| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 782,194 | 0 | T | G | 28.4% | 140.5 / 12.0 | 97 | L37R (CTA→CGA) | nadA | quinolinate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/31); new base G (0/27); total (38/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.57e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAGGCGTAATTCGAGTGACTTTTCCCCACCATTCGACTATCTTGTTTAGCATATAAAACAAATTACACCGATAACAGCGAATATTACGCTAATGTCGGTTTTAACGTTAAGCCTGTAAAACGAGATGGTAAGATGAGCGTAATGTTTGATCCAGACACGGCGATTTATCCTTTCCCCCCGAAGCCGACGCCGTTAAGCATTGATGAAAAAGCGTATTACCGCGAGAAGATAAAACGTCTGCTAAAAGAA‑CGTAATGCGGTGATGGTTGCCCACTACTATACCGATCCCGAAATTCAACAACTGGCAGAAGAAACCGGTGGCTGTATTTCTGATTCTCTGGAAATGGCGCGCTTCGGTGCAAAGCATCCCGCTTCTACTTTGTTAGTCGCTGGGGTGAGATTTATGGGAGAAACCGCCAAAATTCTCAGTCCGGAAAAAACAATTCTGATGCCGACACTTCAGGCTGAATGTTCACTGGATCTCGGCTGCCCTGTTGAAGAATTTAACGCATTTTGCGATGCCCATCCC > NC_000913/781907‑782480 | aCTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAGGCGTAATTCGAGTGACTTTTCCCCACCATTCGACTATCTTGTTTAGCATATAAAACAAATTACACCGATAACAGCGAATATTACGCTAATGTCGGTTTTAACGTTAAGCCTGTAAAANGAGATGGTAAGATGAGCGTAATGTTTGATCCAGACACGGCGATTTATCCTTTCCCCCCGAAGCCGACGCCGTTAAGCATTGATGAAAAAGCGTACTACCGCGAGAAAATAAAACGTCTGCCAAAAGAA‑CGTaa > 2:211357/1‑300 (MQ=255)aCTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAGGCGTAATTCGAGTGACTTTTCCCCACCATTCGACTATCTTGTTTAGCATATAAAACAAATTACACCGATAACAGCGAATATTACGCTAATGTCGGTTTTAACGTTAAGCCTGTAAAACGAGATGGTAAGATGAGCGTAATGTTTGATCCAGACACGGCGATTTATCCTTTCCNCCCGAAGCCGACGCCGTTAAGCATTGATGAAAAAGCGTATTACCGCGAGAAGATAAAACGTCTGCTAAAAGAA‑CGTaa > 1:141405/1‑300 (MQ=255)aCTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAGGCGTAATTCGAGTGACTTTTCCCCACCATTCGACTATCTTGTTTAGCATATAAAACAAATTACACCGATAACAGCGAATATTACGCTAATGTCGGTTTTAACGTTAAGCCTGTAAAACGAGATGGTAAGATGAGCGTAATGTTTGATCCAGACACGGCGATTTATCCTTTCCCCCCGAAGCCGACGCCGTTAAGCATTGATGAAAAAGCGTATTACCGCGAGAAGATAAAACGTCTGCTAAAAGAA‑CGTaa > 1:80373/1‑300 (MQ=255) gTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAGGCGTAATTCGAGTGACTTTTCCCCACCATTCGACTATCTTGTTTAGCATATAAAACAAATTACACCGATAACAGCGAATATTACGCTAATGTCGGTTTTAACGTTAAGCCTGTAAAACGAGATGGTAAGATGAGCGTAATGTTTGATCCAGACACGGCGATTTATCCTTTCCCCCCGAAGCCGACGCCGTTAAGCATTGATGAAAAAGCGTATTACCGCGAGAAGATAAAACGTCTGCTAAAAGAA‑CGTAATGCGGTGATgg < 1:550882/300‑1 (MQ=255) ggCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAGGCGTAATTCGAGTGACTTTTCCCCACCATTCGACTATCTTGTTTAGCATATAAAACAAATTACACCGATAACAGCGAATATTACGCTAATGTCGGTTTTAACGTTAAGCCTGTAAAACGAGATGGTAAGATGAGCGTAATGTTTGATCCAGACACGGCGATTTATCCTTTCCCCCCGAAGCCGACGCCGTTAAGCATTGATGAAAAAGCGTATTACCGCGAGAAGATAAAACGTCTGCTAAAAGAA‑CGTAATGCGGTGATGGTTGCCCact > 1:456194/1‑300 (MQ=255) ggCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAGGCGTAATTCGAGTGACTTTTCCCCACCATTCGACTATCTTGTTTAGCATATAAAACAAATTACACCGATAACAGCGAATATTACGCTAATGTCGGTTTTAACGTTAAGCCTGTAAAACGAGATGGTAAGATGAGCGTAATGTTTGATCCAGACACGGCGATTTATCCTTTCCCCCCGAAGCCGACGCCGTTAAGCATTGATGAAAAAGCGTATTACCGCGAGAAGATAAAACGTCTGCTAAAAGAA‑CGTAATGCGGTGATGGTTGCACact > 1:86652/1‑300 (MQ=255) gTAAAATGACGCATCCTGCACATTAGGCGTAATTCGAGTGACTTTTCCCCACCATTCGACTATCTTGTTTAGCATATAAAACAAATTACACCGATAACAGCGAATATTACGCTAATGTCGGTTTTAACGTTAAGCCTGTAAAACGAGATGGTAAGATGAGCGTAATGTTTGATCCAGACACGGCGATTTATCCTTTCCCCCCGAAGCCGACGCCGTTAAGCATTGATGAAAAAGCGTATTACCGCGAGAAGATAAAACGTCTGCTAAAAGAA‑CGTAATGCGGTGATGGTTGCCCactac < 1:465261/299‑1 (MQ=255) 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aaTGACGCATCCTGCACATTAGGCGTAATTCGAGTGACTTTTCCCCACCATTCGACTATCTTGTTTAGCATATAAAACAAATTACACCGATAACAGCAAATATTACGCTAATGTCGGTTTTAACGTTAAGCCTGTAAAACGAGATGGTAAGATGAGCGTAATGTTGGATCCAGACACGGCGATTTATCCTTTCCCCCCGAAACCGACGCCGTTAAGCATTGATGAAAAAGCGTATTACCGCGAGAAGATAAAACGTCTGCGAAAAGAA‑CGTAATGCGGTGAGGGTTGCCCACTACTATAc < 2:590212/300‑1 (MQ=255) aaTGACGCATCCTGCACATTAGGCGTAATTAGAGTGACTTTTCCCCACCATTCGACTATCTTTTTTAGCATAGAAAACAAATTACACCGATAACAGCGAATATTACGCGAATGTCGGTTTTAACGTTAAGCCTGTAAAACGAGATGGTAAGATGAGCGTAATGTTGGATCCAGACACGGCGATTTATCCTTTCCCCCCGAAGCCGACGCCGTTAAGCATTGATGAAAAAGCGTATTACCGCGAGAAGATAAAACGTCTGCTAAAAGAA‑CGGAATGCGGGGATGGTGGCCCACTACTATAc < 2:437190/300‑1 (MQ=255) aaTGACGCATCCTGCACATGGGGCGTAATTCGAGTGATTTTTCCCCACCATTCGACTATCTTGTTGAGCAGAGAAACCAAATGACACCGATAACAGCGAAGATTACGCTAATGTTGGTTTTAACGTTAAGCCTGTAAAACGAGATGGTAAGATGAGCGTAATGTTGGATCCAGACACGGCGATTTATCCTTTCCCCCCGAAGCCGACGCCGTTAAACATTGATGAAAAAGCGTATTACCGCGAGAAAATAAAACGTCTGCTAAAAGAA‑CGTAATGCGGTGATGGTTGCCCACTACTATAc < 2:3381/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |