTTTGGTCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCC < 2:320147/298‑1 GCCAGCCAGAAACCTTGTCGCACCTGATGCGCAATGCGCTCACGTCGACCTGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCTTGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCC < 2:320063/297‑1 GAAACCTTGTCGCACCTGATGCGCAATGCGCTCACGTCGACCGGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAA > 1:647656/1‑299 AAACCTTGTCGCACCGGATGCGCAATGCGCTCACGTCGACCGGAACCATTTAATGGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCTGGATTACTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGC < 2:43514/300‑1 ACCTTGTCGCACCTGATGCGCAATGCGCTCACGTCGACCGGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACAAAAGAGGATCGACGGAAGCAAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGAAAAAACCCATCGTAGTTTGAGCAATTTGCGCGAGAATCACAGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTAACTAATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGaca > 2:151193/1‑297 ACCTTGTCGCACCTGATGCGCAATGCGCTCACGTCGACCGGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCAAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACNGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCA > 2:572758/1‑299 TTGTCGCACCTGATGCGCAATGCGCTCACGTCGACCGGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACT > 1:138824/1‑299 ATGCGCAATGCGCTCACGTCGACCGGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACACACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTT > 1:790693/1‑300 GCGCAATGCGCTCACGTCGACCGGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTC > 2:721803/1‑300 GCAATGCGCTCACGTCGACCGGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCAACGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTC > 2:276406/1‑298 GCTCACGTCGACCGGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGG > 1:636598/1‑295 ACGTCGACCGGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCTGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGG < 2:157967/299‑1 ACGTCGACCGGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGAGAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATTGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGG < 1:431446/299‑1 tTCGACCGGAACCATTTAATTGCGTGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGTGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCTGGGCTGTGGGGTAT < 2:441685/299‑1 TCGACCGGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTAT < 2:443840/299‑1 GACCGGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTC > 1:564770/1‑300 GACCGGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCGAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTT < 2:466283/299‑1 AACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGTTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGC < 1:4164/300‑1 AACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGC < 1:4180/300‑1 CCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCAACGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCCCGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCT > 2:392345/1‑300 gTTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTat > 1:223481/2‑298 ATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCT > 1:220246/1‑300 TTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGTAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCACCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTGGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCC < 2:220686/300‑1 TAATTGCGCGATAACCTGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTTGCACTATAGCCTCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGTGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCTGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCC < 2:218626/299‑1 TGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTAC < 1:101747/300‑1 GCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCA < 1:627143/299‑1 GGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGA < 2:760379/299‑1 GGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGACTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGA < 2:554137/299‑1 GCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAG < 1:1148/300‑1 TTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGA < 2:123248/295‑1 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GTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAAATGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTATTGTC > 2:456840/1‑300 TGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAA > 1:429789/1‑300 AAAGAGGATCGCCGGANGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTNTCGGGAAGGCCCTTTCCCNTCTTGTCGGTAATTTCA > 1:671972/1‑300 AGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCTCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAG < 2:466082/300‑1 gcTAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCAGACCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCAATATTTGCAA > 2:64571/3‑300 AGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTAGCGACAAAACCCATCGCNGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGAT < 1:584433/300‑1 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ATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCAGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTGATTCGGCCAGTAACCTTTCAGATGTTCCGCCATTTTAATCATCTGATA > 1:334596/1‑300 ATATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCAAAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTGATTCGGCCAGTAACCTTTCAGATGTTCCGCCATTTTAATCATCTGATA > 1:302101/1‑300 ATACTTCTGCACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTTTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCNGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTGATTCGGCCAGTAACCTTTCAGATGTTCCGCCATTTTAATCATCTGATATC < 2:578476/300‑1 GCACGTGAATTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTTGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGCGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGTGGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTGATTCGGCCAGTAACCTTTCAGATGTTCCGCCATTTTAATCATCTGATATCTCACC < 2:381311/297‑1 ACGTGAACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTGATTCGGCCAGTAACCTTTCAGATGTTCCGCCATTTTAATCATCTGATATCTCACCAGATT < 1:64571/300‑1 AACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTGATTCGGCCAGTAACCTTTCAGATGTTCCGCCATTTTAATCATCTGATATCTCACCAGATTATAA > 1:380435/1‑299 ACTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTGATTCGGCCAGTAACCTTTCAGATGTTCCGCCATTTTAATCATCTGATATCTCACCAGATTATAAGC < 1:721803/300‑1 ACCTGCCAGCCAGAAACCTTGTCGCACCTGATGCGCAATGCGCTCACGTCGACCGGAACCATTTAATTGCGCGATAACCGGCGTTAATGCCAGCAGCAGTCCGTGACCAAAGAGGATCGCCGGAAGCCAGATAGAAGTACCGATAGCGACCGCCGCCATGTCGGTGGCACTATAGCCGCCCGCCATCACGGTATCGACAAAACCCATCGCAGTTTGGGCGATTTGCGCGAGAATCACCGGGATTGCTAATGCTAATAACAGACGCGCTTCACTGATATACTTCTGCACGTGAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1743744‑1743451‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTGATTCGGCCAGTAACCTTTCAGATGTTCCGCCATTTTAATCATCTGATATCTCACCAGATTATAAGC > NC_000913/4502090‑4502387 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |