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tgccgtgAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGAC‑AAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGTTACCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAAGCCTACACCGCGGTGAAGTGCTCCA‑CCCCGt > 1:637755/5‑249 (MQ=255) ccgtgAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGAC‑AAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTTTCAGGCCTACACCGCTGTGAAGGGCTCCC‑CCCCGTAGGt > 2:874627/3‑251 (MQ=255) gtgAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGAC‑AAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACCTCT‑AACGCCCAAGCCg > 2:385461/1‑181 (MQ=255) gtgAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGAC‑AAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCg < 1:385461/181‑1 (MQ=255) attGCGGCACCCCGTAGGCCAGAC‑AAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGt < 1:1102962/177‑1 (MQ=255) aGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGCC‑ACGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTCTCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATACGGCATCTTAAC‑CCCCAGCCCGTTGCCTGTTTCGACGCCGGCGCGTCATATCAGGCCTCAACCCCTGTGAAGTGATCCA‑ccctggatggtggact > 2:1215334/1‑238 (MQ=14) aGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGAC‑AAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGGTACGCCGCATCCGGCATCT‑TACGCCCCAACCGGt > 2:1102962/1‑179 (MQ=14) aGTGCGGCACCCCGTAGGCCAGAC‑AAGGCGGCCACGCAGCATCCATCATCCAACGCCCGTGCCGGTTGCCTGAGGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCA‑CCCCGTAGGTTGGATa < 2:274029/251‑1 (MQ=14) ggCACCCCGTCGGTAAGAC‑AAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCAAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCGTACGAAATCT‑AACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCATTTCAGGCCTGCACCCATGTTAAGGGCTCCAACCCCGTGGGGTGG‑TAANGCg > 2:1155007/1‑251 (MQ=11) ggCACCCCGTAGGTCAGAC‑AAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCCCTGTGAAGTGCTCCA‑CCCCGTAGGTTGGATAAGGCg > 1:667142/1‑251 (MQ=255) | AATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGGTGTATACGCCAGACAATGTAGATGTGAAGTACCGCGTCTGGAAGGCGGAAGAGAAAATTGACAAC‑GCGGTAGTTCGCTAAACTGCCGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGAC‑AAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCT‑AACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCA‑CCCCGTAGGTTGGATAAGGCG > NC_000913/2304279‑2304772 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |