| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 359900 | 1358 (17.680) | 8 (0.110) | 8/574 | 4.7 | 0.66% | coding (412/471 nt) | cynS | cyanase |
| ? | NC_000913 | 360159 = | 1076 (14.350) | coding (168/1155 nt) | cynX | cyanate transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1361 total aligned reads displayed.
TGGCAGAAGCCTTTGTAACCGCGGCTTTGCTGGGTCAGCAGGCGCTTCCTGCCGACGCCGCCCGCCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTAAATATCTGCCGACCAAACCGTTCTGACAGCCATGCGCAACCATCAAAAGACGTTCACGATGCTGCTGGTACTGGTGCTGATTGGTCTTAATATGCGACCACTGCTCACCTCCGTCGGGCCACTGCTACCGCAATTGCGCCAGGCGAGCGGAATGAGCTTTAGCGTGGCTGCCCTGTTGACCGCTCTGCCGGTGGTTACCATGGGCGGGCTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCA > NC_000913/359601‑360199 | ggCAGAAGCCTTTGTAACCTCTGCTTTGCTGGGTCAGCAGGCGCTTCCTGCCGACGCCGCATGCCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACGGCGTGGCGGTATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATTAGAAATTGGGCGATGGCATTATTAGCGCGATCAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCTGAAgg < 1:388310/300‑1 (MQ=255) gCCTTTGTAACCGCGGCTTTGCTGAGTCAGCAGGCGCTTCCTGCCGACGCCGCCCGCCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTATATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGCTTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGAACCGGAAGGTGGCGaa > 1:524229/1‑300 (MQ=255) ccTTTGTAACCGCGGCTTTGCTGGGTCAGCAGGCGCTTACTGCCGACGCCGCCCGCCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGCTGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACACTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGaa > 2:370278/1‑299 (MQ=255) ttgttAACCGCGGCTTTGCTGGGTCAGCATGCGCTTCCTGCCGACGCCGCCCGCCGGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACTAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGTGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGaa < 2:100879/293‑1 (MQ=255) ttGTAACCGCGGCTTTGCTGGGTCAGCAGTCGCTTCCTGCCGACGCCGCCCGCCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTg < 2:74144/300‑1 (MQ=255) cgGCTTTGCTGGGTCAGCAGGCGCTTCCTGCCGACGCCGCCCGCCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCAATGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGtcatca > 2:108684/1‑300 (MQ=255) gCTTTGCTGGGTCAGCAGGCGCTTCCTGCCGACGCCGCCCGCCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTCCTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTACGAAAGTGGAGGACCCGGAAGGTGGCGCACGTGCGGTCATCAcc > 2:9196/1‑300 (MQ=255) tttGCTGGGTCAACAGGCGCTTCCTGCCGACGCCGCCCGCCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCTACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCAGTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCAcc < 2:308636/298‑1 (MQ=255) ttGCTGGGTCAGCAGGCGCTTCCTGCCGACGCCGCCCGCCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATNCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCtt < 1:150229/299‑1 (MQ=255) aggggTCAGCAGGCGCTTCCTGCCGACGCCGCCCGCCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGAt < 2:473696/298‑1 (MQ=255) ttggTCAGCAGGCGCTTCCTGCCGACGCCGCCCGCCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATg < 2:575859/298‑1 (MQ=255) tGGGTCAGCAGGCGCTNCCTGCCGACGCCGCCCGCNTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGNGGTCATCACCTTAGAt < 1:571245/299‑1 (MQ=255) cagcagGCGCTTCCTGCCGACGCCGCCCGCCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTaaa > 1:342366/1‑300 (MQ=255) agGCGCTTTCGGCCGACGCCGCCCGCCTGGTCTGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTTTTGCAGANGGTTCCACTGCGTGGATGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAAACCTTAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCACTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTAAATATc < 1:486208/300‑1 (MQ=255) agGCGCTTCCTGCCGACGCCGCCCGCCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTNCAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATTAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTAAATATc < 2:503346/300‑1 (MQ=255) gcTTCCTGCCGACGCCTCCCGCCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTAAATATCTGcc > 1:550705/1‑300 (MQ=255) tGCCGACGCCGCCCGCCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATTACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATTAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTAAATATCTGCCGAcc < 1:243928/298‑1 (MQ=255) ccgcccgcCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTAAATATCTGCCGACCAAACCGTTCt > 1:176694/1‑300 (MQ=255) cgccTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTAAATATTTGCCGAACaaa > 2:230251/1‑288 (MQ=255) cgccTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCAACTTAGATGGTAAATATCTGCCGACCAAACCGTTCTGACa > 2:291951/1‑299 (MQ=255) gccTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGAAGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTAAATATCTGCCGACCAAACCGTTCTGACAGc < 1:185269/300‑1 (MQ=255) tGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGACGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTAAATATCTGCCGACCAAACCGTTCTGAc < 1:510355/294‑1 (MQ=255) 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ggCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACGGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATTAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTAAATATCTGCCGACCAAACCGTTCTGACAGCCATGCGCAAc < 2:650470/300‑1 (MQ=255) ctgcgagatgtgtataagagacagaTTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTAAATATCTGCCGACCAAACCGTTCTGACAGCCATGCGCAACCATc > 1:462015/25‑300 (MQ=255) tGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATTAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTAAATATCTGCCGACCAAACCGTTCTGACAGCCATGCGCAACCATCaaaa < 1:674020/300‑1 (MQ=255) 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ggAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTAAATATCTGCCGACCAAACCGTTCTGACAGCCATGCGCAACCATCAAAAGACNTTCACGATGCTGCTGGTACTGGTGCTGATTGGTCTTAATATGCGACCACTGCTCACCTCCTTCGGGCCACTGCTACCGCAATTGCGCCAGGCGAGCGGAATGAGCTTTAGCGTGGCTGCCCTGTTGACCGCTCTGCCGGTGGTTACCATGGGCGGGCTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAgtgt < 2:535707/299‑1 (MQ=255) gAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTAAATATCTGCCGACCAAACCGTTCTGACAGCCATGCGCAACCATCAAAAGACGTTCACGATGCTGCTGGTACTGGTGCTGATTGGTCTTAATATGCGACCACTGCTCACCTCCGTCGGGCCACTGCTACCGCAATTGCGCCAGGCGAGCGGAATGAGCTTTAGCGTGGCTGCCCTGTTGACCGCTCTGCCGGTGGTTACCATGGGCGGGCTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAgtgt < 1:94986/298‑1 (MQ=255) ggTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTAAATATCTGCCGACCAAACCGTTCTGACAGCCATGCGCAACCATCAAAAGACGTTCACGATGCTGCTGGTACTGGTGCTGATTGGTCTTAATATGCGACCACTGCTCACCTCCGTCGGGCCACTGCTACCGCAATTGCGCCAGGCGAGCGGAATGAGCTTTAGCGTGGCTGCCCTGTTGACCGCTCTGCCGGTGGTTACCATGGGCGGGCTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCa < 2:24520/300‑1 (MQ=255) | TGGCAGAAGCCTTTGTAACCGCGGCTTTGCTGGGTCAGCAGGCGCTTCCTGCCGACGCCGCCCGCCTGGTCGGGGCGAAGCTGGATCTCGACGAAGACTCCATTCTACTGTTGCAGATGATTCCACTGCGTGGCTGCATTGATGACCGTATTCCAACTG‑ACCCAACGATGTATCGTTTCTATGAAATGTTGCAGGTGTACGGTACAACCCTGAAAGCGTTGGTTCATGAGAAATTTGGCGATGGCATTATTAGCGCGATTAACTTCAAACTCGACGTTAAGAAAGTGGCGGACCCGGAAGGTGGCGAACGTGCGGTCATCACCTTAGATGGTAAATATCTGCCGACCAAACCGTTCTGACAGCCATGCGCAACCATCAAAAGACGTTCACGATGCTGCTGGTACTGGTGCTGATTGGTCTTAATATGCGACCACTGCTCACCTCCGTCGGGCCACTGCTACCGCAATTGCGCCAGGCGAGCGGAATGAGCTTTAGCGTGGCTGCCCTGTTGACCGCTCTGCCGGTGGTTACCATGGGCGGGCTGGCGCTGGCCGGAAGCTGGCTTCATCAGCATGTCAGCGAACGTCGCAGTGTCGCCA > NC_000913/359601‑360199 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |