| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 2,774,947 | G→A | G544S (GGT→AGT) | yfjW → | uncharacterized protein YfjW |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,774,947 | 0 | G | A | 98.5% | 453.3 / NA | 134 | G544S (GGT→AGT) | yfjW | uncharacterized protein YfjW |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base A (72/59); total (74/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
AAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGTTTAGTATC‑‑AACGGGAAACATTTGTCGTTAAGGCCAGAATCGGAGATTATTATTTCTGAAGGGAGTTTGTATGGACTAGTTAATAAAAGCAAAAAAATCAAAATATATGGCACAGCAGATCTTGTTTTTGTTGATAACAAGATA‑ATGAACC‑TTCGTAAAATAACTTATTTGCA‑ATCTAAGCTAGAAATTTTTGGTTCTTCTATTATGGATATATTAAAGTATATATTTGGTTTAGGTCTGCTAG‑‑CAATTTC‑‑TATAAAATTCATTCATT‑‑CTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTG‑AGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGTTTTTGTCGTTACCCATACCTATATTTTCTGTTGTTTAACTGCCAGAACTGAGCGGTTGAAAAGCCAGAAATATGCCGAGCCAGCGGCATGGAAGCGCCAGC > NC_000913/2774651‑2775241 | aaaTATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGTTTAGTATC‑‑AACGGGAAACATTTGTCGTTAAGGCCAGAATCGGAGATTATTATTTCTGAAGGGAGTTTGTATGGACTAGTTAATAAAAGCAAAAAAATCAAAATATATGGCACAGCAGATCTTGTTTTTGTTGATAACAAGATA‑ATGAACC‑TTCGTAAAATAACTTATTTGCA‑ATCTAAGCTAGAAATTTTTGGTTCTTCTATTATGGATATATTAAAGTATATATTTGGTTTAAGTc < 2:477736/300‑1 (MQ=255) 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< 2:102290/300‑1 (MQ=255) gTTCTTCTATTATGAATATATTAAAGTATATATTTGGTTTAAGTCTGCTAG‑‑CAATTGC‑‑TATAAAATTCATTCATT‑‑CTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTG‑AGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGTTTTTGTCGTTACCCATACCTATATTTTCTGTTGTTTAACTGCCAGAACTGAGCGGTTGAAAAg < 2:120495/298‑1 (MQ=255) tatGGATATATTAAAGTNTATATTTGGTTTAAGTCTNCTAG‑‑CAATTTC‑‑TATAAAATTCATTCATT‑‑CTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTG‑AGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGTTTTTGTCGTTACCCATACCTATATTTTCTGTTGTTTAACTGCCAGAACTGAGCGGTTGNAAAGCCAGAAATATGc < 1:626744/300‑1 (MQ=255) atatTAAAGTATATATTTGGTTTAAGTCTGCTAG‑‑CAATTTC‑‑TATAAAATTCATTCATT‑‑CTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTG‑AGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGTTTTTGTCGTTACCCATACCTATATTTTCTGTTGTTTAACTGCCAGAACTGAGCGGTTGAAAAGCCAGAAATATGCCGAGcaa > 2:167220/1‑298 (MQ=255) atatTAAAGTATATATTTGGTTTAAGTCTGCTAG‑‑CAATTTC‑‑TATAAAATTCATTCATT‑‑CTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTG‑AGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGTTTTTGTCGTTACCCATACCTATATTTTCTGTTGTTTAACTGCCAGAACTGAGCGGTTGAAAAGCCAGAAATATGCCGAGCCa > 1:205740/1‑300 (MQ=255) atatTAAAGTATATATTTGGTTTAAGTCTGCTAG‑‑CAATTTC‑‑CATAAACTTCATTCATT‑‑CTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTTTAACGCATTTGGCTCCAATTTGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTG‑AGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGTTTTTGTCGTTACCCATACCTatat < 2:332611/242‑1 (MQ=255) atatatTTGGTTTAAGTCTGCTAG‑‑CAATTTC‑‑TATAAAATTCATTCATT‑‑CTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTG‑AGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGTTTTTGTCGTTACCCATACCTATATTTTCTGTTGTTTAACTGCCAGAAc > 2:751269/1‑256 (MQ=255) atatTTGGTTTAAGTCTGCTAG‑‑CAATTTC‑‑TATAAAATTCATTCATT‑‑CTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTG‑AGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGTTTTTGTCGTTACCCATACCTATATTTTCTGTTGTTTAACTGCCAGAACTGAGCGGTTGAAAAGCCAGAAATATGCCGAGCCAGCGGCATGGAAg < 1:259363/300‑1 (MQ=255) gTTTAAGTCTGCTAG‑‑CAATTTC‑‑TATAAAATTCATTCATT‑‑CTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTG‑AGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGTTTTTGTCGTTNCCCATACCTATATTTTCTGTTGTTTAACTGCCAGAACTGAGCGGTTGAAAAGCCAGAAATATGCCGAGCCAGCGGCATGGAAGCGCcagc > 2:595345/1‑300 (MQ=255) | AAATATATGATGACATAAGCAATGGAAAATTATCTTCACTGAGAGCAACAGGTATCTCCCAGTTTAGTATC‑‑AACGGGAAACATTTGTCGTTAAGGCCAGAATCGGAGATTATTATTTCTGAAGGGAGTTTGTATGGACTAGTTAATAAAAGCAAAAAAATCAAAATATATGGCACAGCAGATCTTGTTTTTGTTGATAACAAGATA‑ATGAACC‑TTCGTAAAATAACTTATTTGCA‑ATCTAAGCTAGAAATTTTTGGTTCTTCTATTATGGATATATTAAAGTATATATTTGGTTTAGGTCTGCTAG‑‑CAATTTC‑‑TATAAAATTCATTCATT‑‑CTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTG‑AGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGTTTTTGTCGTTACCCATACCTATATTTTCTGTTGTTTAACTGCCAGAACTGAGCGGTTGAAAAGCCAGAAATATGCCGAGCCAGCGGCATGGAAGCGCCAGC > NC_000913/2774651‑2775241 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |