| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,640,418 | IS30 (–) +2 bp | coding (17‑18/141 nt) | yjjY → | uncharacterized protein YjjY |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 4507459 = | NA (NA) | 112 (1.400) | 68/584 | 0.0 | 100% | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region |
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| * | ? | NC_000913 | = 4508679 | NA (NA) | 82 (1.020) | 50/586 | 0.3 | 100% | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4640418 = | 0 (0.000) | coding (17/141 nt) | yjjY | uncharacterized protein YjjY | |||||
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
GACCGTTCTTACCCGGCAGATTGATATCCATGATCACCAGGTTGATGTC‑ATATTCAGAGAGGATCTGATGCATTTCCGCGCCATCTGTCGCTTCGAAAACATCATAGCCTTCCGCTTCGAAAATACTTTTCAACGTGTTGCGTGTTACCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAGTTGCATCATACAACTAATAAACGTGGTGAATCCAAT > NC_000913/4640120‑4640718 | gaCCGTTCTTACCCGGCAGATTGATATCCATGATCACCAGGTTGATGTC‑ATATTCAGAGAGGATCTGATGCATTTCCGCGCCATCTGTCGCTTCGAAAACATCATAGCCTTCCGCTTCGAAAATACTTTTCAACGTGTTGCGTGTTACCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAAt < 1:421689/300‑1 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agGATCTGATGCATTTCCGCGCCATCTGTCGCTTCGAAAACATCATAGCCTTCCGCTTCGAAAATACTTTTCAACGTGTTGCGTGTTACCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaatctgtcaatgcaacacccctttcaattacctctttcggtgttttgaac > 2:5242‑M2/1‑241 (MQ=255) ggATCTGATGCATTTCCGCGCCATCTGTCGCTTCGAAAACATCATAGCCTTCCGCTTCGAAAATACTTTTCAACGTGTTGCGTGTTACCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCAACTAAATCGAAACAGGAAGTACAAAAGTCCCTGACCTGCCTGATGCATGCTGCAAATTAACATGATCGGCGTAACATGACTAAAGTACGTAATtgtagattcaatctgtcaatgcaacacccctttccattatctctttcggtgttttgaact < 2:380562‑M2/300‑61 (MQ=255) ggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaaacctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctatgctgtaaatgttcgtctaattcaaaaaacctacgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaacaattggatccacaATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGCACtt > 2:208789‑M2/238‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |