| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,813,594 | G→A | E288E (GAG→GAA) | dfp → | fused 4'‑phosphopantothenoylcysteine decarboxylase and phosphopantothenoylcysteine synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,813,594 | 0 | G | A | 97.5% | 266.4 / NA | 80 | E288E (GAG→GAA) | dfp | fused 4'‑phosphopantothenoylcysteine decarboxylase and phosphopantothenoylcysteine synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base A (41/37); total (43/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.97e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGT‑CACGCTGGTATCAGGTCC‑GGTTTCA‑CTACCGACGCCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCGCCGTGAATGCTTCTGTACAGCAGCAAAATATTTTTATCGGCTGCGCCGCCGTGGCGGATTATCGCGCAGCTACCGTGGCCCCAGAGAA‑AATCAAAAAGCAGGCCACGCAGGGTGATGAATTAACAATAAAAATGGTTAAAAACCCCGATATCGTCGCAGGCGTTGCCGCACTAAAAG‑ACCATCGACCCTACGTCGTTGGATTT‑GCCGCCGAAACAAATAATGTGGAAGAATACGCCCGGCAAAAACGTATCCGTAAAAACCTTGATCTGATCTGCGCGAACGATGTTTCCCAGCCAACTCAAGGATTTAACAGCGACAACAACGCATTACACCTTTTCTGGCAGGACGGAGATAAAGTCTTACCGCTT > NC_000913/3813300‑3813876 | cATTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCCGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGT‑CACGCTGGTATCAGGTCC‑GGTTTCA‑CTACCGACGCCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCGCCGTGAATGCTTCTGTACAGCAGCAAAATATTTTTATCGGCTGCGCCGCCGTGGCGGATTATCGCGCAGCTACCGTGGCCCCAGAAAA‑AAt > 1:622292/1‑300 (MQ=255) aTTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCCGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGT‑CACGCTGGTATCAGGTCC‑GGTTTCA‑CTACCGACGCCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCGCCGTGAATGCTTCTGTACAGCAGCAAAATATTTTTATCGGCTGCGCCGCCGTGGCGGATTATCGCGCAGCTACCGTGGCCCAAGAAAA‑AATc > 1:194197/1‑300 (MQ=255) cctgcaagatgtgtatcagagacaggCTCGATCCCGTGCGTTGTATCTCTCCTCACAGCCCCAGAAAGATGAGTTTTGCTATCAACGCCGCCACTGCCCGTCGTGGCGCGACCGT‑CACGCTGGTATCAGGTCC‑GGTTTCA‑CTACCGACGCCACCGTTTGTTCAACGTGTTGATATGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCACCGTGAATGCTTCTGTCCAGCAGCCAAATATTTTTATCGACTGCACAGCCGTGGCGGATTATCGCGCAACTACCGTGGCACCAG‑GAAGAATCAAACAGc > 1:179373/26‑300 (MQ=255) aCGCGTGAACCGCTCGATCCCGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGT‑CACGCTGGTATCAGGTCC‑GGTTTCA‑CTACCGACGCCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCGCCGTGAATGCTTCTGTACAGCAGCAAAATATTTTTATCGGCTGCGCCGCCGTGGCGGATTATCGCGCAGCTACCGTGGCCCCAGAAAA‑AATCAAAAAGCAGGCCACGCAGGGt < 1:400730/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |