| Read alignment evidence... | |||||||||||
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ggTCAGAC‑AAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGTTGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCCACACCCCTG‑GGAAGTGCTCCA‑CCCCGTAGGGTGGACAAGGCgggttagccccc > 1:525660/1‑241 (MQ=11) tCAGAC‑AAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAACCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑GGAAATGCTCCA‑CCCCGTCGGGTGGATAAAGCGGTTaagacgcagc > 2:28461/1‑242 (MQ=11) cAGAC‑AAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCCTCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGGTGCCTGATGCGGAGCTGGGGCGTCTTATCAAGCCTACAACGCTGGTGA‑GTGCTCCC‑CCCCTGAGGTTGGATAAGGAGGTTTCACCGCaacc > 2:1083239/1‑248 (MQ=11) gAC‑AAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TGAAGTGCTCCA‑CCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGa < 1:737032/251‑1 (MQ=35) aC‑AAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TGAAGTGCTCCA‑CCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTAAGCCGCCTCCGAc > 1:1114744/1‑251 (MQ=25) ggCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TGAAGTGCTCCA‑CCCCGTAGGTTgg > 1:1022514/1‑222 (MQ=33) cgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TGAAGTGCTCCA‑CCCCGTAGGGTGGATAAGGGGGGGTCGCCGCAACCGGCACCCAACCTCCGAGc > 2:914375/1‑251 (MQ=11) gcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TGAAGTGCTCCA‑CCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGGTTCGCCGCATCCGGCATCCCACGTCCGAGcc > 1:700427/1‑251 (MQ=255) ccctcctccactcAACGCCCGAGCCGGTTGCTCGATGCGACGCTGGGGCGTCTTATCAGGACTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCACCCGACATCT‑AACTCCCAAGCCGGTTGCCTTATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TGAAGTGCTCCA‑CCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGcc < 2:953255/239‑1 (MQ=11) ccAACGCCCGGGCCGGTTGCCGGATGCTACGCTGGCGCGTCTTATCAGTCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TGAAGTGCTCCA‑CCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTg < 2:700427/249‑1 (MQ=255) ccAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TGAAGTGCTCCA‑CCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGAt < 1:914375/251‑1 (MQ=37) cAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TGAAGTGCTCCA‑CCCCGTAGGGTGGATAAGGCGGGTAAGCCCCATCCCACATCCAAACTCCCAGCCGGGTGcccgg > 2:210737/1‑246 (MQ=11) | AGACAATGTAGATGTGAAGTACCGCGTCTGGAAGGCGGAAGAGAAAATTGACAAC‑GCGGTAGTTCGCTAAACTGCCGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGAC‑AAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TGAAGTGCTCCA‑CCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGAT > NC_000913/2304324‑2304816 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |