| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3648146 | 156 (1.260) | 13 (0.130) | 13/474 | 4.6 | 8.9% | intergenic (+2/‑148) | agrA/agrB | small RNA AgrA/small regulatory RNA AgrB |
| ? | NC_000913 | 3648378 = | 141 (1.410) | intergenic (+3/‑150) | agrB/arsR | small regulatory RNA AgrB/DNA‑binding transcriptional repressor ArsR | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
GGCGCATGTCTCATTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGC > NC_000913/3647848‑3648444 | ggCGCATGTCTCATTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTAc < 2:654820/299‑1 (MQ=255) gTCTCATTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTACAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGAt > 1:363608/1‑300 (MQ=255) gATAAGAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCt > 1:511319/1‑300 (MQ=255) gATAAGAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCATCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTAAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGAAGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGAtt > 2:416439/1‑289 (MQ=255) aGAACTCCCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCAGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAat < 2:392896/300‑1 (MQ=255) aCTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTAAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGaa > 1:733611/1‑299 (MQ=255) ggCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGt > 2:599431/1‑300 (MQ=255) agagCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGa < 2:232543/298‑1 (MQ=255) gagCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTAAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACacagtttaatgtgacggt > 2:506719/1‑270 (MQ=255) gagCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGATTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATggcgggga > 2:36325/1‑282 (MQ=255) gCATCAGTTAACGGCACTACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGta < 1:981584/300‑1 (MQ=255) tCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTAAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAAACTTAATATGAAGATGACCCAATGAAAGtatat > 2:868191/1‑300 (MQ=255) gTTAACGTCACCACCCNTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAANGCTTAATATGACGATGACNCAGTGAAAGTATATaaa > 1:862840/1‑300 (MQ=255) gTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATaaa > 1:802541/1‑300 (MQ=255) caccCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGc > 1:1007581/1‑299 (MQ=255) caccCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACAGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGAACCAGTGAAGGTATATAAACCGTCAATGc > 2:272564/1‑299 (MQ=255) cccGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGat > 2:928197/1‑300 (MQ=255) cccGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAAACGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCAGGATTCGGACACGGCTTAATACGACGATGACCCAGTGAACGTATATCAATCGTcccttcgct > 2:928209/1‑292 (MQ=255) ccGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTcagaactcctttcaaa > 2:587903/1‑243 (MQ=255) gTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGatat < 1:391177/299‑1 (MQ=255) gACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAg < 1:998459/300‑1 (MQ=255) gggcTTTGAAAGCGTTTGTGTGTATTGCCGGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCAGACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGATATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGctc < 2:547003/297‑1 (MQ=255) tttGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGctccct < 1:966614/299‑1 (MQ=255) aaaGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGcc < 2:672329/300‑1 (MQ=255) gCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTAACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGAACCAGTGAAAGTATATAAATCGTCAATGCGATATATACCGAAGTGTTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTaa > 1:176970/1‑300 (MQ=255) 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gagCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACCCGGCTTCACATGACGATGAACCCGTGAAAGTATATAAAt > 2:217444/1‑226 (MQ=38) gagCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTAAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGAAGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATCCCGACGTGCTCACTCCGCAAGTTgaa > 2:217517/1‑269 (MQ=39) ggATGATCATACAGTACATGCAGTTGATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑ATTTCATTATGGTAGTAGC‑ATTGATGCTTTAGATGATGGCTAGCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTGTTTACATCCGGATTCGGACAAGTCTTAATACGACGATGACCCAGTGAAAGTACATAAATCGTCACTTCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCACCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAg < 2:577957/300‑1 (MQ=255) ggATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAg < 2:644929/300‑1 (MQ=255) ggATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGGATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAg < 2:645016/300‑1 (MQ=255) gATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCATTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACTCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCGTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTaagag < 2:576994/299‑4 (MQ=255) 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tCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGAACCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGNTATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGCAGAAATCGATAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGa > 1:744540/1‑300 (MQ=255) aTACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGTGATATATACCGAAGTGGTCCCTCCGCCAGTTGAAGAAATTGCTAATTCTTGCAATGTTAGACACTGGTTAATAGTAATGAGc > 2:82014/1‑300 (MQ=255) aTACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGc < 1:886699/300‑1 (MQ=255) 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gTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCt < 1:537593/300‑1 (MQ=255) ttttACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGGTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTAcc < 2:673766/295‑1 (MQ=255) aCATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGc < 1:599431/300‑1 (MQ=255) | GGCGCATGTCTCATTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCGGCCAGAGCATCAGTTAACGGCACCACCCGTACTTCTGACCAGGACTTTGAAAGCGTTTATGCGCATTGCCAGAGTGAAAATGCCTCAGAGCTAACTGGATAATCATACAGTACATGCAGGTTATAAAACCAGCACGTCCTTGCAATA‑GTTTCAGTATGGTATTAGC‑ATTGATGCGTTAGATGATGGCTATCTCACTCCAGTCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACATCCGGATTCGGACAAGGCTTAATATGACGATGACCCAGTGAAAGTATATAAATCGTCACTGCGATATATACCGAAGTGCTCCCTCCGCCAGCTGAAGAAATCGCTAATTCTTGCAATGTTAGCCACTGGCTAATAGTATTGAGCTGTTAGATAAGAACTCTCTCACTCCAGCCAGAGCCACCAACTCAGGGCTGGAAAGTAAAAAACCGACGCAAAGTCGGTTTTTTTACGTCCTGATTCAGACCTCCTTTCAAATGAATAGCCAACTCAAAATTCACACCTATTACCTTCCTCTGC > NC_000913/3647848‑3648444 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |