| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,546,601 | C→T | I502I (ATC→ATT) | fimD → | type I fimbriae usher protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,546,601 | 0 | C | T | 98.8% | 599.8 / ‑4.3 | 172 | I502I (ATC→ATT) | fimD | type I fimbriae usher protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (85/85); minor base G (1/1); total (86/86) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
CTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATCGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAGCCTGACG‑‑AAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTC > NC_000913/4546305‑4546889 | ggctggctGGACAATATAGGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGNGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAacac < 2:743826/299‑1 (MQ=255) tggctggACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGa > 2:603646/1‑300 (MQ=255) gctggACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTAAAACATTGAAACACAGGAc > 1:844294/1‑299 (MQ=255) gACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGGAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGt < 1:621762/300‑1 (MQ=255) gACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGt > 2:182394/1‑300 (MQ=255) atatatGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACNAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTAtt > 1:760132/1‑300 (MQ=255) atatatGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTAAAACATTGAAACACAGGACGGAGTTAtt > 2:692423/1‑300 (MQ=255) tatatGGTGGAACGCAACTTGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATAGTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTc < 1:914918/300‑1 (MQ=255) tatatGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTc < 1:636167/300‑1 (MQ=255) tatatGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTc < 2:219604/300‑1 (MQ=255) tatatGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCAGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTAGAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAGCATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTc < 2:385963/300‑1 (MQ=255) gtggAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGAAGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGCTACAACATACAGTCGC‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGttc > 2:693195/1‑299 (MQ=255) cAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGaa > 2:39295/1‑299 (MQ=255) gTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAAcc < 2:256988/300‑1 (MQ=255) gTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAAc < 1:77633/299‑1 (MQ=255) tttCGGTATCGGTAAAAACATGTGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACATTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATaa < 1:551870/300‑1 (MQ=255) tttCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATaa < 1:551888/300‑1 (MQ=255) aCATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCAGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCNACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGAGGGAAATTAc > 2:813766/1‑300 (MQ=255) tGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAAc < 2:894788/300‑1 (MQ=255) gCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACCTTGAAACACAGGAAGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAAACTCGCTTATAACAAACGCGAGAAATTACAACTAAcc > 2:25796/1‑300 (MQ=255) gCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCAcc > 1:321522/1‑300 (MQ=255) aCTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCg < 1:661915/299‑1 (MQ=255) aCTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGt < 2:845547/300‑1 (MQ=255) aCTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGt > 1:95469/1‑300 (MQ=255) aCTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAACCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGt > 1:98342/1‑300 (MQ=255) gcTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTc < 2:409701/298‑1 (MQ=255) tctgtctgTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGc < 2:262085/299‑1 (MQ=255) gtctgtGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATCCAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACATCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCaa > 2:193191/1‑298 (MQ=255) gtctgtGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACt > 1:607744/1‑300 (MQ=255) gtctgtGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACt > 2:467243/1‑300 (MQ=255) gtctgtGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAAAAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACt > 2:467257/1‑300 (MQ=255) gtctgtGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGNTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACt > 1:751829/1‑300 (MQ=255) ggATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGAACAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTAAAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGGAATTACAACTCAATGTTACTCAGCAACTAGGgc > 2:574642/1‑299 (MQ=255) atatGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACCCACCGTTACTCAGCAACTCGGGTGca > 2:955603/1‑300 (MQ=255) aGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGNATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAacac < 1:753950/300‑1 (MQ=255) aGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAacac < 1:76176/300‑1 (MQ=255) aGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAacac < 2:915386/300‑1 (MQ=255) ggCTAATTCCACACTTCCCGATGCCAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTATATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGCTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAATATTGACACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCAACGCCTATTACAACCTCACTTCTAACAAACGCGGGAAATTAAAACCCACCGTCACTCAGCAAcgatgtcgcccatcaac > 2:161504/1‑281 (MQ=255) ggCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATCCAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTAGGGCGCACATCAAAACt > 1:889706/1‑300 (MQ=255) ggCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACt > 1:380522/1‑300 (MQ=255) ggCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAAATAGGGCGCACATCAACACt > 2:278508/1‑300 (MQ=255) ggCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATCACAAATCACCGTTACTCAGCAAATAGGGCGCCCATCAacac > 2:377741/1‑299 (MQ=255) ggCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAAAAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAAAACt > 2:281023/1‑300 (MQ=255) ggCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGATTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACt > 1:939011/1‑300 (MQ=255) gCTAGTTCCACACTTCCAGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGGGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCGCAATGAATCATGCACGAATATTCAGTGAGTGGGGTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCGGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAac < 2:247626/296‑1 (MQ=255) gttCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACACCCTCGCTTATAACAACCGCGGGAAATTACAACTCCCCGTTACTCAGAAACTAGGGCGAACATCAACACTGTAt > 1:815079/2‑299 (MQ=255) aTTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTAtt > 1:691363/1‑300 (MQ=255) aTTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGATTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCAGGCGCACAtaccccctgtctt > 2:310612/1‑288 (MQ=255) tCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTAttgg < 1:722454/300‑3 (MQ=255) ccACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGAACAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGa > 2:595503/1‑300 (MQ=255) ccACACTTACCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGa > 1:387907/1‑300 (MQ=255) acacTTCCCTGTGGCAGTCAGTATGACGGACAATCGGTGCGTTTGCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCATGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAg < 2:167979/299‑1 (MQ=255) acacTTCCCGATGGCAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTTGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAg < 2:56076/299‑1 (MQ=255) acacTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACGTCAACACTGTATTTGAg < 1:137635/299‑1 (MQ=255) acacTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAg < 1:138935/299‑1 (MQ=255) acacTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTGCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGACACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAg < 2:250397/299‑1 (MQ=255) acacTCCCCGATGACAGTCAGCACGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAACCAAGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCGACAACAGGGAAACACAAGACGGAATTAGTCAGGGTAAGCCGAAAGTCACCGACTATGACAACCGCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTATAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAATACTGTATTTGAg < 2:856068/299‑1 (MQ=255) actccccGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAg < 2:168070/293‑1 (MQ=255) cTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGt > 1:996919/1‑300 (MQ=255) cAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCAGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCAATCAAAc > 2:441615/1‑300 (MQ=255) cGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTAAAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAGTTACAACTCAACGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCGTCAAAC‑‑TTATTGGGGAAc > 2:487393/1‑300 (MQ=255) ggTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGt < 1:182394/300‑1 (MQ=255) ggTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGt < 2:732790/300‑1 (MQ=255) gTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCATGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATg < 1:621372/300‑1 (MQ=255) ctctctAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCaa > 1:637017/1‑300 (MQ=255) ctctATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACNGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTAGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTAGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCAATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCaa > 2:767678/1‑300 (MQ=255) aaaTCGCTCAATGAATNAGGCACGAATATTCAGTTNGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCNATGAGCAATTCCAGGc < 1:875698/299‑1 (MQ=255) aaaTCGCTCAATGAACCAGACACGAATATTCAGTTGGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCAGATACTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCGACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAgtc < 2:297607/299‑3 (MQ=255) tGAATCATGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATAc < 2:709366/300‑1 (MQ=255) tGAATCAGGCACGGATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATAc < 2:647200/300‑1 (MQ=255) gCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCg < 1:278508/300‑1 (MQ=255) ctaaTATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGaa > 1:389904/3‑299 (MQ=255) cGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGaa > 2:499763/1‑299 (MQ=255) cAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCGACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAAc > 2:863721/1‑300 (MQ=255) agttagttGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTGCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGTGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAAc < 2:146793/299‑1 (MQ=255) gTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAGAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGGGCAATTCCAGGCTGGGTTAAATACTGCGTTCGAAGATATc > 2:363330/1‑295 (MQ=255) gTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGCACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCCGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACt > 1:242331/1‑299 (MQ=255) aGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGAc < 2:481343/300‑1 (MQ=255) aGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGAc < 1:603646/300‑1 (MQ=255) gggTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTTGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑t > 1:85802/1‑300 (MQ=255) ggTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATANAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATAc < 1:221256/272‑1 (MQ=255) ccGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAA‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCta > 2:224710/1‑300 (MQ=255) ttATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAg < 2:389904/300‑1 (MQ=255) aTTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGAGTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAGcc < 2:917045/300‑1 (MQ=255) aTTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATGGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAGcc < 1:693195/300‑1 (MQ=255) gCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTNACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAGCCTGACG‑‑AAAAACGCCTGGCAAAAAgg < 1:204418/299‑1 (MQ=255) cTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAGCCTGACG‑‑AAAAACGCATGGCAAAAAGGa > 1:409639/1‑299 (MQ=255) aTACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAGCCTGACG‑‑AAAAACGCATGGCAAAAAGGAc > 2:532130/1‑297 (MQ=255) acaacaTACAGTCGACNATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACGGTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTCGGGACGCGNTCAGCTATAGCCTGACGGNAAAAACGCCTgccgcaa > 1:855689/1‑294 (MQ=255) acaacaTACAGTCGACNATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACGGTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTCGGGACGCGNTCAGCTATAGCCTGAAGGNAAAAACGCCTgcggcaa > 1:855701/1‑294 (MQ=255) acaacaTACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGNGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAGCCTGACG‑‑AAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGAt < 2:760783/300‑1 (MQ=255) aacaTACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAGCCTGACG‑‑AAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATc < 2:98342/299‑1 (MQ=255) acaTACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCtat > 1:304300/1‑261 (MQ=255) acaTACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAGCCTGACG‑‑AAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCa > 1:568595/1‑299 (MQ=255) acaTACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAGCCTGACG‑‑AAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCa > 2:22221/1‑299 (MQ=255) acaTACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTAAAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAGCCTGACG‑‑AAAAACGCCTAGCAAAAAGGACGGGATCa > 2:876704/1‑299 (MQ=255) tACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAGCCTGACG‑‑AAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATg < 1:421462/300‑1 (MQ=255) ga‑‑atgaatGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTACTACAACCTCGCTTATAACAAACNCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACAGCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAGCCTGACG‑‑AAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAgcgc < 2:815079/300‑1 (MQ=255) ga‑‑atgaacGGCTACAACATTGAAACACAGGACTGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAGCCTGACG‑‑AAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAgcgc < 2:121013/300‑1 (MQ=255) ggCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAGCCTGACG‑‑AAAAACGCATGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTc > 1:970216/1‑300 (MQ=255) | CTTCCGGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGA‑‑ATGAATGGCTACAACATCGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAC‑‑TTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACT‑‑GGACGC‑‑TCAGCTATAGCCTGACG‑‑AAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTC > NC_000913/4546305‑4546889 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |