Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 1,297,496 | G→A | A209V (GCT→GTT) | adhE ← | fused acetaldehyde‑CoA dehydrogenase and iron‑dependent alcohol dehydrogenasealdehyde/alcohol dehydrogenase AdhE |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,297,496 | 0 | G | A | 99.1% | 396.6 / NA | 114 | A209V (GCT→GTT) | adhE | fused acetaldehyde‑CoA dehydrogenase and iron‑dependent alcohol dehydrogenasealdehyde/alcohol dehydrogenase AdhE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (60/53); minor base C (0/1); total (60/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GCACCGTTTTTCAGGATAACATCCTGAACAGCTTTCAGCTCTTTACCCTGCAACAGATAGCCGCCGTGGGTTGCAAAACGTTCACGTACAGCGTCATAAACAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCGTTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGCGTTACGGGTCTTC > NC_000913/1297250‑1297738 | gcACCGTTTTTCAGGATAACATCCTGAACAGCTTTCAGCTCTTTACCCTGCAACAGATAGCCGCCGTGGGTTGCAAAACGTTCACGTACAGCGTCATAAACAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCGTTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTgg > 2:1106253/1‑251 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |