| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3469004 | 81 (1.120) | 8 (0.110) | 8/576 | 4.8 | 9.3% | coding (850/2694 nt) | chiA | endochitinase |
| ? | NC_000913 | 3469308 = | 77 (1.090) | coding (546/2694 nt) | chiA | endochitinase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CGCCATGGGTTATTGGAGTTTTCAGCGCTGGTACCCCGTGGGCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTT‑GTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAA‑CATAACGCCATGGGTTAC‑TGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTACCCACCAGGCGTTCTTATAAATGCCGCCGTTATAGATAACGTACCATGTAGAAGAACCTTCCTGACCTTTCCAGGCTACTACAGCATAGTTGTCGTTTGACTTATCAGCTGGGGCTGGCTGAACATCAGGAGCCGGTTTAACGTCCGGTGCCGGTTTCACATCCGGTGAAGGCTGTGGTGCTGAAGTACAGGACTGTGG > NC_000913/3468706‑3469286 | cGCCATGGGTTATTGGAGTTTTCAGCGCTGGTACCCCGTGGGCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTT‑GTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAAGAGCAAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCt > 2:299636/1‑300 (MQ=255)cGCCATGGGTTATTGGAGTTTTCAGCGCTGGTACCCCGTGGGCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTT‑GTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCAATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTCACATACTGGCTGATTTCt > 2:299301/1‑300 (MQ=255) tGGGTTGTTGGAGTTTTCAGCGCTGGTACCCCGTGGGCGATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTT‑GTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGTAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTgttg < 2:356776/299‑1 (MQ=255) cTGGTACCCCGTGGGCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTT‑GTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCNACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCNCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAA‑CATAACGc > 2:440387/1‑300 (MQ=255) cTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTT‑GTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAA‑CATAACGCCATGGGTTAC‑TGGCATCGt > 1:104811/1‑300 (MQ=255) cTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTT‑GTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTACGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAAAGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAA‑CATAACGCACTGGGTTAC‑TGGCATc > 2:154471/1‑298 (MQ=255) aacccaCCAGGCGTTCTT‑GTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTGAATTTCGCTACCTTCCTTGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAA‑CATAACGCCATGGGTTAC‑TGGCATCGTtttcttt < 2:496228/297‑1 (MQ=255) cccaCCAGGCGTTCTTNGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGACATTATTCTCCGGCTTCACGGAACAGGAGCCAGGGTTCCCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAAGNCTCACGCCATGGGTTCCGNTGCATCGttttggtttc > 1:488597/1‑294 (MQ=255) cccaCCAGGCGTTCTT‑NTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCGCCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGGGCGAA‑CGNAACGCCATGGGTTAC‑TGGNATCGTtttcttgggcat > 1:487525/1‑294 (MQ=255) ccaccaGGCGTTCTT‑GTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAA‑CATAACGCCATGGGTTAC‑TGGCATCGTTTTCTTTCGCATc > 1:143771/1‑300 (MQ=255) 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ttCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCACCCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCTGCGCGAA‑CATAACGCACTGGGTTAC‑TGGCATCATTTTCTTTCGCATCAACCGGGCAATTTGCAGAGCCTACCCACCAGGCGTTCTTATACATACCGCCGTtata > 1:19556/1‑300 (MQ=255) ttCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTNTCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAA‑CATAACGCCATGGGTTAC‑TGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTACCCACCAGGCGTTCTTATAAATGCCGCCGTtata > 2:432604/1‑300 (MQ=255) ttCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAA‑CATAACGCCATGGGTTAC‑TGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTACCCACCAGGCGTTCTTATACATGCCGCCGTtata > 1:572540/1‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |