| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,490,240 | 0 | G | T | 26.1% | 162.5 / 12.3 | 92 | intergenic (‑54/+16) | yfdV/oxc | putative transport protein YfdV/oxalyl‑CoA decarboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/35); new base T (1/23); total (34/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.08e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AAAAGAAACATCCGACAATAACCACAAGTGATACAAGGGTCAGACGAGTGTCCGCAAAAATCATTTCCCTGTTTGCCCGAGTAATAGATACAAATAGAGCCGCAGGAAGCGCGTAGTTTAATACCAGTTTATTAAATGCCCGAGCTTGATCTTCTGAAAATGTTTCTCGTCTGCCGCTAAAATAACCCAACAGCATGATTACGATAATAGGCAATAAATCGCCAATAAAAAATGTTAGCATAATAGTATTTCCGATAAGGGTCCCCTCACCATCGCATAATGAGTTGGCAAGAGGAGACGATGTCAGTATTTAATTACCAGCGACTTGTTTTGGGTTAAGTTTGGTAATATGGCCACTTTCAGTTCCTGCTGCAGGGTCGATGACCACATTAATAATGGTCGGTTTGCGCGACTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTG‑ATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAA > NC_000913/2489946‑2490536 | aaaaGAAACACCCGACAATAACCACAATTGATACAAGGGTCAGACGAGTGTCCGCAAAAATCATTTCCCTGTTTGCCCGAGTAATAGATACAAATAGAGCCGCAGGAAGCGCGTAGTTTAATACCAGTTTATTAAATGCCCGAGCTTGATCTTCTGAAAATGTTTCTCGTCTGCCGCTAAAATAACCCAACAGCATGATTACGATAATATGCAATAAATCGCCAATAAAAAATGTTAGCATAATAGTATTTCCGATAAGGGTCCCCTCACCATCGCATAATGAGTTGGCAAGAGTAGACg < 2:28004/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |