| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,581,850 | G→A | intergenic (+224/‑13) | yhhY → / → yhhZ | N‑acetyltransferase YhhY/putative endonuclease YhhZ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,581,850 | 0 | G | A | 99.2% | 434.9 / NA | 121 | intergenic (+224/‑13) | yhhY/yhhZ | N‑acetyltransferase YhhY/putative endonuclease YhhZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (54/66); total (54/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACATATATTGAGATTTAACTCATAATTACTTCCTAAAGTGTAATATTTTATTTTTTAATATATACGCCTACAATTTCCTGGAGTAAATAAATAACAATTAACAAGCATAATATTGCCATTGATAAAATAGCATGCCATAAAAGGACTTTTCAGGGATGAGTAATATTGTTTACCTGACAGTAACGGGAGAACAACAAGGAAGCATCTCCGCAGGTTGTGGGACTTCTGAGTCTACAGGTAATCGTTGGCAGAGCGGGCATGAGGATGAAATATTTACATTCTCACTCTTAAATAATATTAATAATACGGGGCTTGGTTCACAGTTCCATGGTATAACATTTTGTAAATTAATTGATAAAAGCACTCCATTATTTATTAATTCCATTAACAATAATGAACAATTATTTATGGGATTTGACTTCTATCGAATAAA > NC_000913/3581561‑3582140 | ggTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACATATATTGAGATTTAACTCATAATTACTTCCTAAAGTGTAATATTTTATTTTTTAATATATACGCCTACAATTTCCTGGAGTAAATAAATAACAATTAACAAGCATAATATTGCCATTGATAAAATAGCATGCCATAAAAAGACttttaa > 1:237963/1‑297 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gATAAAATAGCATGCCATAAAAAGACTTTTCAGGGATGAGTAATATTGTTTACCTGACAGTAACGGGAGAACAACAAGGAAGCATCTCCGCAGGTTGTGGGACTTCTGAGTCTACAGGTAATCGTTGGCAGAGCGGGCATGAGGATGAAATATTTACATTCTCACTCTTAAATAATATTAATAATACGGGGCTTGGTTCACAGTTCCATGGTATAACATTTTGTAAATTAATTGATAAAAGCACTCCATTATTTATTAATTCCATTAACAATAATGAACAATTATTTATGGGATTTGACt < 1:49190/300‑1 (MQ=255) aTAAAATAGCATGCCATAAAAAGACTTTTCAGGGATGAGTAATATTGTTTACCTGACAGTAACGGGAGAACAACAAGGAAGCATCTACGCAGGTTGTGGGACTTCTGAGTCTACAGGTAATCGTTGGCAGAGCGGGCATGAGGATGAAATATTTACATTCTCACTCTTAAATAATATTAATAATACGGGGCTTGGTTCACAGTTCCATGGTATAACATTTTGTAAATTAATTGATAAAAGCACTCCATTATTTATTAATTCCATTAACAATAACGAACAATTATTTATGGGGTTTGACtt > 2:183481/1‑300 (MQ=255) gCCATAAAAAGACTTTTCAGGGATGAGTAATATTGTTTACCTGACAGTAACGGGAGAACAACAAGGAAGCATCTCCGCAGGTTGTGGGACTTCTGAGTCTACAGGTAATCGTTGGCAGAGCGGGCATGAGGATGAAATATTTACATTCTCACTCTTAAATAATATTAATAATACGGGGCTTGGTTCACAGTTCCATGGTATAACATTTTGTAAATTAATTGATAAAAGCACTCCATTATTTATTAATTCCATTAACAATAATGAACAATTATTTATGGGATTTGACTTCTATCGaataaa > 1:94848/1‑300 (MQ=255) | GGTAAGAAGTACGCATTGCGTAATGGTGAATATGTCGATGCATATTATATGGCGCGGGTGAAGTAAGATAGTGCCCTTTTTCTGAGATGGAAAAAGGGTGTCATTCAAAATCGACATACCTTCCTTTAAGGTATTTATTTGCCCAATACATATATTGAGATTTAACTCATAATTACTTCCTAAAGTGTAATATTTTATTTTTTAATATATACGCCTACAATTTCCTGGAGTAAATAAATAACAATTAACAAGCATAATATTGCCATTGATAAAATAGCATGCCATAAAAGGACTTTTCAGGGATGAGTAATATTGTTTACCTGACAGTAACGGGAGAACAACAAGGAAGCATCTCCGCAGGTTGTGGGACTTCTGAGTCTACAGGTAATCGTTGGCAGAGCGGGCATGAGGATGAAATATTTACATTCTCACTCTTAAATAATATTAATAATACGGGGCTTGGTTCACAGTTCCATGGTATAACATTTTGTAAATTAATTGATAAAAGCACTCCATTATTTATTAATTCCATTAACAATAATGAACAATTATTTATGGGATTTGACTTCTATCGAATAAA > NC_000913/3581561‑3582140 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |