| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 249545 | 71 (0.830) | 67 (0.800) | 48/576 | 0.4 | 46.0% | intergenic (+1411/‑1353) | rayT/dinB | REP‑associated tyrosine transposase/DNA polymerase IV |
| ? | NC_000913 | 373870 = | 88 (1.050) | coding (950/951 nt) coding (3/1014 nt) |
mhpF mhpE |
acetaldehyde dehydrogenase (acetylating) MhpF 4‑hydroxy‑2‑oxovalerate aldolase |
|||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
GCAGCAGCACGCCGTTGCCGTCAGAAATCACCTGCCGCACGCCGCGAATCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGAATCATCATCCCGGCGAT > NC_000913/249248‑249839 | agcagcaCGCCGTTGCCGTCAGAAATCACCTGCCGCACGCCGCGAATCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaac < 2:447326‑M1/300‑5 (MQ=255) agcaCGCCGTTGCCGTCAGAAATCACCTGCCGCACGCCGCGAATCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaatggt > 2:67491‑M1/1‑293 (MQ=255) cGCCGTTGCCGTCAGAAATCACCTACCGCACGCCGCGAATCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCACGGTacca > 2:472462/1‑300 (MQ=255) ccGTTGCCGTCAGAAATCACCTGCCGCACGCCGCGAATCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTCCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTaccacc > 1:50257/1‑300 (MQ=255) gTTGCCGTCAGAAATCACCTGCCACACGCCGCGAATCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGTGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCg < 2:377865/299‑1 (MQ=255) gCCGTCAGAAATCACCTGCCGCACGCCGCGAATCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaacttta > 2:298763‑M1/1‑282 (MQ=255) tGCCGCACGCCGCGAATCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcac < 1:399014‑M1/299‑34 (MQ=255) gAATCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTTGGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTGTGTAACCTAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCTAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTTGCGGTGTag < 2:352407/299‑1 (MQ=255) aaTCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCAC‑AGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGc < 1:254179/300‑1 (MQ=255) aTCCGCTGGGTGAGCGGTTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGc < 1:367007/300‑1 (MQ=255) aTCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGATGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGc < 2:8505/300‑1 (MQ=255) aTCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGTTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGc < 1:124995/300‑1 (MQ=255) tcctatgggtgAGCGGTTTACCCTGTGCTTTGTCCACCATCGTCACCGGTTTGTAACCTAGGCTTAAACTGATAGGCTCAATCAGCGGAATGGGTTCCCAACGGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGACGGTGCTTGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcttgacggtatgc < 2:270265‑M1/295‑51 (MQ=255) tCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCTAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcttgacggtatgc < 2:270604‑M1/300‑51 (MQ=255) tCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCTAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgc < 1:43565‑M1/300‑51 (MQ=255) tCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgc < 1:42442‑M1/300‑51 (MQ=255) ccGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCAAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgca > 2:132138‑M1/1‑249 (MQ=255) gCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTACACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgcacg < 1:452401‑M1/300‑54 (MQ=255) tGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTGTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCTAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCAc < 2:563473/296‑1 (MQ=255) 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gcgcTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgcacgccattcgtcatcagtattcgctggaaaacgttcgccagattgccaaagcactggacgatgcccgcgtggattcgattgaagtggcccacggcgacggtttgcaaggttccagctttaactatggtttcggcgcacatagcgaccttgaatggattgaagcggcggcggatgtggtgaagcacgccaaaatcgcgacgttgttgctgccaggaatc > 1:639555‑M1/1‑32 (MQ=255) gcgcTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGtt > 1:416851/1‑299 (MQ=255) gCAAAAACGGCAGGTGCGGCATgaacggtaaaaaactttatatctcggacgtcacattgcgtgacggtatgcacgccattcgtcatcagtattcgctggaaaacgttcgccagattgccaaagcactggacgatgcccgcgtggattcgattgaagtggcccacggcgacggtttgcaaggttccagctttaactatggtttcggcgcacatagcgaccttgaatggattgaagcggcggcggatgtggtgaagcacgccaaaatcgcgacgttgttgctgccaggaatcggcactattc < 1:3268‑M1/300‑279 (MQ=255) 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GCAGCAGCACGCCGTTGCCGTCAGAAATCACCTGCCGCACGCCGCGAATCCGCTGGGTGAGCGGGTTACCCTGTGCTTTGTCCACCAGCGCCACCAGTTTGTAACCGAGGCTTAAACTGATAGGCTCGATCAGCGGAATGGTTTCCCAACTGACCTGCTGCTCGCTGGTTTCGGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTGCTCATCCGCCAGCCGGTAAAACCAAGCAGGGCGCTGAACAGCAAAAACGGCAGGTGCGGCATTCCCGGTACCACCGCCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTACGCACGTCATGGGCGATATCGCCGTTGTCGCTGACGCGGGTGACGATAATCGCCGCCGCGGTGGAGAGCAGCAGGGAAGGGATCTGCGCCACCAGGCCGTCGCCGATGGTCATCAGCACATACTGCTGGAAGGCAGCATCGGCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGAATCATCATCCCGGCGAT > NC_000913/249248‑249839 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |