| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 2,788,391 | C→T | intergenic (‑2554/‑594) | ileY ← / → glaH | tRNA‑Ile/glutarate dioxygenase GlaH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,788,391 | 0 | C | T | 99.2% | 390.8 / NA | 117 | intergenic (‑2554/‑594) | ileY/glaH | tRNA‑Ile/glutarate dioxygenase GlaH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (68/48); total (68/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GAACAATTAGCAATGGCATATATAGCCGCTCTGCCGTTCAGCAGGCCTTTAGTTTACTGGGATGGCCAAGTATTAAAATCAACGACTGAAATTAAAAATTATGATGGGTCCACGCGTGTCGGCGGTGAGGCGTAGCTTAATAAAGGTTGCTCTACCTATCAGCAGCTCTACAATGAATTCCACGCATTATATATAGATAAAGCAGGAATATGGAGCGCATTTGAGGGTGTATCTGCAACTAAAAACGTTCTGGCCTTTAGTCGTGGGGATTCTGTGAACATTAATCACTCTCCTCATGATGGACTAGTTATAATAAATAAAGGAAACGAAGAAGTTGAAGGTACCTGGCCTAACAAATTGCAACCTGGAATATACAAAAACATGGGGAGTAATAGCGTTAACATTATTATTAATAATACCCGAAAAATTATCCCCCCTGGTAAAGTATTTACGCTTAGAGGCGGAACTCTAAATATCAATATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAAAACGGGGCAGATAAT > NC_000913/2788104‑2788689 | gAACAATTAGCAATGGCATATATAGCCGCTCTGCCGTTCAGCAGGCCTTTAGTTTACTGGGATGGCCAAGTATTAAAATCAACGACTGAAATTAAAAATTATGATGGGTCCACGCGTGTCGGCGGTGAGGCGTAGCTTAATAAAGGTTGCTCTACCTATCAGCAGCTCTACAATGAATTCCACGCATTATATATAGATAAAGCAGGAATATGGAGCGCATTTGAGGGTGTATCTGCAACTAAAAACGTTCTGGCCTTTAGTCGTGGGGATTCTGTGAACATTAATCATTCTCCTCatgat < 1:117073/300‑1 (MQ=255) 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aaTCATTCTCCTCATGATGGACTAGTTATAATAAATAAAGGAAACGAAGAAGTTGAAGGTACCTGGCCTAACAAATTGCAACCTGGAATATACAAAAACATGGGGAGTAATAGCGTTAACATTATTATTAATAATACCCGAAAAATTATCCCCCCTGGTAAAGTATTTACGCTTAGAGGCGGAACTCTAAATATCAATATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCAGATAAAACGGGGCa > 2:12128/1‑298 (MQ=255) aTCATTCTCCTCATGATGGACTAGTTATAATAAATAAAGGAAACGAAGAAGTTGAAGGTACCTGGCCTAACAAATTGCAACCTGGAATATACAAAAACATGGGGAGTAATAGCGTTAACATTATTATTAATAATACCCGAAAAATTATCCCCCCTGGTAAAGTATTTACGCTTAGAGGCGGAACTCTAAATATCAATATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCtctgtctcttatacacatctcgc < 1:113730/300‑23 (MQ=255) aCTCCCCTCATGATGGACTAGTTATAATAAATAAAGGAAACGAAGAAGTTGAAGGTACCTGGCCTAACAAATTGCAACCTGGAATATACAAAAACATGGTGATTAATAGCGTTAACATTATTATTAATAATACCCGAAAAATTATCCCCCCTGGTAAAGTATTTACGCTTAGAGGCGGAACTCTAAATATCAATATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAAAACGGGGCAGataat < 2:353547/300‑1 (MQ=255) | GAACAATTAGCAATGGCATATATAGCCGCTCTGCCGTTCAGCAGGCCTTTAGTTTACTGGGATGGCCAAGTATTAAAATCAACGACTGAAATTAAAAATTATGATGGGTCCACGCGTGTCGGCGGTGAGGCGTAGCTTAATAAAGGTTGCTCTACCTATCAGCAGCTCTACAATGAATTCCACGCATTATATATAGATAAAGCAGGAATATGGAGCGCATTTGAGGGTGTATCTGCAACTAAAAACGTTCTGGCCTTTAGTCGTGGGGATTCTGTGAACATTAATCACTCTCCTCATGATGGACTAGTTATAATAAATAAAGGAAACGAAGAAGTTGAAGGTACCTGGCCTAACAAATTGCAACCTGGAATATACAAAAACATGGGGAGTAATAGCGTTAACATTATTATTAATAATACCCGAAAAATTATCCCCCCTGGTAAAGTATTTACGCTTAGAGGCGGAACTCTAAATATCAATATTCCTGGGCGTAGCGCTCTTCTTTTAGGGAAAACAGGAGAACCGCCGAACTATCTCTATTTATAATTTAATGTTATATCTGCCCCGATAAAACGGGGCAGATAAT > NC_000913/2788104‑2788689 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |