| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,669,715 | 0 | G | T | 35.1% | 153.2 / 15.3 | 111 | E42* (GAG→TAG) | treF | cytoplasmic trehalase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/38); new base T (0/39); total (34/77) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.22e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GAAAAACAACACCAAATCGGTATTTTTATAAATTCCATTGATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAACCCTAATCCAGACGAACTGATGATCGAAGTCGATCTCTGCTATGAGCTGGACCCGTATGAATTAAAACTGGATGAGATGATCGAGGCAGAACCGGAACCCGAGATGATTGAAGGGCTGCCTGCCTCTGATGCGCTGACGCCTGCCGATCGCTATCTCGAACTGTTCGAGCATGTTCAGTCGGCGAAAATTTTCCCCGACAGTAAAACCTTTCCCGACTGCGCACCTAAAATGGACCCGCTGGATATCTTAATCCGCTACCGTAAAGTGCGCCGTCATCGTGATTTTGACTTGCGCAAGTTTGTTGAAAACCACTTCTGGCTGCCGGAGGTCTACTCCAGCGAGTATGTATCGGACCCGCAAAATTCCCTGAAAGAGCATATCGACCAGCTGTGGCC > NC_000913/3669417‑3670010 | gaaaaACAACACCAAATCGGTATTTTTATAAATTCCATTGATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAACCCTAATCCAGACGAACTGATGATCGAAGTCGATCTCTGCTATGAGCTGGACCCGTATGAATTAAAACTGGATGAGATGATCGAGGCAGAACCGGAACCCga > 1:403484/1‑300 (MQ=255) 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aCCCTAGATGATTGAAGGGCTGCCTGCCTCTGATGCGCTGACGCCTGCCGATCGCTATCTCGAACTGTTCGAGCATGTTCAGTCGGCGAAAATTTTCCCCGACAGTAAAACCTTTCCCGACTGCGCACCTAAAATGGACCCGCTGGATATCTTAATCCGCTACCGTAAAGTGCGCCGTCATCGTGATTTTGACTTGCGCAAGTTTGTTGAAAACCACTTCTGGCTGCCGGAGGTCTACTCCAGCGAGTATGTATCGGACCCGCAAAATTCCCTGAAAGAGCATATCGACCAGCTGTGGcc < 2:130551/300‑1 (MQ=255) aCCCGAGATGATTGAAGGGCTGCCTGCCTCTGATGCGCTGACGCCTGCCGATCGCTATCTCGAACTGTTCGAGCATGTTCAGTCGGCGAAAATTTTCCCCGACAGTAAAACCTTTCCCGACTGCGCACCTAAAATGGACCCGCTGGATATCTTAATCCGCTACCGTAAAGTGCGCCGTCATCGTGATTTTGACTTGCGCAAGTTTGTTGAAAACCACTTCTGGCTGCCGGAGGTCTACTCCAGCGAGTATGTATCGGACCCGCAAAATTCCCTGAAAGAGCATATCGACCAGCTGTGGcc < 1:68868/300‑1 (MQ=255) aCCCGAAATGATTGAAGGGCTTCCTGCCTCTGATGCGCTGACGCCTGCCGATCGCTATCTCGAACTGTTCGAGCATGTTCAGTCGGCGAANATTTTCCCCGACAGTAAAACCTTTCCCGACTGCGCACCTAAAATGGACCCGCTGGATATCTTAATCCGCTACCGTAAAGTGCGCCGTCATCGTGATTTTGACTTGCGCAAGTTTGTTGAAAACCACTTCTGGCTGCCGGAGGTCTACTCCAGCGAGTATGTATCGGACCCGCAAAATTCCCTGAAAGAGCATATCGACCAGCTGTGGcc < 2:566937/300‑1 (MQ=255) | GAAAAACAACACCAAATCGGTATTTTTATAAATTCCATTGATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAACCCTAATCCAGACGAACTGATGATCGAAGTCGATCTCTGCTATGAGCTGGACCCGTATGAATTAAAACTGGATGAGATGATCGAGGCAGAACCGGAACCCGAGATGATTGAAGGGCTGCCTGCCTCTGATGCGCTGACGCCTGCCGATCGCTATCTCGAACTGTTCGAGCATGTTCAGTCGGCGAAAATTTTCCCCGACAGTAAAACCTTTCCCGACTGCGCACCTAAAATGGACCCGCTGGATATCTTAATCCGCTACCGTAAAGTGCGCCGTCATCGTGATTTTGACTTGCGCAAGTTTGTTGAAAACCACTTCTGGCTGCCGGAGGTCTACTCCAGCGAGTATGTATCGGACCCGCAAAATTCCCTGAAAGAGCATATCGACCAGCTGTGGCC > NC_000913/3669417‑3670010 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |