| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 84,430 | G→A | M21I (ATG→ATA) | leuO → | DNA‑binding transcriptional dual regulator LeuO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 84,430 | 0 | G | A | 99.2% | 449.4 / NA | 122 | M21I (ATG→ATA) | leuO | DNA‑binding transcriptional dual regulator LeuO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (63/58); minor base C (1/0); total (64/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
AGTTATGATTAGATTGTTTTCGCAACAAAAACATTATGGATTATTATGCTGTGGTAAATGACTCATTCCACGGCAATGGATTCTGTT‑TTTATCAGAACCCGTATCTTTATGTTTTCCGAATTTTACTCATTTTGCTTTTTCTTATTTTATATGCATGATAAATCATATTCTTCAGGATTATTTCTCTGCATTCCAATAAGGGAAAGGGAGTTAAGTGTGACAGTGGAGTTAAGTATGCCAGAGGTACAAACA‑GATCATCCAGAGACGGCGGAGTTAAGCAAACCACAGCTACGCATGGTCGATCTCAACTTATTAACCGTTTTCGATGCCGTGATGCAGGAGCAAAACATTACTCGTGCCGCTCATGTTCTGGGAATGTCGCAACCTGCGGTCAGTAACGCTGTTGCACGCCTGAAGGTGATGTTTAATGACGAGCTTTTTGTTCGTTATGGCCGTGGTATTCAACCGACTGCTCGCGCATTTCAACTTTTTGGTTCAGTTCGTCAGGCATTGCAACTAGTACAAAATGAATTGCCTGGTTCAGGTTTTGAACCCGCGAGCAGTGAACGTGTATTTCATCTTTGTGTTT > NC_000913/84134‑84722 | aGTTATGATTAGATTGTTTTCGCAACAAAAACATTATGGATTATTATGCTGTGGTAAATGACTCATTCCACGGCAATGGATTCTGTT‑TTTATCAGAACCCGTATCTTTATGTTTTCCGAATTTTACTCATTTTGCTTTTTCTTATTTTATATGCATGATAAATCATATTCTTCAGGATTATTTCTCTGCATTCCAATAAGGGAAAGGGAGTTAAGTGTGACAGTGGAGTTAAGTATGCCAGAGGTACAAACA‑GATCATCCAGAGACGGCGGAGTTAAGCAAACCACAGCTACGCATAGTc > 2:296133/1‑300 (MQ=255) 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gCTACGCATAGTCGATCTCAACTTATTAACCGTTTTCGATGCCGTGATGCAGGAGCAAAACATTACTCGTGCCGCTCATGTTCTGGGAATGTCGCAACCTGCGGTCAGTAACGCTGTTGCACGCCTGAAGGTGATGTTTAATGACGAGCTTTTTGTTCGTTATGGCCGTGGTATTCAACCGACTGCTCGCGCATTTCAACTTTTTGGTTCAGTTCGTCAGGCATTGCAACTAGTACAAAATGAATTGCCTGGTTCAGGTTTTGAACCCGCGAGCAGTGAACGTGTATTTCATCTTTgtgt > 1:705528/1‑300 (MQ=255) aCGCATAGTCGATCTCAACTTATTAACCGTTTTCGATGCCTTGATGCAGGAGCAAAACATTACTCGTGCCGCTCATGTTCTGGGAATGTCGCAACCTGCGGTCAGTAACGCTGTTGCACGCCTGAAGGTGATGTTTAATGACGAGCTTTTTGTTCGTTATGGCCGTGGTATTCAACCGACTGCTCGCGCATTTCAACTTTTTGGTTCAGTTCGTCAGGCATTGCAACTAGTACAAAATGAATTGCCTGGTTCAGGTTTTGAACCCGCGAGCAGTGAACGTGTATTTCATCTTTGTGttt > 1:643633/1‑299 (MQ=255) aCGCATAGTCGATCTCAACTTATTAACCGTTTTCGATGCCGTGATGCAGGAGCAAAACATTACTCGTGCCGCTCATGTTCTGGGAATGTCGCAACCTGCGGTCAGTAACGCTGTTGCACGCCTGAAGGTGATGTTTAATGACGAGCTTTTTGTTCGTTATGGCCGTGGTATTCAACCGACTGCTCGCGCATTTCAACTTTTTGGTTCAGTTCGTCAGGCATTGCAACTAGTACAAAATGAATTGCCTGGTTCAGGTTTTGAACCCGCGAGCAGTGAACGTGTATTTCATCTTTGTGttt > 2:614890/1‑299 (MQ=255) | AGTTATGATTAGATTGTTTTCGCAACAAAAACATTATGGATTATTATGCTGTGGTAAATGACTCATTCCACGGCAATGGATTCTGTT‑TTTATCAGAACCCGTATCTTTATGTTTTCCGAATTTTACTCATTTTGCTTTTTCTTATTTTATATGCATGATAAATCATATTCTTCAGGATTATTTCTCTGCATTCCAATAAGGGAAAGGGAGTTAAGTGTGACAGTGGAGTTAAGTATGCCAGAGGTACAAACA‑GATCATCCAGAGACGGCGGAGTTAAGCAAACCACAGCTACGCATGGTCGATCTCAACTTATTAACCGTTTTCGATGCCGTGATGCAGGAGCAAAACATTACTCGTGCCGCTCATGTTCTGGGAATGTCGCAACCTGCGGTCAGTAACGCTGTTGCACGCCTGAAGGTGATGTTTAATGACGAGCTTTTTGTTCGTTATGGCCGTGGTATTCAACCGACTGCTCGCGCATTTCAACTTTTTGGTTCAGTTCGTCAGGCATTGCAACTAGTACAAAATGAATTGCCTGGTTCAGGTTTTGAACCCGCGAGCAGTGAACGTGTATTTCATCTTTGTGTTT > NC_000913/84134‑84722 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |