| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 4,138,436 | C→T | L200L (CTG→CTA) | gldA ← | L‑1,2‑propanediol dehydrogenase/glycerol dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,138,436 | 0 | C | T | 95.2% | 201.8 / NA | 63 | L200L (CTG→CTA) | gldA | L‑1,2‑propanediol dehydrogenase/glycerol dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (28/32); minor base G (0/3); total (28/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.47e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGGCAGCTACGGTTTCGATTTCCTCCACCGGCGCATTTTCCAGAACCAGCTGCGTCAGCGTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCCAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGT > NC_000913/4138141‑4138730 | gggCAGCTACGGTTTCGATTTTCTCCACCTGCGCATTTTCCAGGACCAGCTGCGTCAGCGTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATNGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTTGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAgcg < 2:581756/300‑1 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tcttcCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCNCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATANCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGc > 2:554243/1‑299 (MQ=255) tcttcCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGt > 2:619308/1‑297 (MQ=255) agGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTAcc > 1:254171/1‑300 (MQ=255) 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GGGCAGCTACGGTTTCGATTTCCTCCACCGGCGCATTTTCCAGAACCAGCTGCGTCAGCGTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCCAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGT > NC_000913/4138141‑4138730 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |