| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,487,197 | C→T | intergenic (+234/‑38) | hrpA → / → ydcF | ATP‑dependent 3'‑>5' RNA helicase HrpA/DUF218 domain‑containing protein YdcF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,487,197 | 0 | C | T | 99.0% | 340.4 / NA | 103 | intergenic (+234/‑38) | hrpA/ydcF | ATP‑dependent 3'‑>5' RNA helicase HrpA/DUF218 domain‑containing protein YdcF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (44/57); minor base G (0/1); total (44/59) | |||||||||||
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Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
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gCTTCTCACTATTATTTC‑ACGCAGTATTCTTAAGGGAACGATAAGGAGGAACCATGAACATTACCCCGTTTCCGACGCTTTCGCCGGCAACTATAGATGCCATAAATGTTATCGGACAGTGGCTGGCGCAGGATGATTTCTCCGGTGAGGTGCCGTATCAGGCCGATTGCGTGATCCTTGCAGGCAATGCGGTTATGCCGACTATCGATGCGGCATGTAAGATTGCCCGCGATCAGCAAATTCCTTTACTGATTAGTGGTGGTATCGGTCACTCGACAACTTTTTTGTATAGCGCCATc > 1:603157/1‑299 (MQ=255) attattatGTC‑ACGCAGTAGTCTGAATTGAACAATAAGGAGGAACCATGAACATTACCCCGTTTCCGACGCTTTCACCGGCAACTATAGATGCCATAAATGTTATCGGACAGTGGCTGGCGCAGGATGATTTNTCCGGTGAGGTGCCGTATCAGGCCGATTGCGTGATCCTTGCAGGCAATGCGGTTATGCCGACTAGCGATGCGGCATGTAAGATTGCCCGCGATCAGCAAATTCCTTTACTGATTAGTGGTGGTATCGGTCACTCGACAACTTTTTTGTATAGCGCCATCGCACAGc < 2:341478/297‑1 (MQ=255) cTATTATTTC‑ACGCAGTATTCTTAAGGGAACGATAAGGAGGAACCATGAACATTACCCCGTTTCCGACGCTTTCGCCGGCAACTATAGATGCCATAAATGTTATCGGACAGTGGCTGGCGCAGGATGATTTCTCCGGTGAGGTGCCGTATCAGGCCGATTGCGTGATCCTTGCAGGCAATGCGGTTATGCCGACTATCGATGCGGCATGTAAGATTGCCCGCGATCAGCAAATTCCTTTACTGATTAGTGGTGGTATCGGTCACTCGACAACTTTTTTGTATAGCGCCATCGCACAGCAt > 1:650706/1‑300 (MQ=255) | GCCTTATCCGATTTCAGATAAGCGTATTTTGCAGGCGATGGAGCAGATTAGCGGTTAACCCTGCTATTTGCCTGATAAAGAAAAAACCCGGTAAGCATTTAGCGCCGGGTTTTTTATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATACGATTTCCTCCTTTCAGAGTGCTCCGCTTCTCACTATTATCTC‑ACGCAGTATTCTTAAGGGAACGATAAGGAGGAACCATGAACATTACCCCGTTTCCGACGCTTTCGCCGGCAACTATAGATGCCATAAATGTTATCGGACAGTGGCTGGCGCAGGATGATTTCTCCGGTGAGGTGCCGTATCAGGCCGATTGCGTGATCCTTGCAGGCAATGCGGTTATGCCGACTATCGATGCGGCATGTAAGATTGCCCGCGATCAGCAAATTCCTTTACTGATTAGTGGTGGTATCGGTCACTCGACAACTTTTTTGTATAGCGCCATCGCACAGCAT > NC_000913/1486906‑1487489 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |