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Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
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gggCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATNTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCNATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTAATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGATAACAATAGAATATTAAGCCAACAAATAAACTGAAAAAGTTTGTCCGCGATGCTTTCCTCTATGAGTCaa > 2:787185/1‑300 (MQ=255) gggCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTAAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGATAACAATAGAATATTAAGCCAACAAATAAACTGAAAAAGTTTGTCCGCGATGCTTTCCTCTATGAGTCaa > 1:627182/1‑300 (MQ=255) gCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGATAACAATAGAATATTAAGCCAACAAATAAAATGAAAAAGTTTGTCCGCGATGCTTTCCTCTATGAGTCaaa > 1:526618/1‑299 (MQ=255) | ATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGATAACAATAGAATATTAAGCCAACAAATAAACTGAAAAAGTTTGTCCGCGATGCTTTCCTCTATGAGTCAAAAT > NC_000913/4542394‑4542987 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |