| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 124 (1.470) | 70/582 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑69) | ychE/insH21 | MarC family putative inner membrane protein YchE/IS5 family transposase and trans‑activator |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/‑484) | insH21/oppA | IS5 family transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
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ATTTCGCATCATCAAGCGACAGTTCGGCTTCGTGAAAGCCAGATACAAGGGGTTGCTGAAAAACGATAACCAACTGGCGATGTTATTCACGCTGGCCAACCTGTTTCGGGCGGACCAAATGATACGTCAGTGGGAGAGATCTCACTAAAAACTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCATTTCACTACTGGAA‑‑CTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAA‑GATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGTCAATAAAAGAGAATTGCTTAACAATTTTGCAAAATGTATTGGCGAGTAAGAACCGCATTTGGTACTTTCCGGGCAACCGCCAGACGATTCTTTATTGGTAATGAGAATAATTAACAATTAAAGAGCGTCGCGAAAGAATAATGTGTCTCGACAGGGG > NC_000913/1300400‑1300997 | atcgttactggtattaatgggattttccccggcctgcttaattaattcctttcaaattaaacggagctgccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctggacttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 2:315276‑M2/2‑1 (MQ=255)atcgttactggtattaaggggattttccccggcctgcttaattaattcctttcaaatgaaacggagctgccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctcaaattacagntagttataaggatttccttaactgcttctcctnaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 2:525217‑M2/2‑1 (MQ=255) ttgtattgcggggattttccccggcctgcttaattaattcctttcaaattaaacggagctgccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaagaggtaaaaatattcttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcttcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATc < 2:291960‑M2/9‑1 (MQ=255) tggtattaaggggattttccccggcctgcttaattaattcctttcaaatgaaacggagctgccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgcttaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCa < 1:655376‑M2/10‑1 (MQ=255) 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aattaattcctttcaaatgaaacggagctgccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCATTTCactact > 1:8090‑M2/260‑298 (MQ=255) aattaattcctttcaaatgaaacggagctgccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctaaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCCTTtcactaat > 2:348942‑M2/260‑296 (MQ=255) aattaattcctttcaaatgaaacggagctgccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctaaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCATTTCactact > 2:348431‑M2/260‑298 (MQ=255) 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ttgcaaatgaaacggagcggccatgctccgtctacttcgtcattatttctactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCATTTCACTACTGGAA‑‑CTGTaa < 2:126536‑M2/49‑1 (MQ=255) atgaaacggagctgccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctaaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCATTTCACTACTGGAA‑‑CTGTAGTCAGaaaa > 2:480524‑M2/244‑300 (MQ=255) acacggagctgccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCATTTCAATACTGGAA‑‑CTGTAATTAGAAAAGAt > 2:407513‑M2/241‑300 (MQ=255) ggagctgccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCATTTCACTACTGGAA‑‑CTGTAATCAGAAAAGATAGAc < 1:550178‑M2/64‑1 (MQ=255) gagctgccatgctccgntttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaacaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAACTTATTGGNGCATTTCACTACTGGAACNCTGTaatcagagcgaga > 1:584265‑M2/237‑294 (MQ=255) gagctgccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCATTTCACTACTGGAA‑‑CTGTAATCAGAAAAGATAGACa > 1:20280‑M2/236‑300 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agctgccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCATTTCACTACTGGAA‑‑CTGTAATCAGAAAAGATAGACAt < 2:418024‑M2/66‑1 (MQ=255) gctgccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggaataggtaaaaatattcttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCATTTCACTACTGGAA‑‑CTGTAATCAGAAAAGATAGACAt > 1:449852‑M2/234‑299 (MQ=255) gccatgctccgtttacttcgtcattatttttactttgttcccgcgcagttatcaaaagcaaaaggagtaggtaaaaatattcttctcaaattacagttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCATTTCACTACTGGAA‑‑CTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCtt > 2:662814‑M2/231‑300 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gaggaaagtgctaaGTAATAATCAATGGTTAAA‑TTATT‑GTGCATGTCACTACTGGAA‑‑CTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTGAGCCAATCTCTATTGGATTGAATTGAAA‑GATATTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGTCAATAAANGAGAATTGCTTAACAATTGGGCAAAATGTATTNGCGAGTAAGAACCACATTTGGTACTTTCCGGGCAACCGCCAGACGATTCTTTATTGGTAATGAGAATAATTAACAATTAAAGAGCGGCGCGAAAGAAGAAtg < 2:538043‑M2/286‑1 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCATTTCACTACTGGAA‑‑CTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAA‑GATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGTCAATAAAAGAGAATTGCTTAACAATTTTGCAAAATGTATTGGCGAGTAAGAACCGCATTTGGTACTTTCCGGGCAACCGCCAGACGATTCTTTATTGGTAATGAGAATAATTAACAATTAAAGAGCGTCGCGAAAGAATAATgtgt > 2:36482‑M2/12‑300 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCATTTCACTACTGGAA‑‑CTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAACCTCTATTTGATTGACTTGAAA‑GATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGTCACTAAAAGAGAATTGCTTAACAATTTTGCAAAATGTATTGGCGAGTAAGAACCGCATTTGGTACTTTCCGGGCAACCGCCAGACGATTCTTTATTGGTAATGAGAATAATTAACAATTAAAGAGTGTCGCGAAATAATAATgtgt > 2:36062‑M2/12‑300 (MQ=255) gtgctaaATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCATTTCACTACTGGAA‑‑CTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAA‑GATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGTCAATAAAAGAGAATTGCTTAACAATTTTGCAAAATGTATTGGCGAGTAAGAACCGCATTTGGTACTTTCCGGGCAACCGCCAGACGATTCTTTATTGGTAATGAGAATAATTAACAATTAAAGAGCGTCGCGAAAGAATAATGTGtctc > 1:372192‑M2/8‑299 (MQ=255) gctaaATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCATTTCACTACTGGAA‑‑CTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAA‑GATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGTCAATAAAAGAGAATTGCTTAACAATTTTGCAAAATGTATTGGCGAGTAAGAACCGCATTTGGTACTTTCCGGGCAACCGCCAGACGATTCTTTATTGGTAATGAGAATAATTAACAATTAAAGAGCGTCGCGAAAGAATAATGTGTCTCGAc < 1:557369‑M2/295‑1 (MQ=255) tAAATAATAATCAATTGTGAAA‑TTATT‑GTGCATTTCACTACTGGAA‑‑CTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTGAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAA‑GATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGTCAATAAAAGAGAATTGCTTAACAATTTTGCAAAATGTATTGGCGAGTAAGAACCGCATTTGGTACTTTCCGGGCAACCGCCAGACGATTCTTTATTGGTAATGAGAATAATTAACAATTAAAGAGCGTCGCGAAAGAATAATGTGTCTCGACa < 2:394581/299‑1 (MQ=255) ataataataAATTGTTAAA‑TTATC‑GTGCATTTCACTATTGGAA‑‑CTGTAAGCAGAAAAGATAGACATACTTAGCCAACCTCTAGTTAATTGAATTGAAA‑GATGTTTGTTAATGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGTCAATAAAAGAGAATCGCTTAACAATTTTGCAAAATGTATTGGCGAGTAAGAACCGCATTTGGTACGTTCCGGGCAACCGCCAGACGATTTTTTATTGGTAATGAGAATAATTAACAATTAAAGAGCGTCGCGAAAGAATAATGTGTCTCGACAgggg < 2:327898/300‑1 (MQ=255) | ATTTCGCATCATCAAGCGACAGTTCGGCTTCGTGAAAGCCAGATACAAGGGGTTGCTGAAAAACGATAACCAACTGGCGATGTTATTCACGCTGGCCAACCTGTTTCGGGCGGACCAAATGATACGTCAGTGGGAGAGATCTCACTAAAAACTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAA‑TTATT‑GTGCATTTCACTACTGGAA‑‑CTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAA‑GATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGTCAATAAAAGAGAATTGCTTAACAATTTTGCAAAATGTATTGGCGAGTAAGAACCGCATTTGGTACTTTCCGGGCAACCGCCAGACGATTCTTTATTGGTAATGAGAATAATTAACAATTAAAGAGCGTCGCGAAAGAATAATGTGTCTCGACAGGGG > NC_000913/1300400‑1300997 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |