| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 4,145,137 | C→T | T381T (ACC→ACT) | pflD → | putative formate acetyltransferase 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,145,137 | 0 | C | T | 97.2% | 254.8 / NA | 73 | T381T (ACC→ACT) | pflD | putative formate acetyltransferase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (39/31); total (40/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CATTAACCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATCAAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAACGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATCGCGATGTTTAATCTGCTGAAAGTGATGGAAATCTGCCTGCATGAAAATGAAGGCAATGCTGCGCTGACTTATGAAGGTTTACTGGAGCAGATCCGCGCCAAGATCAGCCACTACATCACCCTGATGGTTGAGG > NC_000913/4144842‑4145429 | ccttAACCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAGGGACTGCTCGGGTTTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCAACAGTAGCGCGTGTTGTTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGACAGGACGTAGCGCGGTGCGTGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATCAAAGCGTGCAATTACCGCAAACGAACATCGGCGTGCGCACTAACGCCTTGATCGACCCGCAGTTCCTGATGAAAACAGACGAAACCAtt > 2:482142/3‑299 (MQ=255)catTAACCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATCAAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAACGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACTATTc > 1:454253/1‑300 (MQ=255) aGATGCGGCGTTCCTGAAGGAACGGCTCGAACCTTTATGGTTTAAACGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCTCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCTGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATCAAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAACGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACTATTCGCTTCGGTACCGGTAt < 2:301347/300‑1 (MQ=255) tGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACNTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATCAAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAACGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACTATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAACCTTTa > 2:523496/1‑300 (MQ=255) 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aCATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATCAAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAACGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACTATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGc > 1:554058/1‑299 (MQ=255) gTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTCTTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCCCTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATCAAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCCCTAACGCATTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACTATTCGCTTCGGTACCGGTAt > 2:144865/1‑242 (MQ=255) gTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGNACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATNAAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTAGGCGTGCGCACTAACGCCTTGATCGCCACGCCGTTCCTGATGAAAACCGACGAAACTATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAACGTTCCTCAACCGTGGCGttt > 2:544476/1‑298 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |