| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,792,501 | C→G | R17R (CGG→CGC) | kbl ← | 2‑amino‑3‑ketobutyrate CoA ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,792,501 | 0 | C | G | 98.8% | 293.5 / NA | 82 | R17R (CGG→CGC) | kbl | 2‑amino‑3‑ketobutyrate CoA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (42/39); minor base A (0/1); total (42/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCGTTAGCATCAAAGCAGGAAGAGTAGAGAATCGCATCTTCCATCCCCAGGAAGGCCGCCAGTTTTTGTTCAAGCTCTTTATGGCTGTCCTGAGTGCCGCAAATAAAACGCACCGAAGCCATGCCGAAACCGTGAGAATCCATTCCCGCCTTTGCCGCCGCAATCAGATCAGGATGATTCGCCAGCCCGAGATAGTTGTTGGCACAAAAGTTAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCGATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAACACTTCTGCAAAATTCAGGATAAATAACGTGTAACTTGATGTCTCTCAACACCTACAGATAGTAGAAAAACTGTACAGTTTTGGCTGGGCATAATGATGATTGATTTTACTGCATTGATATAAAAAGAAAAAATGATGCCAAAGCATCATTTTTCCTATCTCAGTTG > NC_000913/3792205‑3792792 | ccGTTAGCATCAAAGCAGGAAGAGTAGAGAATCGCATCTTCCATCCCCAGGAATGCCGCCAGTTTTTGTTCAAGCTCTTTATGGCTGTCCTGAGTGCCGCAAATAAAACGCACCGAAGCCATGCCGAAACCGTGAGAATCCATTCCCGCCTTTGCCGCCGCAATCAGATCCGGATGATTCGCCAGCCCGAGATAGTTATTGGCACAAAAGTTAATGACGTGGCTTCCATCCGCCACAGTGATATCTGCTTTCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACCACCCTTCCGCGCGt > 2:685754/1‑300 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |