| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 360151 | 1024 (12.720) | 7 (0.090) | 7/566 | 4.7 | 0.69% | coding (160/1155 nt) | cynX | cyanate transporter |
| ? | NC_000913 | 360797 = | 1020 (13.170) | coding (806/1155 nt) | cynX | cyanate transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1107 total aligned reads displayed.
GCCTGGTGGTGGCAAAGCGCCCGCGAGGTCGCCTCTTCCCACAAGACAACAACCACTCCGGTTCGCGTGGTATTCACTCCCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCC > NC_000913/360499‑361096 | ggatggtggtggCAAAGCGCCCGCGAGGTCGCCTCTTCCCACAAGGCAACAACCACTCCGGTTCGCGTGGTATTCACTCCACGCGCGTGGACGCTGGGTGTTNACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTAAGCCAGCNTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACCGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAGGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCACTCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGgt > 2:541148/4‑299 (MQ=255)gCCTGGTGGTGGCAAAGCGCCCGCGAGGTCGCCTCTTCCCACAAGACAACAACCACTCCGGTTCGCGTGGTATTCACTCCCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGNCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGgt > 1:507729/1‑299 (MQ=255) tgggggCAAAGCGCCCGCGAGGTCGCCTCTTCCCACAAAACAACAACCACTCCGGTTCACTTGTTATTCACTCCCCTCGCCTGGATGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTAATTAACTGCATGTACGCCAGCCTGATTGCTTGGTTACCCGCTTTCTATATTTAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACCTGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGAAGCTTCGCTGATGCCTGCTATGGCTCACCATCAGGATCTGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACa < 2:197973/295‑1 (MQ=255) gttggCAAAGCGCCCGCGAGGTCGCCTCTTCCCACAAGACAACAACCACTCCGGTTCGCGTGGTATTCACTCCCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAAc < 1:281102/298‑1 (MQ=255) gttggCAAAGCGCCCGCGAGGTCACCTCTTCCCACAAGACAACAACCACTCCGGTTCGCGTGGTATTCACTCCCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTGACGCCAGCCTGAGTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAAc < 2:119074/298‑1 (MQ=255) aGCGCCCGCGAGGTCGCCTCTTCCCACAAGACAACAACCACTCCGGTTCGCGTGGTATTCACTCCCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTgggg < 2:587841/300‑1 (MQ=255) gcgcCCGCTAGGTCGCCTCTTCCCACAATACAACAACCACTCCGGTTCGCGTGGTATTCACTCTCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACCTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGTTGGTGTTACAACTGGTGGGGt < 2:415558/300‑1 (MQ=255) gAGGTCGCCTCTTCCCACAATACAACAACCACTCCGGTTCGCGTGGTATTCACTCCCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCgg < 2:312268/299‑1 (MQ=255) gttCGCCTCTTCCCACAAGACAACAACCACTCCGGTTCGCTTGGTATTCACTCCCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCtt < 1:467713/298‑1 (MQ=255) ctTCCCACAAGACAACAACCACTCCGGTTCGCGTGGTATTCACTCCCCGCGCGTGGACGTTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGCTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCATGCTATGGCTCGCCATCAGGATTGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGc > 2:172445/1‑300 (MQ=255) 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acaacaACTGCTTCGGTTCGCTTGGTATTCACTCCCCGCGCGTGGACGTTGTGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTTATTGCCTGGTTACCTGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACGGTGGTTCCTTACTGGCATTGATGGCGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGGTGTCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCaa < 2:655743/300‑1 (MQ=255) aacCACTCCGGTTCGCGTGGTATTCACTCCCCACGCGCGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTCCCACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCACTTGcc > 2:289057/1‑300 (MQ=255) ggTTCGCGTGGTATTCACTCCCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATtg < 2:474483/298‑1 (MQ=255) gTTCGCTTGGTATTCACTACCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTAtgg < 1:537391/297‑3 (MQ=255) tCGCGTGGTATTCACTCCCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATNGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGc < 1:519695/300‑1 (MQ=255) ggTATTCACTCCCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCATTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTA‑‑TGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGgtgt > 2:107085/1‑300 (MQ=255) aCTCCCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGTTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTTAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTggg < 2:598541/300‑1 (MQ=255) cTCCCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGt > 2:619923/1‑300 (MQ=255) tCCCCGCACGTGGACGCTGGGTGTTGACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTTGGGT‑TCTGCGGCTTTGTCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGtt < 2:136864/300‑1 (MQ=255) 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tGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGAATGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGggc < 1:666807/300‑1 (MQ=255) gactcttgttgtTTACTTCGTGCTGATTAATTGCGTTTGCGCCAGCCCGATTGCCTGTTTACCCGCTTTCGATATTTAGATTTGTGCCNTAGCGCAGTACAGCGTGTCCTTACTGGCATTGATGACGTTTGGGCAAGCCGCATGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACCGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTggtc < 2:559533/289‑3 (MQ=255) ggggtTTACTTCGTTCGGATTAACGGCTGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATGGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCACAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATTGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTc < 2:698388/283‑1 (MQ=255) gtgtTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGTTTTGCTGATGACTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTAAAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGACGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTc > 2:296155/1‑300 (MQ=255) gtTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTc > 1:449400/1‑283 (MQ=255) gtTTACTTAGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTcc > 2:326489/1‑299 (MQ=255) 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gtttACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTg < 1:567239/298‑1 (MQ=255) gTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGc < 1:30861/300‑1 (MQ=255) gTTACCCGCTGTCTATATTTAGATTGGTGCCATCGCGCAGGACAGCGGTTTCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCATGAGCGTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTgg < 2:641895/214‑1 (MQ=255) 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GCCTGGTGGTGGCAAAGCGCCCGCGAGGTCGCCTCTTCCCACAAGACAACAACCACTCCGGTTCGCGTGGTATTCACTCCCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGT‑TCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCC > NC_000913/360499‑361096 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |