| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 4,542,042 | IS1 (+) +8 bp | coding (6‑13/597 nt) | fimE → | regulator for fimA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 138 (1.490) | 80/584 | 0.0 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4542042 = | 0 (0.000) | coding (6/597 nt) | fimE | regulator for fimA | |||||
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
AATTTACACATCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCTTTTTATCTATTGGGCTAATTTTGACCGATTGAGGTTTCCTATAGGTATTCATTCAAATATATCTCAGTTAGGAGTACTACTATTGTGAGTAAACGTCGTTATCTTACCGGTAAAGAAGTTCAGGCCATGATGCAGGCGGTTTGTTACGGGGCAACGGGAGCCAGAGATTATTGTCTTATTCTGTTGGCATATCGGCATGGGATGCGTATTAGTGAACTGCTTGATCTGCATTATCAGGACCTTGACCTTAATGAAGGTAGAATAAATATTCGCCGACTGAAGAACGGATTTTCTACCGTTCACCCGTTACGTTTTGATGAGCGTGAAGCCGTGGAACGCTGGACCCAGGAACGTGCTAACTGGAAAGGCGCTGACCGGACTGACGCTATATTTAT > NC_000913/4541753‑4542347 | acgcactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacncagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacaatatcaataagttggagtcattaccTAAACGTCGtt > 2:530311‑M2/290‑300 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |