| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,138,436 | C→T | L200L (CTG→CTA) | gldA ← | L‑1,2‑propanediol dehydrogenase/glycerol dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,138,436 | 0 | C | T | 98.1% | 179.2 / NA | 52 | L200L (CTG→CTA) | gldA | L‑1,2‑propanediol dehydrogenase/glycerol dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (34/17); minor base G (0/1); total (34/18) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGGCAGCTACGGTTTCGATTTCCTCCACCGGCGCATTTTCCAGAACCAGCTGCGTCAGCGTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCCAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGT > NC_000913/4138141‑4138730 | gggCAGCTACGGTTTCGATTTCCTCCACCGGCGCATTTTCCAGAACCAGCTGCGTCAGCGTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGATCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCAGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGATTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAgc > 2:403368/1‑299 (MQ=255) cAGCTACGGTTTCGATTTCCTCCACCGGCGCATTTTCCAGAACCAGCTGCGTCAGCGTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCa > 1:2031/1‑299 (MQ=255) cAGCTACGGTTTCGATTTCCTCCACCGGCGCATTTTCCAGAACCAGCTGCGTCAGCGTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCAATTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCa > 1:2246/1‑299 (MQ=255) cAGCTACGGTTTCGATTTCCTCCACCGGCGCATTTTCCAGAACCAGCTGCGTCAGCGTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCAACACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCa > 1:2260/1‑299 (MQ=255) gTTTCGATTTCCTCCACCGGCGCATTTTCCAGAACCAGCTGCGTCAGCGTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTNAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGNGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTg < 2:513230/300‑1 (MQ=255) gTTTCGATTTCCTCCACCGGCGCATTTTCCAGAACCAGCTGCGTCAGCGTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTg < 2:621662/300‑1 (MQ=255) ttCCAGAACCAGCTGCGTCAGCGTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTcgc > 1:671002/1‑300 (MQ=255) aGCTGCGTCAGCGTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACga < 1:600621/300‑1 (MQ=255) aGCGTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCa > 1:170065/1‑300 (MQ=255) gTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCANAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCAtggt > 1:494933/1‑272 (MQ=255) gTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCAcgc > 1:392487/1‑300 (MQ=255) gTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAANCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCAtggt < 2:494933/272‑1 (MQ=255) aCCGAATGCCACTTTTTCACCTTGATAATAGTGATGCGCATCCTGGATAGCGGTCAGGCCATTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCCCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATNCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTNTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACgcgc < 2:511300/300‑1 (MQ=255) gATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCAt > 1:674927/1‑300 (MQ=255) gATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCAGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCAt > 1:674948/1‑300 (MQ=255) gATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGCCAGGCCGTTCTGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCAATACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATTGCTTTTTCGCATTCTTACAGTAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCAAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGACATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACAAGGTTGCCAGCGCa > 2:27764/1‑299 (MQ=255) gcgTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACccgcc > 1:15109/1‑300 (MQ=255) gcgTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAAACAGGTTGCAAGCGCATCGCCGATACccgcc > 1:394234/1‑300 (MQ=255) gTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCcgccgc > 2:237753/1‑300 (MQ=255) aTAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGNTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGa < 1:137127/300‑1 (MQ=255) aGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAgg < 2:476646/299‑1 (MQ=255) gTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGcc > 1:102310/1‑300 (MQ=255) gTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCAAAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGcc > 2:626053/1‑300 (MQ=255) gTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTATTCCAGCAGGGTGTTGTAGCATAGTTCAGCAAGTGCTAGTGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCAGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCAAGCGCATCGACGATACCCGAAGCTAACAGAAGTGCAGGTGCGcc > 2:66281/1‑300 (MQ=255) aTGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGNCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCAAGc > 2:527494/1‑300 (MQ=255) accaccACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAAGAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGTGCCGGGGTCATTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTATCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCAtggt < 2:611947/183‑1 (MQ=255) aaaaACAATACCGCTCAGATAGGTGTTCGTTTCAATCACTCGCTCTAGCGCCGTATTCACTACATGCTGTGCTGCAGCAGGCATCACTTGTTTGCCTCCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCATTGCGAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCatactc < 2:384753/295‑4 (MQ=255) aaCCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTAt > 2:601148/1‑300 (MQ=255) aaCACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTAttt < 2:614001/298‑1 (MQ=255) accacTCAAATAAGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATTTTGTTCGGTAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTTTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCaa < 2:76008/296‑1 (MQ=255) gcgagatgtgtataagagacagcACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAAcagca > 1:464068/23‑300 (MQ=255) cAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCAAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAAcaaca > 2:17191/1‑296 (MQ=255) aGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGc < 2:170065/300‑1 (MQ=255) aTCACGCGCTCCAGCGCCGTAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTTTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGTTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCAccc < 1:412765/300‑1 (MQ=255) aTCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCAccc < 1:237753/300‑1 (MQ=255) gcCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTTTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATa < 2:431857/300‑1 (MQ=255) gcCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATa < 1:509374/300‑1 (MQ=255) ggAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAAc < 1:5710/299‑1 (MQ=255) gAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACa > 1:604117/1‑299 (MQ=255) aCTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCAGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAAACAGGTTGCCAGCGCATCGACGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCCGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAAt > 1:229749/1‑300 (MQ=255) cTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCNACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGa > 1:490482/1‑300 (MQ=255) gggTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGTGATAGTCGGTGCGATCGCTaac > 2:136923/1‑297 (MQ=255) gggTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTAcc > 2:242381/1‑299 (MQ=255) gtgtTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGa > 1:160842/1‑300 (MQ=255) gttgtAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAac > 2:350055/1‑300 (MQ=255) ttgtAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAACCTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGaa > 2:627835/1‑298 (MQ=255) ttgtAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCAc < 1:268039/255‑1 (MQ=255) ttgtAGCACAGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCAc > 2:268039/1‑255 (MQ=255) caGTTCAGCCAGTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGaa > 1:555615/1‑300 (MQ=255) gTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGTGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGCAATGTGCCAGt > 2:424810/1‑299 (MQ=255) gTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGt > 1:94861/1‑299 (MQ=255) gTGCTAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGt > 2:27248/1‑299 (MQ=255) | GGGCAGCTACGGTTTCGATTTCCTCCACCGGCGCATTTTCCAGAACCAGCTGCGTCAGCGTACCGAATGCCACTTTTTCACCGTGATAATAGTGATGCGCGTCCGGGATAGCGGTCAGGCCGTTATGCACTGCGTGCGCCGCAGCCAGACCACCACTTTCAAAACCAACACCGCTCAAATAGGTGTTCGCTTCAATCACGCGCTCCAGCGCCGGAGTCACTACATGCTGTTCGGCAGCAAGCATCGCTTTTTCGCCTTCTTCCAGCAGGGTGTTGTAGCACAGTTCAGCCAGTGCCAGCGCAGCCTGGGTGCACTTGCCGCCCGCCATGGTGGTCGCGCCGCTACGAGAGCAGGCACGCGCTTCAAACCAGGTTGCCAGCGCATCGCCGATACCCGCCGCTAACAGACGTGCAGGTGCGCCAGCGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGT > NC_000913/4138141‑4138730 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |