| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,297,496 | G→A | A209V (GCT→GTT) | adhE ← | fused acetaldehyde‑CoA dehydrogenase and iron‑dependent alcohol dehydrogenasealdehyde/alcohol dehydrogenase AdhE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,297,496 | 0 | G | A | 98.6% | 236.8 / NA | 72 | A209V (GCT→GTT) | adhE | fused acetaldehyde‑CoA dehydrogenase and iron‑dependent alcohol dehydrogenasealdehyde/alcohol dehydrogenase AdhE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (41/30); minor base C (1/0); total (42/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGCTGGCTGACCAACGATAGCCGCGTTCAGCGCACCGTTTTTCAGGATAACATCCTGAACAGCTTTCAGCTCTTTACCCTGCAACAGATAGCCGCCGTGGGTTGCAAAACGTTCACGTACAGCGTCATAAACAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCGTTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGTGCGTTAGACAGTTCAACAGAAGGTTGATCGATCCAGCCGATCAGATCTTTCGGAGCACCGGCAGCGATAGCAGCCTGCAGAACGATATCAGCCGCTTTGTTGGTGGCATCTTTTGCACGCGGGTGCGGGGAGAAGATAATGGCGTTACGGGTCTTCAGACTGATCAGCGATTTGAAGATAGCAGTTGAAGTCGGGTTAGTGGTCGGAAC > NC_000913/1297219‑1297791 | ggcttgcggACCAACGATAGCCGCATTCAGCGCACCGTTTTTCAGGATAACATCCTGAACAGCTTTCAGCTCTTTACCCTGCAACAGATAGCCGCCGTGGGTTGCAAAACGTTCACGTACAGCGTCATAAACAGAGTCAACAACAACAACAGACTGTTCAGAAGCACAGATTACGCCGTTGTCGAAGGTTTTGGACATCAGTACAGATGCAACTGCACGTTTGATATCAGCAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAACTGGTTTACCGGAGCTGTATGc < 2:73667/292‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |