| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,743,273 | G→A | G181S (GGC→AGC) | yiaK → | 2,3‑diketo‑L‑gulonate reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,743,273 | 0 | G | A | 99.2% | 409.5 / NA | 126 | G181S (GGC→AGC) | yiaK | 2,3‑diketo‑L‑gulonate reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); major base A (75/49); minor base C (1/0); total (77/49) | |||||||||||
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Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
GCGTTCGATCGGTAACCTGACAGCGAAAAAGATGATGGATCGCGCCATTGAACTGGCTGCCGATCACGGTATTGGTCTGGTGGCACTACGTAATGCCAACCACTGGATGCGCGGCGGCAGCTACGGCTGGCAGGCGGCGGAAAAAGGCTATATTGGCATTTGCTGGACCAACTCCATCGCCGTAATGCCGCCGTGGGGCGCAAAAGAGTGTCGCATAGGCACTAACCCGCT‑GATCGTCGCCATTCCTTC‑CACGCCG‑ATCACCATGGTCGATATGTCGATGTCGATGTTCTCTTACGGCATGTTAGAAGTTAACCGTCTGGCAGGTCGTCAGCTCCCGGTCGATGGTGGCTTTGATGATGAGGGCAATTTGACCAAAGAACCTGGCGTTATCGAGAAGAATCGCCGCATTTTGCCGATGGGCTACTGGAAAGGTTCTGGCATGTCGATTGTGCTGGATATGATCGCTACTCTCCTTTCCGACGGCGCATCCGTTGCCGAAGTCACCCAGGACAACAGCGACGAATACGGCATTTCACAAATTTTTATTGCCATTGAAGTGGACAAGCTTATCGACGGTCCCACCCGCGAT > NC_000913/3742978‑3743566 | gCGTTCGATCGGTAACCTGACAGCGAAAAAGATGATGGATCGCGCCATTGAACTGGCTGCCGATCACGGTATTGGTCTGGTGGCACTACGTAATGCCAACCACTGGATGCGCGGCGGCAGCTACGGCTGGCAGGCGGCGGAAAAAGGCTATATTGGCATTTGCTGGACCAACTCCATCGCCGTAATGCCGCCGTGGGGCGCAAAAGAGTGTCGCATAGGCACTAACCCGCT‑GATCGTCGCCATTCCTTC‑CACGCCG‑ATCACCATGGTCGATATGTCGATGTCGATGTTCTCTTACAGCAt > 1:283217/1‑300 (MQ=255) tCGGTAACCTGACAGCGAAAAAGATGATGGATCGCGCCATTGAACTGGCTGCCGATCACGGTATTGGTCTGGTGGCACTACGTAATGCCAACCACTGGATGCGCGGCGGCAGCTACGGCTGGCAGGCGGCGGAAAAAGGCTATATTGGCATTTGCTGGACCAACTCCATCGCCGTAATGCCGCCGTGGGGCGCAAAAGAGTGTCGCATAGGCACTAACCCGCT‑GATCGTCGCCATTCCTTC‑CACGCCG‑ATCACCATGGTCGATATGTCGATGTCGATGTTCTCTTACAGCATGTTAGAAg < 1:998318/300‑1 (MQ=255) gTAACCTGACAGCGAAAAAGATGATGGATCGCGCCATTGAACTGGCTGCCGATCACGGTATTGGTCTGGTGGCACTACGTAATGCCAACCACTGGATGCGCGGCGGCAGCTACGGCTGGCAGGCGGCGGAAAAAGGCTATATTGGCATTTGCTGGACCAACTCCATCGCCGTAATGCCGCCGTGGGGCGCAAAAGAGTGTCGCATAGGCACTAACCCGCT‑GATCGTCGACATTCCTTC‑CACGCCG‑ATCACCATGGTCGATATGTCGATGTCGATGTTCTCTTACAGCATGTTAGAAGTTa > 2:141583/1‑300 (MQ=255) gAAAAAGATGATGGATCGCGCCATTGAACTGGCTGCCGATCACGGTATTGGTCTGGTGGCACTACGTAATGCCAACCACTGGATGCGCGGCGGCAGCTACGGCTGGCAGGCGGCGGAAAAAGGCTATATTGGCATTTGCTGGACCAACTCCATCGCCGTAATGCCGCCGTGGGGCGCAAAAGAGTGTCGCATAGGCACTAACCCGCT‑GATCGTCGCCATTCCTTC‑CACGCCG‑ATCACCATGGTCGATATGTCGATGTCGATGTTCTCTTACAGCATGTTAGAAGTTAACCGTCTGGCAg < 2:835751/299‑1 (MQ=255) aaaGATGATGGATCGCGCCATTGAACTGGCTGCCGATCACGGTATTGGTCTGGTGGCACTACGTAATGCCAACCACTGGATGCGCGGCGGCAGCTACGGCTGGCAGGCGGCGGAAAAAGGCTATATTGGCATTTGCTGGACCAACTCCATCGCCGTAATGCCGCCGTGGGGCGCAAAAGAGTGTCGCATAGGCACTAACCCGCT‑GATCGTCGCCATTCCTTC‑CACGCCG‑ATCACCATGGTCGATATGTCGATGTCGATGTTCTCTTACAGCATGTTAGAAGTTAACCGTCTGGCAGgtc > 1:416515/1‑299 (MQ=255) aaaGATGATGGATCGCGCCATTGAACTGGCTGCCGATCACGGTATTGGTCTGGTGGCACTACGTAATGCCAACCACTGGATGCGCGGCGGCAGCTACGGCTGGCAGGCGGCGGAAAAAGGCTATATTGGCATTTGCTGGACCAACTCCATCGCCGTAATGCCGCCGTGGGGCGCAAAAGAGTGTCGCATAGGCACTAACCCGCT‑GATCGTCGCCATTCCTTC‑CACGCCG‑ATCACCATGGTCGATATGTCGATGTCGATGTTCTCTTACAGCATGTTAGAAGTTAACCGTCTGGCAGgtc > 2:732926/1‑299 (MQ=255) atgatgGATCGCGCCATTGAACTGGCTGCCGATCACGGTATTGGTCTGGTGGCACTAAGTAATGCCAACCACTGGATGCGCGGCGGCAGCTACGGCTGGCAGGCGGCGGAAAAAGGCTATATTGGCATTTGCTGGACCAACTCCATCGCCGTAATGCCGCCGTGGGGCGCAAAAGAGTGTAGCATAGGCACTAACCCGCT‑GATCGTCGCCATTCCTTC‑CACGCCG‑ATCACCATGGTCGCTATGTCGATGTCGATGTTCTCTTCCCGCATGTTAGAAATTAACCGTCTGGCAGGTCGTCa > 2:281119/1‑299 (MQ=255) 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gtTCTCTTACAGCATGTTAGAAGTTAACCGTCTGGCAGGTCGTCAGCTCCCGGTCGATGGTGGCTTTGATGATGAGGGCAATTTGACCAAAGAACCTGGCGTTATCGAGAAGAATCGCCGCATTTTGCCGATGGGCTACTGGAAAGGTTCTGGCATGTCGATTGTGCTGGATATGATCGCTACTCTCCTTTCCGACGGCGCATCCGTTGCCGAAGTCACCCAGGACAACAGCGACGAATACGGCATTTCACAAATTTTTATTGCCATTGAAGTGGACAAGCTTATCGACGGTCCCACCcg < 1:831907/300‑1 (MQ=255) ctctTACAGCATGTTAGAAGTTAACCGTCTGGCAGGTCGTCAGCTCCCGGTCGATGGTGGCTTTGATGATGAGGGCAATTTGACCAAAGAACCTGGCGTTATCGAGAAGAATCGCCGCATTTTGCCGATGGGCTACTGGAAAGGTTCTGGCATGTCGATTGTGCTGGATATGATCGCTACTCTCCTTTCCGACGGCGCATCCGTTGCCGAAGTCACCCAGGACAACAGCGACGAATACGGCATTTCACAAATTTTTATTGCCATTGAAGTGGACAAGCTTATCGACGGTCCCACCCGCGa > 1:269993/1‑300 (MQ=255) ctctTACAGCATGTTAGAAGTTAACCGTCTGGCAGGTCGTCAGCTCCCGGTCGATGGTGGCTTTGATGATGAGGGCAATTTGACCAAAGAACCTGGCGTTATCGAGAAGAATCGCCGCATTTTGCCGATGGGCTACTGGAAAGGTTCTGGCATGTCGATTGTGCTGGATATGATCGCTACTCTCCTTTCCGACGGCGCATCCGTTGCCGAAGTCACCCAGGACAACAGCGACGAATACGGCATTTCACAAATTTTTATTGCCATTGAAGTGGACAAGCTTATCGAAGGTCCCACCCGCGa > 1:389624/1‑300 (MQ=255) ctctTACAGCATGTTAGAAGTTAACCGTCTGGCAGGTCGTCAGCTCCCGGTCGATGGTGGCTTTGATGATGAGGGCAATTTGACCAAAGAACCCTGCGTTATCGAGAAGAATCGCCGCATTTTGCCGATGGGCTACTGGAAAGGTTCTGGCATGTCGATTGTGCTGGATATGATCGCTACTCTCCTTTCCGACGGCGCATCCGTTGCCGAAGTCACCCAGGACAACAGCGACGAATACGGCATTTCACAAATTTTTATTGCCATTGAAGTGGACAAGCTTATCGACGGTCCAACCCGCGa > 1:885340/1‑300 (MQ=255) ctctTACAGCATGTTAGAAGTTAACCGTCTGGCAGGTCGTCAGCTCCCGGTCGATGGTGGCTTTGATGATGAGGGCAATTTGACCAAAAAACCTGGCGTTATCGAGAAGAATCGCCGCATTTTGCCGATGGGCTACTGGAAAGGTTCTGGCATGTCGATTGTGCTGGATATGATCGCTACTCTCCTTTCCGACGGCGCATCCGTTGCCGAAGTCACCCAGGACAACAGCGACGAATACGGCATTTCACAAATTTTTATTGCCATTGAAGTGGACAAGCTTATCTACGGTCCAACCCGCGa > 1:1000140/1‑300 (MQ=255) ctTACAGCACGTTAGAAGTTAACCGTCTGGCAGGTCGTCAGCTCCCGGTCGATGGTGGCTTTGATGATGAGGGCAATTTGACCAAAGAACCTGGCGCTATCGAGAAGAATCGCCGCATTTTGCAGATGGGCTACTGGAAAGGTTCTGGCACGTCGATTGTGCTGGATATGATCGCTACTCTCCTTTCCGACGGCGTATCCGTTGCAGAAGTCACCCAGGACAACAGAGACGAATACGGCATGTCACCAAGTTTTATTGCCATTGAAGTGGACAAGCTTATCAACGGTACCACACGCGAt > 2:314279/1‑299 (MQ=255) | GCGTTCGATCGGTAACCTGACAGCGAAAAAGATGATGGATCGCGCCATTGAACTGGCTGCCGATCACGGTATTGGTCTGGTGGCACTACGTAATGCCAACCACTGGATGCGCGGCGGCAGCTACGGCTGGCAGGCGGCGGAAAAAGGCTATATTGGCATTTGCTGGACCAACTCCATCGCCGTAATGCCGCCGTGGGGCGCAAAAGAGTGTCGCATAGGCACTAACCCGCT‑GATCGTCGCCATTCCTTC‑CACGCCG‑ATCACCATGGTCGATATGTCGATGTCGATGTTCTCTTACGGCATGTTAGAAGTTAACCGTCTGGCAGGTCGTCAGCTCCCGGTCGATGGTGGCTTTGATGATGAGGGCAATTTGACCAAAGAACCTGGCGTTATCGAGAAGAATCGCCGCATTTTGCCGATGGGCTACTGGAAAGGTTCTGGCATGTCGATTGTGCTGGATATGATCGCTACTCTCCTTTCCGACGGCGCATCCGTTGCCGAAGTCACCCAGGACAACAGCGACGAATACGGCATTTCACAAATTTTTATTGCCATTGAAGTGGACAAGCTTATCGACGGTCCCACCCGCGAT > NC_000913/3742978‑3743566 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |