| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,891,585 | C→T | intergenic (+102/‑30) | tnaB → / → mdtL | tryptophan:H(+) symporter TnaB/efflux pump MdtL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,891,585 | 0 | C | T | 99.2% | 467.7 / NA | 134 | intergenic (+102/‑30) | tnaB/mdtL | tryptophan:H(+) symporter TnaB/efflux pump MdtL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (63/70); minor base G (0/1); total (63/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
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aTGCTTTGTGTCACCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTTGATTTGTAGTTTTGCCCTGTTTTTACNTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAAAGCCGGTCGCCATACCCGGCGCGGCGCTATTTATTATTGCCTCGGTGTTCTGTTCACTgg < 1:736679/300‑1 (MQ=255) gCTTTGTGTCACCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTTGATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAAAGCCGGTCGCCATACCCGGCGCGGCGCTATTTATTATTGCCTCGGTGTTCTGTTCACTGGCt > 1:805125/1‑300 (MQ=255) gCTTTGTGTCACCTCACTATCAGTACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTTGATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACNTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAAAGCCGGTCGCCATACCCGGCGCGGCGCTATTTATTATTGCCTCGGTGTTCTGTTCACTgg < 1:736688/298‑1 (MQ=255) | GGGCTGTGCGCCACCATCTGGGCGGTCATTATTCCCGCAGTGCTTGCAATCAAAGCTCGCAAGAAGTTTCCCAATCAGATGTTCACGGTCTGGGGCGGCAATCTTATTCCGGCGATTGTCATTCTCTTTGGTATAACCGTGATTTTGTGCTGGTTCGGCAACGTCTTTAACGTGTTACCTAAATTTGGCTAAATCCTTCAAGAAGCCAGCCATTCGCTGGCTTCTTGCCTCTCAGGAAATCACTTATGTCCAAATGGCAACTCGCCTGATCCTCCTTCACCACGTATGCTTTGCGTCACCTTACTATCAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTTGATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCGTATATCTGGCGGGGATGGCAGCTGCGATGTTATTTGCCGGTAAAGTGGCCGATCGTTCAGGGAGAAAGCCGGTCGCCATACCCGGCGCGGCGCTATTTATTATTGCCTCGGTGTTCTGTTCACTGGCT > NC_000913/3891292‑3891878 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |