| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,510,238 | 0 | T | G | 95.8% | 485.1 / ‑5.1 | 143 | intergenic (+445/+452) | insO/fecE | IS911B regulator fragment/ferric citrate ABC transporter ATP binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/6); new base G (77/59); total (78/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.07e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
AGCAGCCGTGCACACCATCCTATTGTTGTGACTGGGAGGCTGCCACCATGCTTCGCGCTTTCCCTCTGGCGAAAAAGGGAGAAGGACGGGCCCGTCTGCCTTCACTTTATGCCAGCTTCGGTAAGCTGGGTGAGACACCGACTCATGAAGATATCATTGATAACAATCGATCCATCAACTGGCCTGTATAACGTGGCTGCCGGTGATTAAGAAAGCTGCACCTACCTAAGTAGTAGCAAACGCACACTTTTTAGAAAAATCGATGGTCAGAAACTGGATTAGCAATTCCGTTCCATGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTTGGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGCTCTGGTT > NC_000913/4509943‑4510531 | agcagcCGTGCACACCATCCTATTGTTGTGACTGGGAGGCTGCCACCATGCTTCGCGCTTTCCCTCTGGCGAAAAAGGGAGAAGGACGGGCCCGTCTGCCTTCACTTTATGCCAGCTTCGGTAAGCTGGGTGAGACACCGACTCATGAAGATATCATTGATAACAATCGATCCATCAACTGGCCTGTATAACGTGGCTGCCGGTGATTAAGAAAGCTGCACCTACCTAAGTAGTAGCAAACGCACACTTTTTAGAAAAATCGATGGTCAGAAACTGGATTAGCAATTCCGTTCCAGGGt < 1:793299/299‑1 (MQ=255) 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aaTTCCGTTCCAGGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGNAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTTGGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGc < 1:640354/299‑1 (MQ=255) gTTCCAGGGTTGCTTTTGATTTACGTTTTCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTTGGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGCTCTGGtt < 1:476275/300‑1 (MQ=255) gTTCCAGGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCGCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTTGGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGCTCTGGtt < 1:567806/300‑1 (MQ=255) | AGCAGCCGTGCACACCATCCTATTGTTGTGACTGGGAGGCTGCCACCATGCTTCGCGCTTTCCCTCTGGCGAAAAAGGGAGAAGGACGGGCCCGTCTGCCTTCACTTTATGCCAGCTTCGGTAAGCTGGGTGAGACACCGACTCATGAAGATATCATTGATAACAATCGATCCATCAACTGGCCTGTATAACGTGGCTGCCGGTGATTAAGAAAGCTGCACCTACCTAAGTAGTAGCAAACGCACACTTTTTAGAAAAATCGATGGTCAGAAACTGGATTAGCAATTCCGTTCCATGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTTGGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACAGCTCTGGTT > NC_000913/4509943‑4510531 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |